241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2699 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2699  Phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 		 915 aa  1846    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  39.38 
 
 		 933 aa  606  9.999999999999999e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.37 
 
 		 929 aa  563  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.52 
 
 		 952 aa  551  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.27 
 
 		 938 aa  547  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.74 
 
 		 931 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2367  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.31 
 
 		 945 aa  502  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.92 
 
 		 906 aa  501  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0875  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.43 
 
 		 947 aa  486  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.127499  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0661  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.42 
 
 		 831 aa  476  1e-133  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1661  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.08 
 
 		 938 aa  478  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1558  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.05 
 
 		 929 aa  478  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0614036  unclonable  0.000000000174255 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1883  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.05 
 
 		 929 aa  478  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0994  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.14 
 
 		 892 aa  474  1e-132  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.43848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0770  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.97 
 
 		 957 aa  475  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.815806  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0561  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.06 
 
 		 932 aa  474  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.99 
 
 		 939 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.12 
 
 		 946 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.12 
 
 		 946 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.12 
 
 		 946 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1653  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.25 
 
 		 892 aa  461  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0256628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04694  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.01 
 
 		 896 aa  458  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.510612  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5753  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.23 
 
 		 1008 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.61686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2121  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.69 
 
 		 946 aa  458  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.180736 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0841  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.12 
 
 		 939 aa  456  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2430  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.34 
 
 		 1009 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76585  normal  0.238617 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.69 
 
 		 918 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2180  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.45 
 
 		 1030 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235371  hitchhiker  0.000906218 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1521  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.23 
 
 		 929 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.26 
 
 		 937 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3412  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.02 
 
 		 994 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1814  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.23 
 
 		 994 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594671  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2426  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.23 
 
 		 1009 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3003  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.47 
 
 		 934 aa  456  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3706  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.57 
 
 		 937 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.625576  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0729  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.95 
 
 		 994 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2536  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.83 
 
 		 921 aa  449  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366441  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0472  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.51 
 
 		 898 aa  449  1e-125  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1138  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.17 
 
 		 926 aa  452  1e-125  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118011  normal  0.338902 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1228  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.95 
 
 		 1085 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.774396  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0304  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.35 
 
 		 931 aa  451  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07300  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.71 
 
 		 942 aa  452  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1822  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.91 
 
 		 926 aa  450  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.389962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2469  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.24 
 
 		 998 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792272  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2286  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.95 
 
 		 994 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2999  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.95 
 
 		 994 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.95 
 
 		 994 aa  452  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954175  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1075  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.95 
 
 		 1024 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1599  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.95 
 
 		 994 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.737727  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.03 
 
 		 1002 aa  452  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0763  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.6 
 
 		 950 aa  449  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000509332 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0871  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.84 
 
 		 1088 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2522  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.05 
 
 		 898 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314131  normal  0.688456 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.86 
 
 		 1001 aa  449  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2233  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.07 
 
 		 949 aa  448  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380618  normal  0.0228414 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.86 
 
 		 926 aa  449  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2707  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.35 
 
 		 936 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136783 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2335  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.1 
 
 		 998 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.361608 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0868  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.84 
 
 		 1004 aa  444  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.52 
 
 		 985 aa  443  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1373  phosphoenolpyruvate carboxylase  34 
 
 		 947 aa  443  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333226  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2220  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.88 
 
 		 1018 aa  445  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0767995 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4721  Phosphoenolpyruvate carboxylase  32.39 
 
 		 896 aa  444  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2000  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.73 
 
 		 951 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277994  decreased coverage  0.000144828 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1041  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.56 
 
 		 930 aa  439  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1068  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.28 
 
 		 1075 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.4 
 
 		 920 aa  437  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1468  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.44 
 
 		 898 aa  438  1e-121  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4375  Phosphoenolpyruvate carboxylase  32.39 
 
 		 896 aa  437  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0553395  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0628  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.52 
 
 		 903 aa  434  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.472091  normal  0.156419 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1819  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.9 
 
 		 923 aa  435  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218615 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1147  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.87 
 
 		 994 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.11 
 
 		 928 aa  432  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0396  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.12 
 
 		 997 aa  430  1e-119  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411219  normal  0.654727 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3665  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.66 
 
 		 970 aa  432  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.11 
 
 		 929 aa  432  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3091  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.65 
 
 		 982 aa  432  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0998  Phosphoenolpyruvate carboxylase  32.38 
 
 		 938 aa  432  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1667  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.87 
 
 		 989 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0261  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.47 
 
 		 882 aa  427  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2311  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.03 
 
 		 900 aa  428  1e-118  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.900921 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1933  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.26 
 
 		 995 aa  423  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1714  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.02 
 
 		 957 aa  425  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.686661  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16951  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.78 
 
 		 1007 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2750  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.58 
 
 		 1009 aa  426  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2376  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.72 
 
 		 949 aa  424  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3806  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.12 
 
 		 907 aa  426  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.589788  normal  0.171928 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2494  Phosphoenolpyruvate carboxylase  32.21 
 
 		 897 aa  426  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0226  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.33 
 
 		 878 aa  423  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2889  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.72 
 
 		 949 aa  424  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.695135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17821  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.77 
 
 		 989 aa  426  1e-117  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17621  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.81 
 
 		 989 aa  425  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20211  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.56 
 
 		 994 aa  426  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22741  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.62 
 
 		 1002 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.114136 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17661  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.87 
 
 		 989 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3689  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.77 
 
 		 900 aa  422  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0614  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.77 
 
 		 954 aa  420  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4129  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.92 
 
 		 892 aa  421  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54774  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4238  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.04 
 
 		 1021 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16690  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.55 
 
 		 878 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>