243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30020 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0701  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.62 
 
 		 890 aa  866    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1398  phosphoenolpyruvate carboxylase  52.24 
 
 		 917 aa  892    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2973  Phosphoenolpyruvate carboxylase  50.05 
 
 		 927 aa  813    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2735  Phosphoenolpyruvate carboxylase  70.2 
 
 		 888 aa  1122    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0956137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4129  Phosphoenolpyruvate carboxylase  57.43 
 
 		 892 aa  855    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54774  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2554  phosphoenolpyruvate carboxylase  58.31 
 
 		 875 aa  883    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0748469  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2248  Phosphoenolpyruvate carboxylase  67.09 
 
 		 891 aa  1078    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.182119  hitchhiker  0.000536821 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3285  Phosphoenolpyruvate carboxylase  64.38 
 
 		 913 aa  1018    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1323  Phosphoenolpyruvate carboxylase  58.78 
 
 		 879 aa  902    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.133852 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3940  Phosphoenolpyruvate carboxylase  57.46 
 
 		 908 aa  888    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.622429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0397  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.95 
 
 		 915 aa  838    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0974  Phosphoenolpyruvate carboxylase  52.66 
 
 		 955 aa  847    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000578394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30020  Phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 		 900 aa  1796    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0018  phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  51.16 
 
 		 918 aa  860    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0134547 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.27 
 
 		 931 aa  514  1e-144  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.81 
 
 		 952 aa  487  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.87 
 
 		 938 aa  467  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.56 
 
 		 1001 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.9 
 
 		 929 aa  457  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.56 
 
 		 1002 aa  458  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0875  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.51 
 
 		 947 aa  456  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.127499  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0763  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.32 
 
 		 950 aa  454  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000509332 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.24 
 
 		 985 aa  451  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4375  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.01 
 
 		 896 aa  450  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0553395  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.68 
 
 		 906 aa  451  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.83 
 
 		 920 aa  449  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3806  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.35 
 
 		 907 aa  447  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.589788  normal  0.171928 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2522  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.65 
 
 		 898 aa  444  1e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314131  normal  0.688456 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2121  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.21 
 
 		 946 aa  443  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.180736 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.59 
 
 		 933 aa  443  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0998  Phosphoenolpyruvate carboxylase  32.94 
 
 		 938 aa  440  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2311  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.57 
 
 		 900 aa  436  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.900921 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0472  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.6 
 
 		 898 aa  435  1e-120  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.07 
 
 		 937 aa  436  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0178  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.89 
 
 		 940 aa  435  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.78 
 
 		 939 aa  431  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0770  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.92 
 
 		 957 aa  430  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.815806  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1521  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.76 
 
 		 929 aa  429  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4721  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.81 
 
 		 896 aa  432  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04694  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.61 
 
 		 896 aa  430  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.510612  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1883  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.25 
 
 		 929 aa  428  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2233  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.85 
 
 		 949 aa  429  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380618  normal  0.0228414 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1558  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.25 
 
 		 929 aa  428  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0614036  unclonable  0.000000000174255 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3665  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.93 
 
 		 970 aa  423  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0138  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.17 
 
 		 932 aa  424  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.497432 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0614  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.77 
 
 		 954 aa  424  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1041  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.68 
 
 		 930 aa  425  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.5 
 
 		 918 aa  420  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0871  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.32 
 
 		 1088 aa  420  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3412  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.47 
 
 		 994 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2376  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.12 
 
 		 949 aa  421  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3689  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.85 
 
 		 900 aa  422  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  36 
 
 		 946 aa  422  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0836  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.42 
 
 		 1038 aa  421  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0261  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.83 
 
 		 882 aa  421  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  36 
 
 		 946 aa  422  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2889  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.22 
 
 		 949 aa  420  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.695135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  36 
 
 		 946 aa  422  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1653  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.14 
 
 		 892 aa  420  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0256628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0304  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.86 
 
 		 931 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.48 
 
 		 926 aa  419  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2291  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.78 
 
 		 883 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3003  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.63 
 
 		 934 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1068  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.02 
 
 		 1075 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2180  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.51 
 
 		 1030 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235371  hitchhiker  0.000906218 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0729  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.54 
 
 		 994 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1468  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.04 
 
 		 898 aa  414  1e-114  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0699  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.61 
 
 		 1006 aa  415  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1228  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.42 
 
 		 1085 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.774396  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0994  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.9 
 
 		 892 aa  414  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.43848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2750  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.52 
 
 		 1009 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2286  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.54 
 
 		 994 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2999  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.54 
 
 		 994 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.54 
 
 		 994 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954175  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1075  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.54 
 
 		 1024 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1599  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.54 
 
 		 994 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.737727  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1819  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.91 
 
 		 923 aa  412  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218615 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07300  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.79 
 
 		 942 aa  411  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0561  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.7 
 
 		 932 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2000  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.23 
 
 		 951 aa  409  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277994  decreased coverage  0.000144828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5805  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.5 
 
 		 914 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.454197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3706  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.06 
 
 		 937 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.625576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.66 
 
 		 928 aa  405  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2134  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.09 
 
 		 1023 aa  404  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5753  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.99 
 
 		 1008 aa  405  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.61686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0396  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.1 
 
 		 997 aa  405  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411219  normal  0.654727 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1814  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.92 
 
 		 994 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594671  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2430  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.92 
 
 		 1009 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76585  normal  0.238617 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2426  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.92 
 
 		 1009 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2220  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.39 
 
 		 1018 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0767995 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2707  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.25 
 
 		 936 aa  405  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136783 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3091  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.07 
 
 		 982 aa  403  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0868  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.09 
 
 		 1004 aa  403  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1373  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.26 
 
 		 947 aa  405  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333226  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2494  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.81 
 
 		 897 aa  403  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2335  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.03 
 
 		 998 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.361608 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2252  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.93 
 
 		 1017 aa  401  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0123033 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2469  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.03 
 
 		 998 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792272  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17821  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.52 
 
 		 989 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22741  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.67 
 
 		 1002 aa  402  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.114136 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>