243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3372 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5805  Phosphoenolpyruvate carboxylase  52.71 
 
 		 914 aa  812    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.454197 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0828  phosphoenolpyruvate carboxylase  54.15 
 
 		 928 aa  844    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.891362  normal  0.27066 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07300  Phosphoenolpyruvate carboxylase  50.75 
 
 		 942 aa  809    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4447  Phosphoenolpyruvate carboxylase  51.12 
 
 		 945 aa  837    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6583  phosphoenolpyruvate carboxylase  62.51 
 
 		 981 aa  1062    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.800439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0614  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.83 
 
 		 954 aa  808    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3372  Phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 		 954 aa  1868    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.16897  normal  0.0169506 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0742  Phosphoenolpyruvate carboxylase  48.5 
 
 		 937 aa  786    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0883  phosphoenolpyruvate carboxylase  53.33 
 
 		 972 aa  851    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.3209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0178  Phosphoenolpyruvate carboxylase  52.49 
 
 		 940 aa  860    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.81 
 
 		 952 aa  558  1e-157  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.59 
 
 		 929 aa  553  1e-156  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2220  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.15 
 
 		 1018 aa  555  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0767995 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.96 
 
 		 931 aa  544  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.47 
 
 		 938 aa  536  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22741  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.31 
 
 		 1002 aa  537  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.114136 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1667  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.21 
 
 		 989 aa  531  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  40.27 
 
 		 933 aa  531  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17621  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.37 
 
 		 989 aa  532  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2134  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.2 
 
 		 1023 aa  528  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1933  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.38 
 
 		 995 aa  527  1e-148  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0396  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.01 
 
 		 997 aa  526  1e-148  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411219  normal  0.654727 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16951  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.19 
 
 		 1007 aa  527  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17821  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.01 
 
 		 989 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20211  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.71 
 
 		 994 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17661  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.11 
 
 		 989 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1147  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.71 
 
 		 994 aa  526  1e-147  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2252  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.13 
 
 		 1017 aa  520  1e-146  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0123033 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.13 
 
 		 906 aa  521  1e-146  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3469  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.61 
 
 		 1024 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2647  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.61 
 
 		 1024 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.261414  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4238  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.45 
 
 		 1021 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.08 
 
 		 946 aa  512  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.08 
 
 		 946 aa  512  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04694  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.78 
 
 		 896 aa  511  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.510612  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.08 
 
 		 946 aa  512  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1696  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.15 
 
 		 1017 aa  501  1e-140  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0998  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.45 
 
 		 938 aa  496  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.71 
 
 		 936 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2707  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.25 
 
 		 936 aa  498  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136783 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3706  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.35 
 
 		 937 aa  496  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.625576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.02 
 
 		 939 aa  496  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.13 
 
 		 937 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.03 
 
 		 928 aa  492  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.77 
 
 		 929 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0836  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.9 
 
 		 1038 aa  490  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0561  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.36 
 
 		 932 aa  491  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1819  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.59 
 
 		 923 aa  488  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218615 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0628  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.96 
 
 		 903 aa  487  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.472091  normal  0.156419 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.25 
 
 		 933 aa  489  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0261  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.27 
 
 		 882 aa  483  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2291  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.97 
 
 		 883 aa  485  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2233  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.22 
 
 		 949 aa  481  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380618  normal  0.0228414 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2121  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.33 
 
 		 946 aa  482  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.180736 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1255  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.18 
 
 		 876 aa  482  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0155098  normal  0.99385 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4721  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.02 
 
 		 896 aa  476  1e-133  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.9 
 
 		 918 aa  476  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.73 
 
 		 926 aa  478  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.12 
 
 		 928 aa  476  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1521  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.36 
 
 		 929 aa  476  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.39 
 
 		 929 aa  478  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0661  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.24 
 
 		 831 aa  479  1e-133  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1883  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.83 
 
 		 929 aa  477  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1558  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.83 
 
 		 929 aa  477  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0614036  unclonable  0.000000000174255 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.68 
 
 		 933 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1138  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.61 
 
 		 926 aa  470  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118011  normal  0.338902 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0699  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.98 
 
 		 1006 aa  473  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0770  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.51 
 
 		 957 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.815806  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3665  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.97 
 
 		 970 aa  472  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0763  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.51 
 
 		 950 aa  472  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000509332 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0248  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.6 
 
 		 887 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3710  phosphoenolpyruvate carboxylase  36 
 
 		 889 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4329  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.25 
 
 		 883 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2000  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.78 
 
 		 951 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277994  decreased coverage  0.000144828 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3091  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.52 
 
 		 982 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4450  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.28 
 
 		 883 aa  469  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0357723 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3928  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.52 
 
 		 879 aa  468  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1228  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.65 
 
 		 1085 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.774396  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4065  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.62 
 
 		 879 aa  468  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1640  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.12 
 
 		 883 aa  467  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00188681  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1822  phosphoenolpyruvate carboxylase  34 
 
 		 926 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.389962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4447  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.28 
 
 		 883 aa  469  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169419 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1451  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.56 
 
 		 878 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.4068  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0235  phosphoenolpyruvate carboxylase  36 
 
 		 889 aa  469  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.859727 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4360  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.28 
 
 		 912 aa  469  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4524  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.28 
 
 		 883 aa  469  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189502 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2234  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.03 
 
 		 881 aa  468  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4030  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.61 
 
 		 883 aa  464  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.06 
 
 		 1001 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4495  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.61 
 
 		 883 aa  464  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305581  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2750  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.03 
 
 		 1009 aa  463  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4190  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.61 
 
 		 883 aa  464  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2286  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.54 
 
 		 994 aa  465  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5416  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.61 
 
 		 883 aa  464  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2999  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.54 
 
 		 994 aa  465  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.06 
 
 		 920 aa  464  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.54 
 
 		 994 aa  465  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954175  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1075  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.54 
 
 		 1024 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1599  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.54 
 
 		 994 aa  465  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.737727  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4442  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.61 
 
 		 883 aa  464  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>