243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4447 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0742  Phosphoenolpyruvate carboxylase  61.32 
 
 		 937 aa  1085    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5805  Phosphoenolpyruvate carboxylase  54.09 
 
 		 914 aa  862    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.454197 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0178  Phosphoenolpyruvate carboxylase  54.15 
 
 		 940 aa  910    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4447  Phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 		 945 aa  1895    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6583  phosphoenolpyruvate carboxylase  50.58 
 
 		 981 aa  791    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.800439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0614  phosphoenolpyruvate carboxylase  60.76 
 
 		 954 aa  1109    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07300  Phosphoenolpyruvate carboxylase  56.65 
 
 		 942 aa  974    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0828  phosphoenolpyruvate carboxylase  54.09 
 
 		 928 aa  901    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.891362  normal  0.27066 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3372  Phosphoenolpyruvate carboxylase  51.12 
 
 		 954 aa  830    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.16897  normal  0.0169506 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0883  phosphoenolpyruvate carboxylase  54.09 
 
 		 972 aa  910    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.3209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.85 
 
 		 931 aa  543  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.4 
 
 		 929 aa  533  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.95 
 
 		 906 aa  527  1e-148  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.02 
 
 		 936 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.41 
 
 		 933 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.06 
 
 		 952 aa  521  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.22 
 
 		 920 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.32 
 
 		 938 aa  510  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.16 
 
 		 933 aa  511  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.12 
 
 		 928 aa  510  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.96 
 
 		 985 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0261  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.24 
 
 		 882 aa  504  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2180  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.86 
 
 		 1030 aa  501  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235371  hitchhiker  0.000906218 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.05 
 
 		 928 aa  502  1e-140  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.46 
 
 		 1001 aa  501  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0396  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.16 
 
 		 997 aa  501  1e-140  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411219  normal  0.654727 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.57 
 
 		 929 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.44 
 
 		 946 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.66 
 
 		 1002 aa  502  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.44 
 
 		 946 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22741  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.79 
 
 		 1002 aa  500  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.114136 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.44 
 
 		 946 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2134  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.88 
 
 		 1023 aa  499  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1667  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.89 
 
 		 989 aa  499  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.91 
 
 		 937 aa  499  1e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.05 
 
 		 933 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.05 
 
 		 929 aa  497  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17821  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.01 
 
 		 989 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17661  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.94 
 
 		 989 aa  498  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.33 
 
 		 926 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0836  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.1 
 
 		 1038 aa  494  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17621  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.78 
 
 		 989 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1147  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.92 
 
 		 994 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1933  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.96 
 
 		 995 aa  491  1e-137  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1696  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.3 
 
 		 1017 aa  489  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16951  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.42 
 
 		 1007 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1819  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.81 
 
 		 923 aa  489  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218615 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20211  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.82 
 
 		 994 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3706  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.05 
 
 		 937 aa  486  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.625576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4238  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.56 
 
 		 1021 aa  489  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3469  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.24 
 
 		 1024 aa  486  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5753  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.02 
 
 		 1008 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.61686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3412  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.81 
 
 		 994 aa  485  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2647  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.24 
 
 		 1024 aa  486  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.261414  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0868  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.79 
 
 		 1004 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2469  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.07 
 
 		 998 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792272  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2707  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.78 
 
 		 936 aa  485  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136783 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2291  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.75 
 
 		 883 aa  483  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2430  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.23 
 
 		 1009 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76585  normal  0.238617 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0699  phosphoenolpyruvate carboxylase  36 
 
 		 1006 aa  481  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0770  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.46 
 
 		 957 aa  480  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.815806  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0871  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.54 
 
 		 1088 aa  482  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0248  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.63 
 
 		 887 aa  481  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2750  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.57 
 
 		 1009 aa  479  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1814  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.34 
 
 		 994 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594671  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2426  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.34 
 
 		 1009 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3091  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.22 
 
 		 982 aa  482  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2335  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.97 
 
 		 998 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.361608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2220  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.71 
 
 		 1018 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0767995 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.93 
 
 		 918 aa  477  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0561  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.72 
 
 		 932 aa  478  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0729  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.2 
 
 		 994 aa  475  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2367  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.16 
 
 		 945 aa  474  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1228  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.2 
 
 		 1085 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.774396  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2252  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.99 
 
 		 1017 aa  474  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0123033 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2233  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.12 
 
 		 949 aa  474  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380618  normal  0.0228414 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2376  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.01 
 
 		 949 aa  474  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2889  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.9 
 
 		 949 aa  473  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.695135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2286  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.2 
 
 		 994 aa  475  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2999  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.2 
 
 		 994 aa  475  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.2 
 
 		 994 aa  475  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954175  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1075  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.2 
 
 		 1024 aa  475  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1599  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.2 
 
 		 994 aa  475  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.737727  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0875  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.54 
 
 		 947 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.127499  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4096  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.11 
 
 		 889 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4015  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.11 
 
 		 889 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.265986 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0138  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.28 
 
 		 932 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.497432 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2000  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.33 
 
 		 951 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277994  decreased coverage  0.000144828 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1041  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.25 
 
 		 930 aa  472  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1068  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.28 
 
 		 1075 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4125  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.11 
 
 		 889 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3718  phosphoenolpyruvate carboxylase  35 
 
 		 889 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.910029  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0274  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.79 
 
 		 881 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.08 
 
 		 939 aa  467  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4214  phosphoenolpyruvate carboxylase  35 
 
 		 889 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0200  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.18 
 
 		 878 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.611049  normal  0.122744 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0763  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.08 
 
 		 950 aa  464  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000509332 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3665  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.59 
 
 		 970 aa  465  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3710  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.68 
 
 		 889 aa  465  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3906  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.68 
 
 		 889 aa  466  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>