18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0804 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0804  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08490  hypothetical protein  90.38 
 
 
239 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000239423 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3932  hypothetical protein  48.52 
 
 
241 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347315  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0692  hypothetical protein  27.44 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643015  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0834  hypothetical protein  27.16 
 
 
246 aa  71.6  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000087146  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2816  hypothetical protein  27.27 
 
 
263 aa  55.5  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0130714  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3703  hypothetical protein  24.31 
 
 
247 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1202  hypothetical protein  29.01 
 
 
301 aa  52  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.61051  hitchhiker  0.0000275192 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4623  hypothetical protein  24.87 
 
 
201 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1094  hypothetical protein  23.44 
 
 
279 aa  51.2  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00105503  decreased coverage  0.00393071 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0984  hypothetical protein  23.74 
 
 
267 aa  49.7  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02946  hypothetical protein  25.52 
 
 
256 aa  49.3  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.860182  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0545  hypothetical protein  25.74 
 
 
232 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1016  hypothetical protein  27.4 
 
 
305 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186847  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0842  hypothetical protein  28.03 
 
 
267 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.635003 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1832  hypothetical protein  21.7 
 
 
258 aa  46.6  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2410  hypothetical protein  22.52 
 
 
242 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.193913  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1765  hypothetical protein  21.23 
 
 
258 aa  43.1  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.599639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>