241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6583 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0828  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.53 
 
 		 928 aa  857    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.891362  normal  0.27066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5805  Phosphoenolpyruvate carboxylase  52.83 
 
 		 914 aa  811    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.454197 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3372  Phosphoenolpyruvate carboxylase  63.89 
 
 		 954 aa  1083    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.16897  normal  0.0169506 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0614  phosphoenolpyruvate carboxylase  50.16 
 
 		 954 aa  832    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0178  Phosphoenolpyruvate carboxylase  53.62 
 
 		 940 aa  898    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6583  phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 		 981 aa  1913    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.800439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0742  Phosphoenolpyruvate carboxylase  50.1 
 
 		 937 aa  800    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4447  Phosphoenolpyruvate carboxylase  50.58 
 
 		 945 aa  813    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07300  Phosphoenolpyruvate carboxylase  49.63 
 
 		 942 aa  779    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0883  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.11 
 
 		 972 aa  868    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.3209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.92 
 
 		 952 aa  543  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.16 
 
 		 929 aa  540  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.22 
 
 		 931 aa  535  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2220  phosphoenolpyruvate carboxylase  36 
 
 		 1018 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0767995 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.88 
 
 		 938 aa  530  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16951  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.2 
 
 		 1007 aa  531  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4238  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.31 
 
 		 1021 aa  528  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20211  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.2 
 
 		 994 aa  525  1e-147  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1147  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.2 
 
 		 994 aa  521  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22741  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.3 
 
 		 1002 aa  522  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.114136 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2134  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.86 
 
 		 1023 aa  515  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0396  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.9 
 
 		 997 aa  512  1e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411219  normal  0.654727 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.69 
 
 		 906 aa  511  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17621  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.08 
 
 		 989 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1933  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.36 
 
 		 995 aa  507  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.87 
 
 		 933 aa  503  1e-141  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1696  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.22 
 
 		 1017 aa  496  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0770  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.77 
 
 		 957 aa  495  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.815806  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2252  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.6 
 
 		 1017 aa  495  9.999999999999999e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0123033 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0836  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.07 
 
 		 1038 aa  493  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17821  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.94 
 
 		 989 aa  495  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17661  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.04 
 
 		 989 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1667  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.87 
 
 		 989 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3469  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.66 
 
 		 1024 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2647  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.66 
 
 		 1024 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.261414  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1451  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.04 
 
 		 878 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.4068  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.83 
 
 		 936 aa  489  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.41 
 
 		 937 aa  488  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3360  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.19 
 
 		 878 aa  487  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04694  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.88 
 
 		 896 aa  483  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.510612  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.77 
 
 		 920 aa  484  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4112  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.81 
 
 		 875 aa  482  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.685624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.06 
 
 		 928 aa  480  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.49 
 
 		 946 aa  482  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.2 
 
 		 926 aa  479  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.49 
 
 		 946 aa  482  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2707  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.42 
 
 		 936 aa  481  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136783 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2291  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.46 
 
 		 883 aa  479  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.49 
 
 		 946 aa  482  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.98 
 
 		 876 aa  477  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0757254 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.05 
 
 		 933 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16690  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.41 
 
 		 878 aa  477  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1521  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.4 
 
 		 929 aa  475  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.23 
 
 		 929 aa  476  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3706  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.14 
 
 		 937 aa  473  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.625576  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03841  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.8 
 
 		 883 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4030  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.8 
 
 		 883 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03790  hypothetical protein  34.8 
 
 		 883 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4060  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.8 
 
 		 883 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4217  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.34 
 
 		 875 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638207  normal  0.736372 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.61 
 
 		 939 aa  472  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.21 
 
 		 933 aa  472  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.14 
 
 		 928 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.22 
 
 		 929 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4495  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.8 
 
 		 883 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305581  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0261  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.2 
 
 		 882 aa  471  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4190  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.8 
 
 		 883 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4442  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.8 
 
 		 883 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4403  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.8 
 
 		 883 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.494951 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1505  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.34 
 
 		 875 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1508  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.53 
 
 		 878 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1318  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.63 
 
 		 878 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0969534  hitchhiker  0.00571873 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1110  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.38 
 
 		 875 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0628  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.07 
 
 		 903 aa  466  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.472091  normal  0.156419 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5416  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.7 
 
 		 883 aa  469  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.22 
 
 		 985 aa  464  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0699  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.15 
 
 		 1006 aa  466  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0998  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.64 
 
 		 938 aa  466  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4375  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.37 
 
 		 896 aa  465  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0553395  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4030  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.38 
 
 		 883 aa  464  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.366538 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0248  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.86 
 
 		 887 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0868  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.06 
 
 		 1004 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0661  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.96 
 
 		 831 aa  460  9.999999999999999e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4524  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.28 
 
 		 883 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189502 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3710  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.24 
 
 		 889 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0254  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.77 
 
 		 887 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.974753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3091  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.25 
 
 		 982 aa  460  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.73 
 
 		 1001 aa  462  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4450  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.28 
 
 		 883 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0357723 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2494  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.47 
 
 		 897 aa  462  9.999999999999999e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4447  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.28 
 
 		 883 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169419 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1883  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.86 
 
 		 929 aa  459  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1558  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.86 
 
 		 929 aa  459  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0614036  unclonable  0.000000000174255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4096  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.1 
 
 		 889 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4329  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.28 
 
 		 883 aa  459  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39300  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.92 
 
 		 878 aa  457  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4015  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.1 
 
 		 889 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.265986 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4360  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.28 
 
 		 912 aa  459  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4125  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.99 
 
 		 889 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4721  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.21 
 
 		 896 aa  457  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>