33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1765 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1765  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  525  1e-148  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.599639  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1832  hypothetical protein  99.22 
 
 
258 aa  520  1e-146  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02946  hypothetical protein  66.37 
 
 
256 aa  298  8e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.860182  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3703  hypothetical protein  55.04 
 
 
247 aa  258  7e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0692  hypothetical protein  27.27 
 
 
246 aa  85.5  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643015  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1016  hypothetical protein  29.63 
 
 
305 aa  84  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186847  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2410  hypothetical protein  28.8 
 
 
242 aa  75.5  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.193913  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1046  hypothetical protein  27.39 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0509455  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0834  hypothetical protein  24.35 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000087146  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3932  hypothetical protein  25.57 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347315  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0984  hypothetical protein  27.43 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4623  hypothetical protein  28.77 
 
 
201 aa  68.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0842  hypothetical protein  26.15 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.635003 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3150  hypothetical protein  28.06 
 
 
267 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0726383  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1207  hypothetical protein  28.06 
 
 
267 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1162  hypothetical protein  28.06 
 
 
267 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248811  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1240  hypothetical protein  28.06 
 
 
267 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.507708  normal  0.366095 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1122  hypothetical protein  28.98 
 
 
268 aa  60.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2890  hypothetical protein  26.46 
 
 
268 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00504081  hitchhiker  0.00000102204 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3068  hypothetical protein  26.91 
 
 
268 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.175879  hitchhiker  0.000000207541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2972  hypothetical protein  26.01 
 
 
268 aa  58.9  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  unclonable  0.0000399933 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1303  hypothetical protein  25.34 
 
 
268 aa  56.2  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0058  hypothetical protein  28.31 
 
 
249 aa  55.5  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0538272  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2816  hypothetical protein  25.88 
 
 
263 aa  54.3  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0130714  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0412  hypothetical protein  25.68 
 
 
251 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000410043  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2977  hypothetical protein  24 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01600  hypothetical protein  23.08 
 
 
243 aa  49.7  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1202  hypothetical protein  25.85 
 
 
301 aa  45.8  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.61051  hitchhiker  0.0000275192 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0545  hypothetical protein  25.14 
 
 
232 aa  45.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1094  hypothetical protein  22.75 
 
 
279 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00105503  decreased coverage  0.00393071 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0558  hypothetical protein  21.78 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0522955  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08490  hypothetical protein  21.62 
 
 
239 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000239423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0804  hypothetical protein  21.23 
 
 
239 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>