243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3718 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03841  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.34 
 
 
883 aa  997    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4030  Phosphoenolpyruvate carboxylase  57.34 
 
 
883 aa  998    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1505  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.37 
 
 
875 aa  925    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4495  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.34 
 
 
883 aa  997    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305581  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0274  phosphoenolpyruvate carboxylase  96.94 
 
 
881 aa  1742    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1508  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.68 
 
 
878 aa  927    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4524  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.38 
 
 
883 aa  1001    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189502 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4217  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.37 
 
 
875 aa  926    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638207  normal  0.736372 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1318  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.98 
 
 
878 aa  929    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0969534  hitchhiker  0.00571873 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002310  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.22 
 
 
877 aa  1024    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4096  phosphoenolpyruvate carboxylase  98.65 
 
 
889 aa  1813    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4214  phosphoenolpyruvate carboxylase  98.43 
 
 
889 aa  1808    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0190  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.34 
 
 
880 aa  1002    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.22 
 
 
876 aa  923    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0757254 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4447  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.38 
 
 
883 aa  1001    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169419 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4403  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.34 
 
 
883 aa  996    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.494951 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4278  phosphoenolpyruvate carboxylase  83.31 
 
 
878 aa  1491    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.419374 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03790  hypothetical protein  57.34 
 
 
883 aa  997    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0327  phosphoenolpyruvate carboxylase  82.86 
 
 
878 aa  1503    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.95477 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4329  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.5 
 
 
883 aa  1003    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4783  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.08 
 
 
878 aa  1009    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.380349  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3380  phosphoenolpyruvate carboxylase  50.63 
 
 
873 aa  833    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000188284  normal  0.443016 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0248  phosphoenolpyruvate carboxylase  81.69 
 
 
887 aa  1491    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1640  phosphoenolpyruvate carboxylase  53.45 
 
 
883 aa  890    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00188681  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0225  phosphoenolpyruvate carboxylase  79.91 
 
 
878 aa  1441    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2754  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.82 
 
 
876 aa  1007    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3900  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.13 
 
 
898 aa  1004    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5416  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.34 
 
 
883 aa  997    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0606  phosphoenolpyruvate carboxylase  52.97 
 
 
872 aa  929    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00195008  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0994  phosphoenolpyruvate carboxylase  53.69 
 
 
879 aa  961    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1110  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.37 
 
 
875 aa  924    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3710  phosphoenolpyruvate carboxylase  96.18 
 
 
889 aa  1736    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0235  phosphoenolpyruvate carboxylase  95.84 
 
 
889 aa  1734    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.859727 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0261  phosphoenolpyruvate carboxylase  49.27 
 
 
882 aa  811    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132478  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0189  phosphoenolpyruvate carboxylase  82.9 
 
 
882 aa  1486    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000683526  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4112  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.32 
 
 
875 aa  919    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.685624  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16690  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.87 
 
 
878 aa  948    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4190  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.34 
 
 
883 aa  997    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00742  phosphoenolpyruvate carboxylase  52.63 
 
 
873 aa  922    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00719358  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3906  phosphoenolpyruvate carboxylase  96.18 
 
 
889 aa  1740    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00045  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.77 
 
 
888 aa  1014    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1451  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.87 
 
 
878 aa  946    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.4068  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0125  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.19 
 
 
878 aa  1003    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0254  phosphoenolpyruvate carboxylase  82.07 
 
 
887 aa  1492    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.974753  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0226  phosphoenolpyruvate carboxylase  58.39 
 
 
878 aa  1039    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4015  phosphoenolpyruvate carboxylase  98.65 
 
 
889 aa  1813    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.265986 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2234  phosphoenolpyruvate carboxylase  53.95 
 
 
881 aa  931    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39300  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.66 
 
 
878 aa  914    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2291  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.24 
 
 
883 aa  791    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3928  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.92 
 
 
879 aa  993    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4060  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.34 
 
 
883 aa  997    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4350  phosphoenolpyruvate carboxylase  59.05 
 
 
879 aa  1029    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4360  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.37 
 
 
912 aa  1004    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4091  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.19 
 
 
878 aa  1003    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1255  phosphoenolpyruvate carboxylase  54.01 
 
 
876 aa  923    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0155098  normal  0.99385 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4442  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.34 
 
 
883 aa  998    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4125  phosphoenolpyruvate carboxylase  98.76 
 
 
889 aa  1816    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4450  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.38 
 
 
883 aa  1001    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0357723 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0200  phosphoenolpyruvate carboxylase  82.86 
 
 
878 aa  1480    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.611049  normal  0.122744 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4065  phosphoenolpyruvate carboxylase  58.71 
 
 
879 aa  1025    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4030  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.77 
 
 
883 aa  996    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.366538 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3718  phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 
889 aa  1834    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.910029  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3360  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.97 
 
 
878 aa  942    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620961  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2222  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.64 
 
 
887 aa  1010    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000647926  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51006  predicted protein  39.66 
 
 
1007 aa  634  1e-180  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.381291  normal  0.0264006 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27976  predicted protein  39.72 
 
 
1009 aa  622  1e-176  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.205513  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_51136  predicted protein  40.5 
 
 
877 aa  605  1.0000000000000001e-171  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.22 
 
 
929 aa  489  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0614  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.46 
 
 
954 aa  480  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07300  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.92 
 
 
942 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.36 
 
 
933 aa  472  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.43 
 
 
929 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.52 
 
 
938 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.22 
 
 
952 aa  472  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.71 
 
 
920 aa  467  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0742  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.24 
 
 
937 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.06 
 
 
928 aa  468  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.83 
 
 
933 aa  466  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0994  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.43 
 
 
892 aa  468  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.43848  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4447  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35 
 
 
945 aa  457  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.67 
 
 
926 aa  457  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.41 
 
 
1002 aa  458  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.12 
 
 
936 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.79 
 
 
933 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0661  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.59 
 
 
831 aa  454  1.0000000000000001e-126  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.33 
 
 
1001 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5805  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.2 
 
 
914 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.454197 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1653  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.64 
 
 
892 aa  451  1e-125  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0256628  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0138  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.81 
 
 
932 aa  448  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.497432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0178  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.98 
 
 
940 aa  447  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.72 
 
 
937 aa  449  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.17 
 
 
946 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.17 
 
 
946 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.17 
 
 
946 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0883  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.65 
 
 
972 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.3209  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.59 
 
 
985 aa  446  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.98 
 
 
918 aa  443  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.01 
 
 
931 aa  445  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3372  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.12 
 
 
954 aa  442  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.16897  normal  0.0169506 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2233  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.17 
 
 
949 aa  440  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380618  normal  0.0228414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>