240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2000 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0763  phosphoenolpyruvate carboxylase  69.36 
 
 
950 aa  1279    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000509332 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  58.89 
 
 
985 aa  1055    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1373  phosphoenolpyruvate carboxylase  74.37 
 
 
947 aa  1342    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333226  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0729  phosphoenolpyruvate carboxylase  61.77 
 
 
994 aa  1085    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3135  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.34 
 
 
929 aa  721    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.365231  normal  0.570221 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0868  phosphoenolpyruvate carboxylase  61.67 
 
 
1004 aa  1067    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  53.54 
 
 
918 aa  872    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  54.14 
 
 
926 aa  892    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0841  Phosphoenolpyruvate carboxylase  50.91 
 
 
939 aa  714    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0699  phosphoenolpyruvate carboxylase  58.26 
 
 
1006 aa  1048    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  53.48 
 
 
928 aa  909    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1228  phosphoenolpyruvate carboxylase  61.67 
 
 
1085 aa  1081    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.774396  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2335  phosphoenolpyruvate carboxylase  61.51 
 
 
998 aa  1065    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.361608 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5753  phosphoenolpyruvate carboxylase  62.36 
 
 
1008 aa  1073    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.61686  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  52.4 
 
 
937 aa  882    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0871  phosphoenolpyruvate carboxylase  61.59 
 
 
1088 aa  1069    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  53.2 
 
 
933 aa  904    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1714  phosphoenolpyruvate carboxylase  76.12 
 
 
957 aa  1384    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.686661  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2430  phosphoenolpyruvate carboxylase  60.92 
 
 
1009 aa  1066    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76585  normal  0.238617 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  53.36 
 
 
929 aa  905    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3665  phosphoenolpyruvate carboxylase  80.61 
 
 
970 aa  1496    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3412  phosphoenolpyruvate carboxylase  61.31 
 
 
994 aa  1067    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  52.94 
 
 
933 aa  891    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2180  phosphoenolpyruvate carboxylase  60.86 
 
 
1030 aa  1049    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235371  hitchhiker  0.000906218 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  53.8 
 
 
929 aa  912    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2750  phosphoenolpyruvate carboxylase  59.9 
 
 
1009 aa  1057    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251385  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2376  phosphoenolpyruvate carboxylase  86.01 
 
 
949 aa  1565    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3081  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.53 
 
 
889 aa  720    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.134099  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1814  phosphoenolpyruvate carboxylase  60.92 
 
 
994 aa  1065    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594671  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  50.21 
 
 
946 aa  785    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0138  phosphoenolpyruvate carboxylase  60.88 
 
 
932 aa  1028    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.497432 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2367  Phosphoenolpyruvate carboxylase  46.21 
 
 
945 aa  736    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2536  Phosphoenolpyruvate carboxylase  47.24 
 
 
921 aa  714    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366441  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2469  phosphoenolpyruvate carboxylase  61.61 
 
 
998 aa  1068    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792272  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  59.42 
 
 
1001 aa  1055    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2426  phosphoenolpyruvate carboxylase  60.92 
 
 
1009 aa  1066    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  52.68 
 
 
936 aa  901    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0707  Phosphoenolpyruvate carboxylase  41.48 
 
 
884 aa  657    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  59.36 
 
 
1002 aa  1052    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  50.21 
 
 
946 aa  785    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2707  phosphoenolpyruvate carboxylase  49.41 
 
 
936 aa  760    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.136783 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  58.09 
 
 
920 aa  970    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2000  phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 
951 aa  1915    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277994  decreased coverage  0.000144828 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3091  phosphoenolpyruvate carboxylase  80.11 
 
 
982 aa  1502    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723203  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2889  phosphoenolpyruvate carboxylase  86.01 
 
 
949 aa  1561    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.695135  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2286  phosphoenolpyruvate carboxylase  61.77 
 
 
994 aa  1085    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1041  phosphoenolpyruvate carboxylase  82.74 
 
 
930 aa  1496    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3003  phosphoenolpyruvate carboxylase  69.86 
 
 
934 aa  1239    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371181  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2999  phosphoenolpyruvate carboxylase  61.77 
 
 
994 aa  1085    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  62.22 
 
 
994 aa  1082    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954175  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1075  phosphoenolpyruvate carboxylase  61.77 
 
 
1024 aa  1083    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  50.21 
 
 
946 aa  785    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1599  phosphoenolpyruvate carboxylase  61.77 
 
 
994 aa  1085    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.737727  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2233  phosphoenolpyruvate carboxylase  80.53 
 
 
949 aa  1509    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380618  normal  0.0228414 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3706  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.71 
 
 
937 aa  745    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.625576  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1068  phosphoenolpyruvate carboxylase  60.91 
 
 
1075 aa  1067    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1819  Phosphoenolpyruvate carboxylase  63.07 
 
 
923 aa  1105    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  52.94 
 
 
928 aa  896    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  41.2 
 
 
929 aa  606  9.999999999999999e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0759  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.75 
 
 
931 aa  604  1.0000000000000001e-171  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  40.5 
 
 
906 aa  605  1.0000000000000001e-171  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0760  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.32 
 
 
940 aa  584  1.0000000000000001e-165  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  41.86 
 
 
905 aa  585  1.0000000000000001e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1084  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.06 
 
 
929 aa  578  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.83 
 
 
931 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  39.81 
 
 
933 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.56 
 
 
952 aa  572  1e-161  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.29 
 
 
938 aa  562  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1521  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.39 
 
 
929 aa  551  1e-155  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1883  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.61 
 
 
929 aa  550  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1558  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.61 
 
 
929 aa  550  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0614036  unclonable  0.000000000174255 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0770  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.17 
 
 
957 aa  546  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.815806  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.53 
 
 
939 aa  544  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0875  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.75 
 
 
947 aa  546  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.127499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0304  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.71 
 
 
931 aa  535  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2121  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.92 
 
 
946 aa  530  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.180736 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0998  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.62 
 
 
938 aa  523  1e-147  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0561  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.29 
 
 
932 aa  516  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1822  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.23 
 
 
926 aa  508  9.999999999999999e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.389962  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1138  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.3 
 
 
926 aa  505  1e-141  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118011  normal  0.338902 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4721  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.11 
 
 
896 aa  492  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0472  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.16 
 
 
898 aa  491  1e-137  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1933  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.64 
 
 
995 aa  488  1e-136  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0178  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.97 
 
 
940 aa  486  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0828  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.55 
 
 
928 aa  487  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.891362  normal  0.27066 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1667  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.6 
 
 
989 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3689  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.34 
 
 
900 aa  485  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2220  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.08 
 
 
1018 aa  485  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0767995 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1661  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.97 
 
 
938 aa  483  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4375  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.86 
 
 
896 aa  483  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0553395  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0883  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.33 
 
 
972 aa  483  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.3209  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0994  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.33 
 
 
892 aa  483  1e-135  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.43848  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2252  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.2 
 
 
1017 aa  480  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0123033 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5805  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.88 
 
 
914 aa  482  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.454197 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2494  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.77 
 
 
897 aa  476  1e-133  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2134  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.52 
 
 
1023 aa  476  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1468  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.61 
 
 
898 aa  478  1e-133  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0614  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.89 
 
 
954 aa  479  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22741  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.38 
 
 
1002 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.114136 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2311  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.13 
 
 
900 aa  477  1e-133  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.900921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>