34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2890 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3068  hypothetical protein  99.63 
 
 		 268 aa  550  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.175879  hitchhiker  0.000000207541 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2890  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  551  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00504081  hitchhiker  0.00000102204 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2972  hypothetical protein  99.25 
 
 		 268 aa  547  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  unclonable  0.0000399933 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1303  hypothetical protein  95.52 
 
 		 268 aa  510  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1240  hypothetical protein  88.06 
 
 		 267 aa  474  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.507708  normal  0.366095 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1162  hypothetical protein  87.69 
 
 		 267 aa  474  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248811  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3150  hypothetical protein  87.69 
 
 		 267 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0726383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1207  hypothetical protein  87.69 
 
 		 267 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1122  hypothetical protein  88.06 
 
 		 268 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0984  hypothetical protein  54.48 
 
 		 267 aa  296  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0842  hypothetical protein  53.53 
 
 		 267 aa  290  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.635003 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1016  hypothetical protein  47.06 
 
 		 305 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1094  hypothetical protein  53.06 
 
 		 279 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00105503  decreased coverage  0.00393071 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2977  hypothetical protein  51.56 
 
 		 257 aa  264  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2816  hypothetical protein  50 
 
 		 263 aa  259  3e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0130714  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1202  hypothetical protein  52.72 
 
 		 301 aa  251  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.61051  hitchhiker  0.0000275192 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4623  hypothetical protein  31.03 
 
 		 201 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2410  hypothetical protein  31.14 
 
 		 242 aa  92.4  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.193913  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0692  hypothetical protein  24.07 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643015  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1046  hypothetical protein  26.29 
 
 		 240 aa  75.1  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0509455  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3703  hypothetical protein  30.2 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01600  hypothetical protein  24.77 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0545  hypothetical protein  25.5 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3932  hypothetical protein  26.63 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0834  hypothetical protein  24.32 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000087146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02946  hypothetical protein  28.47 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.860182  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1832  hypothetical protein  26.64 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1765  hypothetical protein  26.72 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.599639  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0058  hypothetical protein  24.1 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0538272  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0383  hypothetical protein  25 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4051  hypothetical protein  22.78 
 
 		 236 aa  47  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578811 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0368  hypothetical protein  24.26 
 
 		 251 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0593824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0558  hypothetical protein  23.33 
 
 		 258 aa  43.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0522955  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3450  hypothetical protein  27.5 
 
 		 237 aa  42.4  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01546 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>