242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0994 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0994  Phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 
892 aa  1783    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.43848  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1653  Phosphoenolpyruvate carboxylase  71 
 
 
892 aa  1248    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0256628  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1661  Phosphoenolpyruvate carboxylase  41.68 
 
 
938 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0661  phosphoenolpyruvate carboxylase  44.49 
 
 
831 aa  575  1.0000000000000001e-162  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  39.31 
 
 
933 aa  560  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.76 
 
 
929 aa  559  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.47 
 
 
952 aa  526  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.43 
 
 
931 aa  523  1e-147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4375  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.45 
 
 
896 aa  511  1e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0553395  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.22 
 
 
938 aa  508  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4721  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.96 
 
 
896 aa  509  9.999999999999999e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.62 
 
 
906 aa  504  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0472  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.29 
 
 
898 aa  499  1e-140  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2494  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.39 
 
 
897 aa  496  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2311  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.25 
 
 
900 aa  492  1e-137  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.900921 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0770  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.69 
 
 
957 aa  478  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.815806  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.13 
 
 
1002 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.17 
 
 
920 aa  465  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.64 
 
 
946 aa  465  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.64 
 
 
946 aa  465  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.63 
 
 
1001 aa  464  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.64 
 
 
946 aa  465  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2522  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.9 
 
 
898 aa  464  1e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314131  normal  0.688456 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0327  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.82 
 
 
878 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.95477 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1468  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.03 
 
 
898 aa  460  9.999999999999999e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.71 
 
 
933 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.15 
 
 
933 aa  459  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0261  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.06 
 
 
882 aa  456  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132478  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2000  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.75 
 
 
951 aa  458  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277994  decreased coverage  0.000144828 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.79 
 
 
937 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3906  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.86 
 
 
889 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4214  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.54 
 
 
889 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2707  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.71 
 
 
936 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.136783 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2291  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.44 
 
 
883 aa  456  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3360  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.97 
 
 
878 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620961  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.31 
 
 
985 aa  452  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0875  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.59 
 
 
947 aa  450  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.127499  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4096  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.43 
 
 
889 aa  452  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2699  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.17 
 
 
915 aa  449  1e-125  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3412  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.65 
 
 
994 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3710  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.99 
 
 
889 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0235  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.99 
 
 
889 aa  451  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.859727 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.93 
 
 
936 aa  452  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2234  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.89 
 
 
881 aa  452  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3091  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.53 
 
 
982 aa  450  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723203  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1041  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.73 
 
 
930 aa  452  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4125  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.22 
 
 
889 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4015  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.43 
 
 
889 aa  452  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.265986 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3718  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.43 
 
 
889 aa  452  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.910029  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0274  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.64 
 
 
881 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.29 
 
 
928 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.62 
 
 
929 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4783  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.26 
 
 
878 aa  448  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.380349  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4278  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.06 
 
 
878 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.419374 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0200  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.78 
 
 
878 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.611049  normal  0.122744 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4030  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.28 
 
 
883 aa  443  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.66 
 
 
928 aa  446  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2233  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.84 
 
 
949 aa  443  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380618  normal  0.0228414 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.16 
 
 
929 aa  446  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4442  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.28 
 
 
883 aa  443  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2180  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.97 
 
 
1030 aa  443  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235371  hitchhiker  0.000906218 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04694  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.93 
 
 
896 aa  445  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.510612  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4030  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.69 
 
 
883 aa  442  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.366538 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03841  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.17 
 
 
883 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4190  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.17 
 
 
883 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2220  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.19 
 
 
1018 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0767995 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3900  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.88 
 
 
898 aa  440  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.33 
 
 
939 aa  442  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0763  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.9 
 
 
950 aa  442  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000509332 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03790  hypothetical protein  36.17 
 
 
883 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2376  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.48 
 
 
949 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3665  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.68 
 
 
970 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4495  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.17 
 
 
883 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305581  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4060  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.17 
 
 
883 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.09 
 
 
926 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4403  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.17 
 
 
883 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.494951 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2889  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.48 
 
 
949 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.695135  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5416  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.17 
 
 
883 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3003  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.24 
 
 
934 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371181  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1505  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.98 
 
 
875 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4217  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.87 
 
 
875 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638207  normal  0.736372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.02 
 
 
876 aa  439  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0757254 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1521  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.19 
 
 
929 aa  437  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4360  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.06 
 
 
912 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4091  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.77 
 
 
878 aa  438  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2536  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.08 
 
 
921 aa  439  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366441  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16690  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.53 
 
 
878 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0125  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.77 
 
 
878 aa  438  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1068  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.35 
 
 
1075 aa  439  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1451  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.92 
 
 
878 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.4068  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3706  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.69 
 
 
937 aa  437  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.625576  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4450  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.06 
 
 
883 aa  436  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0357723 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4524  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.06 
 
 
883 aa  436  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189502 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2121  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.44 
 
 
946 aa  435  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.180736 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4329  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.13 
 
 
883 aa  435  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0248  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.88 
 
 
887 aa  433  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4447  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.06 
 
 
883 aa  436  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169419 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4065  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.18 
 
 
879 aa  435  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0190  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.24 
 
 
880 aa  433  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3928  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.99 
 
 
879 aa  434  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>