242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5805 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0742  Phosphoenolpyruvate carboxylase  52.78 
 
 		 937 aa  870    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5805  Phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 		 914 aa  1824    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.454197 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07300  Phosphoenolpyruvate carboxylase  53.24 
 
 		 942 aa  841    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0828  phosphoenolpyruvate carboxylase  64.32 
 
 		 928 aa  1068    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.891362  normal  0.27066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6583  phosphoenolpyruvate carboxylase  53.16 
 
 		 981 aa  820    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.800439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0614  phosphoenolpyruvate carboxylase  52.67 
 
 		 954 aa  880    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0178  Phosphoenolpyruvate carboxylase  57.17 
 
 		 940 aa  946    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4447  Phosphoenolpyruvate carboxylase  54.41 
 
 		 945 aa  890    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3372  Phosphoenolpyruvate carboxylase  52.82 
 
 		 954 aa  832    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.16897  normal  0.0169506 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0883  phosphoenolpyruvate carboxylase  63.88 
 
 		 972 aa  1071    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.3209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.57 
 
 		 929 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.04 
 
 		 929 aa  551  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.29 
 
 		 936 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.82 
 
 		 933 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.92 
 
 		 931 aa  538  1e-151  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.1 
 
 		 928 aa  535  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.34 
 
 		 928 aa  532  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.07 
 
 		 929 aa  535  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0396  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.39 
 
 		 997 aa  530  1e-149  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411219  normal  0.654727 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.03 
 
 		 933 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1147  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.41 
 
 		 994 aa  528  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0770  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.38 
 
 		 957 aa  526  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.815806  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.79 
 
 		 926 aa  528  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.53 
 
 		 920 aa  528  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20211  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.09 
 
 		 994 aa  528  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16951  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.37 
 
 		 1007 aa  524  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2134  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.33 
 
 		 1023 aa  521  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22741  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.43 
 
 		 1002 aa  521  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.114136 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1933  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.49 
 
 		 995 aa  517  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17621  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.87 
 
 		 989 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.52 
 
 		 946 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.52 
 
 		 946 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.79 
 
 		 933 aa  513  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.52 
 
 		 946 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0875  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.33 
 
 		 947 aa  514  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.127499  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.69 
 
 		 906 aa  511  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1667  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.54 
 
 		 989 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0836  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.92 
 
 		 1038 aa  512  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0261  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.25 
 
 		 882 aa  512  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2367  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.46 
 
 		 945 aa  512  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.67 
 
 		 952 aa  511  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.15 
 
 		 938 aa  509  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2220  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.84 
 
 		 1018 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0767995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1451  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.5 
 
 		 878 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.4068  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.15 
 
 		 937 aa  508  9.999999999999999e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.12 
 
 		 1001 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17821  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.08 
 
 		 989 aa  508  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1521  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.59 
 
 		 929 aa  504  1e-141  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16690  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.44 
 
 		 878 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.76 
 
 		 1002 aa  505  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1505  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.39 
 
 		 875 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4217  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.5 
 
 		 875 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638207  normal  0.736372 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4238  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.74 
 
 		 1021 aa  502  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2707  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.51 
 
 		 936 aa  500  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136783 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1041  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.7 
 
 		 930 aa  501  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17661  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.89 
 
 		 989 aa  500  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3706  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.8 
 
 		 937 aa  501  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.625576  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.66 
 
 		 985 aa  496  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4112  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.18 
 
 		 875 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.685624  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1696  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.63 
 
 		 1017 aa  496  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2233  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.24 
 
 		 949 aa  496  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380618  normal  0.0228414 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2750  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.46 
 
 		 1009 aa  494  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2000  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.39 
 
 		 951 aa  496  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277994  decreased coverage  0.000144828 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2291  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.71 
 
 		 883 aa  495  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1110  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.18 
 
 		 875 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2180  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.01 
 
 		 1030 aa  491  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235371  hitchhiker  0.000906218 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0763  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.54 
 
 		 950 aa  492  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000509332 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0699  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.22 
 
 		 1006 aa  490  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3665  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.77 
 
 		 970 aa  491  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.8 
 
 		 939 aa  488  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2252  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.36 
 
 		 1017 aa  488  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0123033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3412  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.03 
 
 		 994 aa  487  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1068  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.64 
 
 		 1075 aa  489  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3091  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.28 
 
 		 982 aa  484  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39300  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.7 
 
 		 878 aa  484  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3360  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.07 
 
 		 878 aa  485  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0998  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.65 
 
 		 938 aa  482  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1558  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.43 
 
 		 929 aa  482  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0614036  unclonable  0.000000000174255 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1373  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.06 
 
 		 947 aa  481  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333226  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0190  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.53 
 
 		 880 aa  481  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1883  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.43 
 
 		 929 aa  482  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3469  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.66 
 
 		 1024 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2647  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.66 
 
 		 1024 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.261414  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2536  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.18 
 
 		 921 aa  478  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366441  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2121  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.53 
 
 		 946 aa  479  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.180736 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03841  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.08 
 
 		 883 aa  475  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4030  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.08 
 
 		 883 aa  475  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1508  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.98 
 
 		 878 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4190  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.08 
 
 		 883 aa  475  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0248  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.33 
 
 		 887 aa  475  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4060  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.08 
 
 		 883 aa  475  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03790  hypothetical protein  36.08 
 
 		 883 aa  475  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4442  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.08 
 
 		 883 aa  475  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4495  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.08 
 
 		 883 aa  475  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305581  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5416  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.08 
 
 		 883 aa  475  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0254  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.38 
 
 		 887 aa  473  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.974753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4403  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.08 
 
 		 883 aa  475  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.494951 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0868  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.81 
 
 		 1004 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.18 
 
 		 918 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0994  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.07 
 
 		 879 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>