29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2977 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2977  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  520  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2816  hypothetical protein  57.03 
 
 		 263 aa  295  5e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0130714  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3150  hypothetical protein  53.52 
 
 		 267 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0726383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1207  hypothetical protein  53.52 
 
 		 267 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1162  hypothetical protein  53.52 
 
 		 267 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248811  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1240  hypothetical protein  53.12 
 
 		 267 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.507708  normal  0.366095 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2890  hypothetical protein  51.56 
 
 		 268 aa  256  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00504081  hitchhiker  0.00000102204 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2972  hypothetical protein  51.56 
 
 		 268 aa  256  3e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  unclonable  0.0000399933 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3068  hypothetical protein  51.17 
 
 		 268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.175879  hitchhiker  0.000000207541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1303  hypothetical protein  50.78 
 
 		 268 aa  249  3e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1016  hypothetical protein  43.73 
 
 		 305 aa  231  9e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1122  hypothetical protein  51.72 
 
 		 268 aa  229  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0984  hypothetical protein  45.14 
 
 		 267 aa  229  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1094  hypothetical protein  45.34 
 
 		 279 aa  219  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00105503  decreased coverage  0.00393071 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0842  hypothetical protein  45.91 
 
 		 267 aa  215  5e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.635003 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1202  hypothetical protein  43.93 
 
 		 301 aa  208  8e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.61051  hitchhiker  0.0000275192 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0545  hypothetical protein  27.59 
 
 		 232 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4623  hypothetical protein  25.58 
 
 		 201 aa  68.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01600  hypothetical protein  26.94 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3703  hypothetical protein  25.55 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0692  hypothetical protein  27.74 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643015  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2410  hypothetical protein  24.5 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.193913  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0834  hypothetical protein  28.74 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000087146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0058  hypothetical protein  24.48 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0538272  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1046  hypothetical protein  28.76 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0509455  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02946  hypothetical protein  25.93 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.860182  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1832  hypothetical protein  24 
 
 		 258 aa  52  0.000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1765  hypothetical protein  24 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.599639  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3932  hypothetical protein  22.86 
 
 		 241 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347315  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>