244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3928 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03841  phosphoenolpyruvate carboxylase  81.31 
 
 
883 aa  1472    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4030  Phosphoenolpyruvate carboxylase  81.31 
 
 
883 aa  1472    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1505  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.25 
 
 
875 aa  892    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4278  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.42 
 
 
878 aa  970    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.419374 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0274  phosphoenolpyruvate carboxylase  58.03 
 
 
881 aa  1015    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1508  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.05 
 
 
878 aa  912    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4329  phosphoenolpyruvate carboxylase  82.22 
 
 
883 aa  1484    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4214  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.69 
 
 
889 aa  1009    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4217  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.25 
 
 
875 aa  894    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638207  normal  0.736372 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1318  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.48 
 
 
878 aa  904    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0969534  hitchhiker  0.00571873 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4447  phosphoenolpyruvate carboxylase  82.22 
 
 
883 aa  1484    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169419 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0125  phosphoenolpyruvate carboxylase  85.55 
 
 
878 aa  1536    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5416  phosphoenolpyruvate carboxylase  81.31 
 
 
883 aa  1472    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0190  phosphoenolpyruvate carboxylase  90.91 
 
 
880 aa  1631    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4091  phosphoenolpyruvate carboxylase  85.55 
 
 
878 aa  1536    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27976  predicted protein  42.01 
 
 
1009 aa  652    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.205513  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.49 
 
 
876 aa  897    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0757254 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1255  phosphoenolpyruvate carboxylase  52.2 
 
 
876 aa  915    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0155098  normal  0.99385 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4190  phosphoenolpyruvate carboxylase  81.31 
 
 
883 aa  1472    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4350  phosphoenolpyruvate carboxylase  89.19 
 
 
879 aa  1610    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39300  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.54 
 
 
878 aa  904    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4524  phosphoenolpyruvate carboxylase  82.22 
 
 
883 aa  1484    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189502 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0225  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.87 
 
 
878 aa  968    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3380  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.91 
 
 
873 aa  812    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000188284  normal  0.443016 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0248  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.9 
 
 
887 aa  972    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1640  phosphoenolpyruvate carboxylase  53.04 
 
 
883 aa  884    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00188681  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4015  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.81 
 
 
889 aa  1013    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.265986 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2754  phosphoenolpyruvate carboxylase  66.36 
 
 
876 aa  1205    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00045  phosphoenolpyruvate carboxylase  65.68 
 
 
888 aa  1182    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4783  phosphoenolpyruvate carboxylase  85.55 
 
 
878 aa  1542    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.380349  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0606  phosphoenolpyruvate carboxylase  54.74 
 
 
872 aa  948    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00195008  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1451  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.11 
 
 
878 aa  922    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.4068  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0994  phosphoenolpyruvate carboxylase  64.29 
 
 
879 aa  1159    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4360  phosphoenolpyruvate carboxylase  82.22 
 
 
912 aa  1481    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3710  phosphoenolpyruvate carboxylase  58.03 
 
 
889 aa  1010    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0235  phosphoenolpyruvate carboxylase  58.03 
 
 
889 aa  1012    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.859727 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0261  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.31 
 
 
882 aa  842    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132478  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0189  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.72 
 
 
882 aa  987    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000683526  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4442  phosphoenolpyruvate carboxylase  81.31 
 
 
883 aa  1472    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16690  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.11 
 
 
878 aa  924    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2222  phosphoenolpyruvate carboxylase  66.82 
 
 
887 aa  1190    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000647926  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4495  phosphoenolpyruvate carboxylase  81.31 
 
 
883 aa  1472    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305581  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3906  phosphoenolpyruvate carboxylase  58.14 
 
 
889 aa  1016    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4096  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.81 
 
 
889 aa  1013    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0254  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.32 
 
 
887 aa  1003    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.974753  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0226  phosphoenolpyruvate carboxylase  58.8 
 
 
878 aa  1065    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2234  phosphoenolpyruvate carboxylase  54.23 
 
 
881 aa  922    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3928  phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 
879 aa  1810    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002310  phosphoenolpyruvate carboxylase  65.45 
 
 
877 aa  1177    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3900  phosphoenolpyruvate carboxylase  85.67 
 
 
898 aa  1538    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2291  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.13 
 
 
883 aa  796    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4065  phosphoenolpyruvate carboxylase  89.08 
 
 
879 aa  1610    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00742  phosphoenolpyruvate carboxylase  53.79 
 
 
873 aa  936    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00719358  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03790  hypothetical protein  81.31 
 
 
883 aa  1472    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4450  phosphoenolpyruvate carboxylase  82.22 
 
 
883 aa  1484    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0357723 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1110  phosphoenolpyruvate carboxylase  54.89 
 
 
875 aa  887    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4125  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.69 
 
 
889 aa  1010    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4403  phosphoenolpyruvate carboxylase  81.31 
 
 
883 aa  1472    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.494951 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4060  phosphoenolpyruvate carboxylase  81.31 
 
 
883 aa  1472    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4112  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.68 
 
 
875 aa  900    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.685624  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0200  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.55 
 
 
878 aa  969    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.611049  normal  0.122744 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51006  predicted protein  40.4 
 
 
1007 aa  650    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.381291  normal  0.0264006 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0327  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.87 
 
 
878 aa  993    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.95477 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4030  phosphoenolpyruvate carboxylase  81.43 
 
 
883 aa  1473    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.366538 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3718  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.92 
 
 
889 aa  1016    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.910029  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3360  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.12 
 
 
878 aa  923    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620961  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_51136  predicted protein  41.52 
 
 
877 aa  613  9.999999999999999e-175  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.78 
 
 
929 aa  489  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.46 
 
 
952 aa  473  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.14 
 
 
946 aa  465  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.19 
 
 
931 aa  465  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.14 
 
 
946 aa  465  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.14 
 
 
946 aa  465  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.94 
 
 
938 aa  462  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.22 
 
 
906 aa  462  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.08 
 
 
928 aa  456  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3372  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.73 
 
 
954 aa  457  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.16897  normal  0.0169506 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1521  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.4 
 
 
929 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.2 
 
 
1001 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07300  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.03 
 
 
942 aa  455  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.18 
 
 
985 aa  450  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0994  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.93 
 
 
892 aa  452  1e-125  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.43848  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.77 
 
 
929 aa  452  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5805  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.2 
 
 
914 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.454197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3706  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.83 
 
 
937 aa  451  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.625576  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.27 
 
 
933 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.73 
 
 
1002 aa  449  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0614  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.33 
 
 
954 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1147  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.33 
 
 
994 aa  442  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0742  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.73 
 
 
937 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6583  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.63 
 
 
981 aa  438  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.800439  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.28 
 
 
936 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4447  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.69 
 
 
945 aa  437  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2536  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.19 
 
 
921 aa  438  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366441  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2707  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.46 
 
 
936 aa  437  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.136783 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3091  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.05 
 
 
982 aa  437  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723203  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20211  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.33 
 
 
994 aa  439  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1933  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.15 
 
 
995 aa  434  1e-120  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2220  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.05 
 
 
1018 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0767995 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.44 
 
 
933 aa  435  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.209652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>