243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1653 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1653  Phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 		 892 aa  1777    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0256628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0994  Phosphoenolpyruvate carboxylase  71 
 
 		 892 aa  1261    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.43848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0661  phosphoenolpyruvate carboxylase  44.93 
 
 		 831 aa  575  1.0000000000000001e-163  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1661  Phosphoenolpyruvate carboxylase  40.99 
 
 		 938 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.74 
 
 		 929 aa  536  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.31 
 
 		 933 aa  526  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4721  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.16 
 
 		 896 aa  518  1.0000000000000001e-145  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.61 
 
 		 952 aa  514  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.11 
 
 		 931 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.1 
 
 		 906 aa  505  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0472  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.68 
 
 		 898 aa  499  1e-140  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4375  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.41 
 
 		 896 aa  499  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0553395  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2494  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.05 
 
 		 897 aa  489  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.95 
 
 		 938 aa  488  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2311  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.46 
 
 		 900 aa  476  1e-133  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.900921 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.21 
 
 		 1002 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.49 
 
 		 946 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2522  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.72 
 
 		 898 aa  459  1e-127  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314131  normal  0.688456 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.49 
 
 		 946 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.49 
 
 		 946 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0770  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.13 
 
 		 957 aa  455  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.815806  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.14 
 
 		 1001 aa  456  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1468  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.1 
 
 		 898 aa  449  1e-125  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.46 
 
 		 937 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.84 
 
 		 929 aa  449  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2707  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.82 
 
 		 936 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136783 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.4 
 
 		 933 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3706  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.17 
 
 		 937 aa  445  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.625576  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  36 
 
 		 985 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4015  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.85 
 
 		 889 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.265986 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2699  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.17 
 
 		 915 aa  442  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4214  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.96 
 
 		 889 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0261  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.89 
 
 		 882 aa  439  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.15 
 
 		 926 aa  440  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4096  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.85 
 
 		 889 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3906  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.92 
 
 		 889 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2121  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.5 
 
 		 946 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.180736 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2367  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.43 
 
 		 945 aa  437  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1521  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.55 
 
 		 929 aa  437  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0235  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.29 
 
 		 889 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.859727 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4125  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.64 
 
 		 889 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3718  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.64 
 
 		 889 aa  437  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.910029  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0274  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.92 
 
 		 881 aa  434  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.39 
 
 		 939 aa  434  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0875  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.83 
 
 		 947 aa  436  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.127499  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.61 
 
 		 929 aa  433  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3710  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.81 
 
 		 889 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.84 
 
 		 928 aa  432  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2536  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.48 
 
 		 921 aa  430  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366441  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.46 
 
 		 928 aa  432  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2234  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.84 
 
 		 881 aa  432  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1041  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.15 
 
 		 930 aa  431  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4238  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.3 
 
 		 1021 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2220  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.93 
 
 		 1018 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0767995 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.78 
 
 		 933 aa  429  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.55 
 
 		 936 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2000  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.79 
 
 		 951 aa  426  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277994  decreased coverage  0.000144828 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1883  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.75 
 
 		 929 aa  426  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0248  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.69 
 
 		 887 aa  424  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1819  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.69 
 
 		 923 aa  423  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218615 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1558  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.75 
 
 		 929 aa  426  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0614036  unclonable  0.000000000174255 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0138  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.65 
 
 		 932 aa  426  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.497432 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2233  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.37 
 
 		 949 aa  423  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380618  normal  0.0228414 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04694  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.86 
 
 		 896 aa  420  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.510612  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0327  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.74 
 
 		 878 aa  421  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.95477 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2291  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.12 
 
 		 883 aa  421  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.85 
 
 		 920 aa  417  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.21 
 
 		 918 aa  416  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.52 
 
 		 876 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0757254 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3412  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.95 
 
 		 994 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4278  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.42 
 
 		 878 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.419374 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2647  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.65 
 
 		 1024 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.261414  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3469  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.65 
 
 		 1024 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1933  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.69 
 
 		 995 aa  415  1e-114  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0396  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.77 
 
 		 997 aa  415  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411219  normal  0.654727 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0998  Phosphoenolpyruvate carboxylase  32.67 
 
 		 938 aa  416  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0614  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.03 
 
 		 954 aa  415  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0254  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.44 
 
 		 887 aa  415  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.974753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2180  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.42 
 
 		 1030 aa  416  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235371  hitchhiker  0.000906218 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0200  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.2 
 
 		 878 aa  413  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.611049  normal  0.122744 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2376  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.52 
 
 		 949 aa  411  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2134  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.68 
 
 		 1023 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0841  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.18 
 
 		 939 aa  410  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2252  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.54 
 
 		 1017 aa  412  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0123033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3665  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.27 
 
 		 970 aa  412  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3091  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.14 
 
 		 982 aa  412  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2889  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.41 
 
 		 949 aa  410  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.695135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1373  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.26 
 
 		 947 aa  412  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333226  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0763  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.4 
 
 		 950 aa  410  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000509332 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3360  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.56 
 
 		 878 aa  411  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30020  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.14 
 
 		 900 aa  409  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3418  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.8 
 
 		 881 aa  407  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0189  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.46 
 
 		 882 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000683526  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1068  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.49 
 
 		 1075 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0225  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.81 
 
 		 878 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07300  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.07 
 
 		 942 aa  404  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0397  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.81 
 
 		 915 aa  403  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0226  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.21 
 
 		 878 aa  404  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22741  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.96 
 
 		 1002 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.114136 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3806  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.3 
 
 		 907 aa  404  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.589788  normal  0.171928 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>