243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3360 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03841  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.76 
 
 		 883 aa  947    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4030  Phosphoenolpyruvate carboxylase  55.76 
 
 		 883 aa  947    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1505  phosphoenolpyruvate carboxylase  80.41 
 
 		 875 aa  1360    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3928  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.12 
 
 		 879 aa  912    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4190  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.76 
 
 		 883 aa  947    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0274  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.97 
 
 		 881 aa  956    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1508  phosphoenolpyruvate carboxylase  82 
 
 		 878 aa  1387    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4214  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.85 
 
 		 889 aa  950    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4217  phosphoenolpyruvate carboxylase  80.3 
 
 		 875 aa  1357    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638207  normal  0.736372 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4450  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.91 
 
 		 883 aa  959    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0357723 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1318  phosphoenolpyruvate carboxylase  82.35 
 
 		 878 aa  1394    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0969534  hitchhiker  0.00571873 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4403  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.64 
 
 		 883 aa  944    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.494951 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4495  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.76 
 
 		 883 aa  947    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305581  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0190  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.31 
 
 		 880 aa  945    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0225  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.43 
 
 		 878 aa  923    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5416  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.64 
 
 		 883 aa  946    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3900  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.78 
 
 		 898 aa  942    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  80.41 
 
 		 876 aa  1353    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0757254 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39300  phosphoenolpyruvate carboxylase  79.5 
 
 		 878 aa  1325    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27976  predicted protein  44.05 
 
 		 1009 aa  662    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.205513  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4360  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.91 
 
 		 912 aa  956    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4783  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.01 
 
 		 878 aa  952    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.380349  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4278  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.98 
 
 		 878 aa  911    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.419374 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3380  phosphoenolpyruvate carboxylase  52.1 
 
 		 873 aa  830    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000188284  normal  0.443016 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4329  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.79 
 
 		 883 aa  956    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4447  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.91 
 
 		 883 aa  959    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169419 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0248  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.27 
 
 		 887 aa  921    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1640  phosphoenolpyruvate carboxylase  60.52 
 
 		 883 aa  952    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00188681  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00045  phosphoenolpyruvate carboxylase  54.66 
 
 		 888 aa  917    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4015  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.97 
 
 		 889 aa  954    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.265986 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_51136  predicted protein  43.5 
 
 		 877 aa  637    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00742  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.71 
 
 		 873 aa  869    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00719358  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0606  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.37 
 
 		 872 aa  868    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00195008  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1255  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.16 
 
 		 876 aa  969    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0155098  normal  0.99385 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0994  phosphoenolpyruvate carboxylase  52.21 
 
 		 879 aa  891    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2754  phosphoenolpyruvate carboxylase  53.52 
 
 		 876 aa  907    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3710  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.74 
 
 		 889 aa  946    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0235  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.74 
 
 		 889 aa  946    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.859727 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0261  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.97 
 
 		 882 aa  884    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0189  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.56 
 
 		 882 aa  934    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000683526  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4442  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.76 
 
 		 883 aa  947    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16690  phosphoenolpyruvate carboxylase  79.38 
 
 		 878 aa  1332    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4096  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.97 
 
 		 889 aa  954    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0327  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.5 
 
 		 878 aa  944    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.95477 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3906  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.74 
 
 		 889 aa  948    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1451  phosphoenolpyruvate carboxylase  78.82 
 
 		 878 aa  1323    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.4068  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0125  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.78 
 
 		 878 aa  941    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0254  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.11 
 
 		 887 aa  941    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.974753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4350  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.08 
 
 		 879 aa  945    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0226  phosphoenolpyruvate carboxylase  54.13 
 
 		 878 aa  910    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2234  phosphoenolpyruvate carboxylase  60.2 
 
 		 881 aa  979    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03790  hypothetical protein  55.76 
 
 		 883 aa  947    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4112  phosphoenolpyruvate carboxylase  79.5 
 
 		 875 aa  1345    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.685624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4065  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.08 
 
 		 879 aa  948    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2291  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.08 
 
 		 883 aa  819    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002310  phosphoenolpyruvate carboxylase  54.55 
 
 		 877 aa  918    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4125  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.97 
 
 		 889 aa  954    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4091  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.78 
 
 		 878 aa  941    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4060  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.76 
 
 		 883 aa  947    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1110  phosphoenolpyruvate carboxylase  80.52 
 
 		 875 aa  1360    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0200  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.43 
 
 		 878 aa  917    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.611049  normal  0.122744 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4524  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.91 
 
 		 883 aa  959    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189502 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51006  predicted protein  40.8 
 
 		 1007 aa  642    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.381291  normal  0.0264006 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4030  phosphoenolpyruvate carboxylase  54.63 
 
 		 883 aa  932    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.366538 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3718  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.97 
 
 		 889 aa  954    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.910029  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3360  phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 		 878 aa  1738    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2222  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.29 
 
 		 887 aa  924    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000647926  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.54 
 
 		 952 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.5 
 
 		 929 aa  491  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.38 
 
 		 920 aa  479  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.46 
 
 		 906 aa  478  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.6 
 
 		 928 aa  477  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.82 
 
 		 938 aa  479  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.67 
 
 		 931 aa  474  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.9 
 
 		 929 aa  472  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6583  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.85 
 
 		 981 aa  470  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.800439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0994  Phosphoenolpyruvate carboxylase  39.08 
 
 		 892 aa  470  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.43848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.44 
 
 		 933 aa  467  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.43 
 
 		 933 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5805  Phosphoenolpyruvate carboxylase  39 
 
 		 914 aa  464  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.454197 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0770  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.72 
 
 		 957 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.815806  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1521  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.19 
 
 		 929 aa  460  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07300  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.02 
 
 		 942 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.19 
 
 		 926 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0614  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.91 
 
 		 954 aa  456  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1661  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.32 
 
 		 938 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4447  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.91 
 
 		 945 aa  452  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.5 
 
 		 929 aa  451  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0883  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.47 
 
 		 972 aa  449  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.3209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.99 
 
 		 933 aa  449  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.93 
 
 		 928 aa  445  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2367  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.3 
 
 		 945 aa  445  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.22 
 
 		 936 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17821  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.95 
 
 		 989 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17661  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.79 
 
 		 989 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0699  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.46 
 
 		 1006 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.2 
 
 		 937 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0742  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.48 
 
 		 937 aa  442  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0178  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.99 
 
 		 940 aa  440  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0875  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36 
 
 		 947 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.127499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>