33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1207 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3150  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0726383  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1207  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1162  hypothetical protein  99.63 
 
 
267 aa  544  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248811  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1240  hypothetical protein  99.25 
 
 
267 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.507708  normal  0.366095 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2890  hypothetical protein  87.69 
 
 
268 aa  471  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00504081  hitchhiker  0.00000102204 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3068  hypothetical protein  87.31 
 
 
268 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.175879  hitchhiker  0.000000207541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2972  hypothetical protein  86.94 
 
 
268 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  unclonable  0.0000399933 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1303  hypothetical protein  85.07 
 
 
268 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1122  hypothetical protein  87.31 
 
 
268 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0984  hypothetical protein  55.43 
 
 
267 aa  301  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0842  hypothetical protein  55.22 
 
 
267 aa  287  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.635003 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1016  hypothetical protein  48.69 
 
 
305 aa  286  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186847  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1094  hypothetical protein  53.06 
 
 
279 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00105503  decreased coverage  0.00393071 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2977  hypothetical protein  53.52 
 
 
257 aa  265  5e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2816  hypothetical protein  48.63 
 
 
263 aa  251  7e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0130714  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1202  hypothetical protein  50.42 
 
 
301 aa  247  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.61051  hitchhiker  0.0000275192 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4623  hypothetical protein  32.7 
 
 
201 aa  102  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2410  hypothetical protein  29.21 
 
 
242 aa  82.8  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.193913  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01600  hypothetical protein  26.54 
 
 
243 aa  77  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0545  hypothetical protein  29.7 
 
 
232 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1046  hypothetical protein  28.97 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0509455  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0692  hypothetical protein  28.57 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643015  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3703  hypothetical protein  28.21 
 
 
247 aa  70.5  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02946  hypothetical protein  28.47 
 
 
256 aa  64.7  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.860182  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0834  hypothetical protein  23.74 
 
 
246 aa  64.3  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000087146  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1765  hypothetical protein  27.75 
 
 
258 aa  63.9  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.599639  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1832  hypothetical protein  27.75 
 
 
258 aa  63.9  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3932  hypothetical protein  27.32 
 
 
241 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347315  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0058  hypothetical protein  27.14 
 
 
249 aa  56.2  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0538272  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4051  hypothetical protein  22.5 
 
 
236 aa  50.1  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578811 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0383  hypothetical protein  23.73 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216107  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0368  hypothetical protein  21.97 
 
 
251 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0593824  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3450  hypothetical protein  24.54 
 
 
237 aa  43.1  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01546 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>