33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1832 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1832  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  524  1e-148  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1765  hypothetical protein  99.22 
 
 		 258 aa  520  1e-146  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.599639  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02946  hypothetical protein  66.37 
 
 		 256 aa  295  6e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.860182  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3703  hypothetical protein  55.7 
 
 		 247 aa  261  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0692  hypothetical protein  27.27 
 
 		 246 aa  85.1  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643015  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1016  hypothetical protein  29.63 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2410  hypothetical protein  27.35 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.193913  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1046  hypothetical protein  28.95 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0509455  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0834  hypothetical protein  24.35 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000087146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3932  hypothetical protein  26.24 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347315  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4623  hypothetical protein  28.77 
 
 		 201 aa  68.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0842  hypothetical protein  26.15 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.635003 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0984  hypothetical protein  26.99 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1162  hypothetical protein  28.06 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248811  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3150  hypothetical protein  28.06 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0726383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1207  hypothetical protein  28.06 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1240  hypothetical protein  28.06 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.507708  normal  0.366095 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1122  hypothetical protein  28.98 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3068  hypothetical protein  26.82 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.175879  hitchhiker  0.000000207541 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2890  hypothetical protein  26.36 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00504081  hitchhiker  0.00000102204 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2972  hypothetical protein  25.91 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  unclonable  0.0000399933 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2816  hypothetical protein  26.32 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0130714  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1303  hypothetical protein  24.77 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0058  hypothetical protein  28.31 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0538272  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2977  hypothetical protein  24 
 
 		 257 aa  52  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0412  hypothetical protein  25.68 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000410043  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01600  hypothetical protein  21.78 
 
 		 243 aa  50.4  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08490  hypothetical protein  21.76 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000239423 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1094  hypothetical protein  23.25 
 
 		 279 aa  46.6  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00105503  decreased coverage  0.00393071 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0804  hypothetical protein  21.7 
 
 		 239 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164098  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1202  hypothetical protein  26.6 
 
 		 301 aa  45.8  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.61051  hitchhiker  0.0000275192 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0545  hypothetical protein  25.14 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0558  hypothetical protein  21.78 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0522955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>