35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0984 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0984  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  541  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1016  hypothetical protein  54.1 
 
 		 305 aa  316  2e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1094  hypothetical protein  61.02 
 
 		 279 aa  315  6e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00105503  decreased coverage  0.00393071 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1202  hypothetical protein  61.76 
 
 		 301 aa  299  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.61051  hitchhiker  0.0000275192 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1162  hypothetical protein  55.43 
 
 		 267 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248811  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3150  hypothetical protein  55.43 
 
 		 267 aa  289  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0726383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1240  hypothetical protein  55.06 
 
 		 267 aa  289  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.507708  normal  0.366095 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1207  hypothetical protein  55.43 
 
 		 267 aa  289  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2972  hypothetical protein  54.48 
 
 		 268 aa  284  9e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  unclonable  0.0000399933 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2890  hypothetical protein  54.48 
 
 		 268 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00504081  hitchhiker  0.00000102204 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3068  hypothetical protein  54.1 
 
 		 268 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.175879  hitchhiker  0.000000207541 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0842  hypothetical protein  53.56 
 
 		 267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.635003 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1303  hypothetical protein  52.24 
 
 		 268 aa  273  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1122  hypothetical protein  53.36 
 
 		 268 aa  249  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2816  hypothetical protein  46.88 
 
 		 263 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0130714  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2977  hypothetical protein  45.14 
 
 		 257 aa  229  4e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4623  hypothetical protein  35.75 
 
 		 201 aa  112  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0692  hypothetical protein  29.84 
 
 		 246 aa  92.8  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643015  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0545  hypothetical protein  34.34 
 
 		 232 aa  90.5  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3932  hypothetical protein  29.67 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2410  hypothetical protein  29.38 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.193913  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1046  hypothetical protein  27.62 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0509455  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1765  hypothetical protein  27.43 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.599639  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0834  hypothetical protein  26.96 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000087146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1832  hypothetical protein  26.99 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3703  hypothetical protein  26.42 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01600  hypothetical protein  27.86 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0058  hypothetical protein  30.37 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0538272  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02946  hypothetical protein  26.67 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.860182  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08490  hypothetical protein  30 
 
 		 239 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000239423 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4051  hypothetical protein  27.94 
 
 		 236 aa  52  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578811 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0804  hypothetical protein  23.74 
 
 		 239 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164098  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0412  hypothetical protein  20.31 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000410043  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0723  hypothetical protein  24.68 
 
 		 242 aa  46.2  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0558  hypothetical protein  21.37 
 
 		 258 aa  43.5  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0522955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>