244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_51136 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_27976  predicted protein  46.34 
 
 		 1009 aa  742    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.205513  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_51136  predicted protein  100 
 
 		 877 aa  1808    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3360  phosphoenolpyruvate carboxylase  43.86 
 
 		 878 aa  633  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1318  phosphoenolpyruvate carboxylase  43.74 
 
 		 878 aa  624  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0969534  hitchhiker  0.00571873 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0261  phosphoenolpyruvate carboxylase  42.56 
 
 		 882 aa  622  1e-177  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002310  phosphoenolpyruvate carboxylase  41.75 
 
 		 877 aa  624  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4065  phosphoenolpyruvate carboxylase  42.5 
 
 		 879 aa  625  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1508  phosphoenolpyruvate carboxylase  43.59 
 
 		 878 aa  621  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0254  phosphoenolpyruvate carboxylase  41.8 
 
 		 887 aa  619  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.974753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4350  phosphoenolpyruvate carboxylase  42.27 
 
 		 879 aa  619  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2222  phosphoenolpyruvate carboxylase  41.36 
 
 		 887 aa  615  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000647926  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00045  phosphoenolpyruvate carboxylase  41.07 
 
 		 888 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4278  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.55 
 
 		 878 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.419374 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1451  phosphoenolpyruvate carboxylase  42.47 
 
 		 878 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.4068  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0226  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.27 
 
 		 878 aa  615  9.999999999999999e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2291  phosphoenolpyruvate carboxylase  41.32 
 
 		 883 aa  614  9.999999999999999e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0200  phosphoenolpyruvate carboxylase  41.25 
 
 		 878 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.611049  normal  0.122744 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  42.66 
 
 		 876 aa  612  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0757254 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3928  phosphoenolpyruvate carboxylase  41.52 
 
 		 879 aa  609  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0248  phosphoenolpyruvate carboxylase  41.16 
 
 		 887 aa  609  1e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0327  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.93 
 
 		 878 aa  610  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.95477 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0189  phosphoenolpyruvate carboxylase  41.04 
 
 		 882 aa  611  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000683526  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3906  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.89 
 
 		 889 aa  611  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0190  phosphoenolpyruvate carboxylase  41.98 
 
 		 880 aa  611  1e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2234  phosphoenolpyruvate carboxylase  41.12 
 
 		 881 aa  610  1e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4125  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.66 
 
 		 889 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4360  phosphoenolpyruvate carboxylase  41.27 
 
 		 912 aa  608  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0274  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.89 
 
 		 881 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4524  phosphoenolpyruvate carboxylase  41.16 
 
 		 883 aa  608  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189502 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4214  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.55 
 
 		 889 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4447  phosphoenolpyruvate carboxylase  41.16 
 
 		 883 aa  608  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169419 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39300  phosphoenolpyruvate carboxylase  42.29 
 
 		 878 aa  606  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4450  phosphoenolpyruvate carboxylase  41.16 
 
 		 883 aa  608  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0357723 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4015  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.66 
 
 		 889 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.265986 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1255  phosphoenolpyruvate carboxylase  41.16 
 
 		 876 aa  606  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0155098  normal  0.99385 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3710  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.66 
 
 		 889 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0235  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.66 
 
 		 889 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.859727 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4329  phosphoenolpyruvate carboxylase  41.04 
 
 		 883 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4096  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.66 
 
 		 889 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3718  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.5 
 
 		 889 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.910029  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16690  phosphoenolpyruvate carboxylase  42.02 
 
 		 878 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0225  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.93 
 
 		 878 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4030  phosphoenolpyruvate carboxylase  41 
 
 		 883 aa  605  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.366538 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4217  phosphoenolpyruvate carboxylase  42.53 
 
 		 875 aa  601  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638207  normal  0.736372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1110  phosphoenolpyruvate carboxylase  42.53 
 
 		 875 aa  602  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4783  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.32 
 
 		 878 aa  602  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.380349  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4112  phosphoenolpyruvate carboxylase  42.3 
 
 		 875 aa  601  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.685624  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03841  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.8 
 
 		 883 aa  598  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4030  Phosphoenolpyruvate carboxylase  40.8 
 
 		 883 aa  598  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1505  phosphoenolpyruvate carboxylase  42.42 
 
 		 875 aa  598  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4403  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.8 
 
 		 883 aa  598  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.494951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5416  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.8 
 
 		 883 aa  597  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4060  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.8 
 
 		 883 aa  598  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4495  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.8 
 
 		 883 aa  598  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305581  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03790  hypothetical protein  40.8 
 
 		 883 aa  598  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2754  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.59 
 
 		 876 aa  598  1e-169  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4190  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.8 
 
 		 883 aa  598  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4442  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.8 
 
 		 883 aa  598  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51006  predicted protein  38.49 
 
 		 1007 aa  596  1e-169  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.381291  normal  0.0264006 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0125  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.16 
 
 		 878 aa  594  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4091  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.16 
 
 		 878 aa  594  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3900  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.16 
 
 		 898 aa  594  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0994  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.55 
 
 		 879 aa  588  1e-166  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3380  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.98 
 
 		 873 aa  584  1.0000000000000001e-165  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000188284  normal  0.443016 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1640  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.45 
 
 		 883 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00188681  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00742  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.35 
 
 		 873 aa  561  1e-158  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00719358  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0606  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.79 
 
 		 872 aa  552  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00195008  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.89 
 
 		 906 aa  429  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  32.86 
 
 		 933 aa  418  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  32.09 
 
 		 931 aa  415  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.76 
 
 		 952 aa  415  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.67 
 
 		 929 aa  411  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0396  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.6 
 
 		 997 aa  410  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411219  normal  0.654727 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2220  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.68 
 
 		 1018 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0767995 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.04 
 
 		 920 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1667  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.87 
 
 		 989 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16951  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.1 
 
 		 1007 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17821  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.5 
 
 		 989 aa  405  1e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1147  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.74 
 
 		 994 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1933  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.09 
 
 		 995 aa  401  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.79 
 
 		 938 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0994  Phosphoenolpyruvate carboxylase  32.28 
 
 		 892 aa  400  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.43848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20211  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.74 
 
 		 994 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17661  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.5 
 
 		 989 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2134  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.84 
 
 		 1023 aa  398  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1653  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.67 
 
 		 892 aa  399  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0256628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17621  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.26 
 
 		 989 aa  398  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22741  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.77 
 
 		 1002 aa  396  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.114136 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0742  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.67 
 
 		 937 aa  391  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2367  Phosphoenolpyruvate carboxylase  31.66 
 
 		 945 aa  392  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0614  phosphoenolpyruvate carboxylase  34 
 
 		 954 aa  392  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3372  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.63 
 
 		 954 aa  387  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.16897  normal  0.0169506 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2647  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.43 
 
 		 1024 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.261414  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1696  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.45 
 
 		 1017 aa  387  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3469  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.43 
 
 		 1024 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.13 
 
 		 985 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0998  Phosphoenolpyruvate carboxylase  31.66 
 
 		 938 aa  384  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.5 
 
 		 946 aa  386  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4238  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.93 
 
 		 1021 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.5 
 
 		 946 aa  386  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>