33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1094 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1094  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  566  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00105503  decreased coverage  0.00393071 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1202  hypothetical protein  62.22 
 
 		 301 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.61051  hitchhiker  0.0000275192 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0984  hypothetical protein  61.02 
 
 		 267 aa  315  6e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1016  hypothetical protein  53.41 
 
 		 305 aa  293  3e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1240  hypothetical protein  53.47 
 
 		 267 aa  258  7e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.507708  normal  0.366095 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1162  hypothetical protein  53.06 
 
 		 267 aa  258  9e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248811  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3150  hypothetical protein  53.06 
 
 		 267 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0726383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1207  hypothetical protein  53.06 
 
 		 267 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2972  hypothetical protein  53.06 
 
 		 268 aa  256  3e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  unclonable  0.0000399933 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2890  hypothetical protein  53.06 
 
 		 268 aa  255  7e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00504081  hitchhiker  0.00000102204 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3068  hypothetical protein  52.65 
 
 		 268 aa  253  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.175879  hitchhiker  0.000000207541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1303  hypothetical protein  51.02 
 
 		 268 aa  246  4e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0842  hypothetical protein  50.21 
 
 		 267 aa  233  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.635003 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1122  hypothetical protein  52.24 
 
 		 268 aa  227  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2816  hypothetical protein  45.8 
 
 		 263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0130714  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2977  hypothetical protein  45.34 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4623  hypothetical protein  32.8 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0545  hypothetical protein  31.48 
 
 		 232 aa  94.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0692  hypothetical protein  26.72 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643015  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2410  hypothetical protein  25 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.193913  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3932  hypothetical protein  26.07 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0834  hypothetical protein  25.26 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000087146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01600  hypothetical protein  27.36 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1046  hypothetical protein  25.12 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0509455  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0058  hypothetical protein  26.52 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0538272  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08490  hypothetical protein  22.84 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000239423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0804  hypothetical protein  23.44 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164098  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02946  hypothetical protein  24.65 
 
 		 256 aa  49.3  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.860182  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3703  hypothetical protein  21.88 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0558  hypothetical protein  24.53 
 
 		 258 aa  46.2  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0522955  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1832  hypothetical protein  23.25 
 
 		 258 aa  46.6  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4051  hypothetical protein  22.05 
 
 		 236 aa  46.2  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578811 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1765  hypothetical protein  22.75 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.599639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>