241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2311 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0472  Phosphoenolpyruvate carboxylase  67.22 
 
 
898 aa  1190    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2522  Phosphoenolpyruvate carboxylase  63.93 
 
 
898 aa  1089    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314131  normal  0.688456 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4375  Phosphoenolpyruvate carboxylase  66.7 
 
 
896 aa  1181    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0553395  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4721  Phosphoenolpyruvate carboxylase  66.15 
 
 
896 aa  1174    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1468  Phosphoenolpyruvate carboxylase  60.82 
 
 
898 aa  1067    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2311  phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 
900 aa  1807    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.900921 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2494  Phosphoenolpyruvate carboxylase  67.18 
 
 
897 aa  1155    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.26 
 
 
929 aa  557  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.73 
 
 
931 aa  535  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.76 
 
 
906 aa  528  1e-148  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0770  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.03 
 
 
957 aa  528  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.815806  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.07 
 
 
952 aa  525  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.69 
 
 
933 aa  515  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1883  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.13 
 
 
929 aa  512  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1558  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.13 
 
 
929 aa  512  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0614036  unclonable  0.000000000174255 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.08 
 
 
938 aa  512  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0994  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.25 
 
 
892 aa  509  9.999999999999999e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.43848  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.28 
 
 
939 aa  508  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1521  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.11 
 
 
929 aa  504  1e-141  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0875  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.12 
 
 
947 aa  494  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.127499  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0998  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.26 
 
 
938 aa  492  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2335  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.74 
 
 
998 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.361608 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2469  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.74 
 
 
998 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792272  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1653  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.46 
 
 
892 aa  485  1e-135  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0256628  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2121  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.57 
 
 
946 aa  481  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.180736 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3412  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.37 
 
 
994 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0868  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.35 
 
 
1004 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1068  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.37 
 
 
1075 aa  481  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.54 
 
 
985 aa  479  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0729  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.43 
 
 
994 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0871  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.22 
 
 
1088 aa  478  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2430  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.95 
 
 
1009 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76585  normal  0.238617 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.33 
 
 
920 aa  476  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2180  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.27 
 
 
1030 aa  479  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235371  hitchhiker  0.000906218 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0763  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.11 
 
 
950 aa  476  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000509332 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2286  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.43 
 
 
994 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2999  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.43 
 
 
994 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.43 
 
 
994 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954175  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1075  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.43 
 
 
1024 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1599  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.43 
 
 
994 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.737727  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1228  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.33 
 
 
1085 aa  475  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.774396  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5753  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.31 
 
 
1008 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.61686  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.16 
 
 
936 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2233  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.36 
 
 
949 aa  470  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380618  normal  0.0228414 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0138  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.97 
 
 
932 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.497432 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.33 
 
 
933 aa  473  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1814  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.74 
 
 
994 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594671  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2426  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.74 
 
 
1009 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.03 
 
 
926 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3806  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.43 
 
 
907 aa  467  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.589788  normal  0.171928 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.08 
 
 
929 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.64 
 
 
933 aa  469  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.55 
 
 
1002 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.59 
 
 
1001 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2000  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.13 
 
 
951 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277994  decreased coverage  0.000144828 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.06 
 
 
928 aa  464  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2367  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.56 
 
 
945 aa  465  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3091  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.32 
 
 
982 aa  464  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723203  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.56 
 
 
937 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.79 
 
 
928 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2750  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.03 
 
 
1009 aa  459  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251385  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1661  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.54 
 
 
938 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2554  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.6 
 
 
875 aa  459  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0748469  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3665  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.54 
 
 
970 aa  459  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.95 
 
 
929 aa  458  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1041  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.79 
 
 
930 aa  457  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04694  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.41 
 
 
896 aa  455  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.510612  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0699  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.15 
 
 
1006 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0661  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.38 
 
 
831 aa  453  1.0000000000000001e-126  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1819  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.55 
 
 
923 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218615 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.88 
 
 
918 aa  450  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2376  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.33 
 
 
949 aa  451  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2889  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.33 
 
 
949 aa  452  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.695135  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.78 
 
 
946 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0397  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.35 
 
 
915 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401912  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.78 
 
 
946 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.78 
 
 
946 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2220  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.86 
 
 
1018 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0767995 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0628  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.45 
 
 
903 aa  449  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.472091  normal  0.156419 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3940  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.85 
 
 
908 aa  444  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.622429  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0396  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.64 
 
 
997 aa  441  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411219  normal  0.654727 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0304  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.27 
 
 
931 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1714  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.34 
 
 
957 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.686661  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0614  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.37 
 
 
954 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3003  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.96 
 
 
934 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371181  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4129  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.28 
 
 
892 aa  438  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54774  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0561  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.88 
 
 
932 aa  437  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1667  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.88 
 
 
989 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2536  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.23 
 
 
921 aa  438  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366441  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3372  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.81 
 
 
954 aa  433  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.16897  normal  0.0169506 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30020  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.57 
 
 
900 aa  436  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4447  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.08 
 
 
945 aa  432  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2291  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.66 
 
 
883 aa  432  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17821  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.04 
 
 
989 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17621  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.88 
 
 
989 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1373  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.54 
 
 
947 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333226  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1933  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.07 
 
 
995 aa  429  1e-118  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2252  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.23 
 
 
1017 aa  427  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0123033 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0836  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.59 
 
 
1038 aa  426  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17661  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.93 
 
 
989 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>