More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1127 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1127  cell cycle protein  100 
 
 		 399 aa  806    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  34.44 
 
 		 365 aa  207  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  33.43 
 
 		 380 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  35.89 
 
 		 388 aa  183  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  33.24 
 
 		 379 aa  180  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4985  cell division protein FtsW  34.29 
 
 		 399 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348028  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57360  cell division protein FtsW  34.29 
 
 		 399 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  31.94 
 
 		 378 aa  177  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  33.23 
 
 		 403 aa  176  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 398 aa  176  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  36.02 
 
 		 363 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  33.97 
 
 		 364 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  37.65 
 
 		 372 aa  175  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  32.04 
 
 		 366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  34.44 
 
 		 367 aa  173  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  33.24 
 
 		 378 aa  172  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  33.54 
 
 		 371 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  34.63 
 
 		 382 aa  171  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  32.58 
 
 		 372 aa  170  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  37.16 
 
 		 384 aa  169  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  32.74 
 
 		 387 aa  168  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  33.23 
 
 		 382 aa  166  5e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004491  cell division protein FtsW  33.14 
 
 		 398 aa  166  6.9999999999999995e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  32.87 
 
 		 365 aa  166  8e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  32.19 
 
 		 371 aa  166  8e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  32.49 
 
 		 366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  32.23 
 
 		 366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1980  cell division protein FtsW  31.88 
 
 		 398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  34.43 
 
 		 377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  32.92 
 
 		 362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  34.92 
 
 		 366 aa  164  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  30.71 
 
 		 372 aa  164  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  31.29 
 
 		 412 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0159  cell cycle protein  32.34 
 
 		 369 aa  164  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679501  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09080  stage V sporulation protein E  31.49 
 
 		 365 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.861786  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4103  cell cycle protein  33.72 
 
 		 404 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.715571 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0921  cell division protein FtsW  33.9 
 
 		 402 aa  162  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.524737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  33.8 
 
 		 366 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2710  rod shape-determining protein RodA  36.42 
 
 		 361 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.217076  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  31.25 
 
 		 372 aa  162  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1276  stage V sporulation protein E  35.29 
 
 		 374 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  30.43 
 
 		 367 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4409  cell division protein FtsW  34.87 
 
 		 404 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309058  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 366 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2113  stage V sporulation protein E  33.03 
 
 		 374 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.985663  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00901  hypothetical protein  32.34 
 
 		 398 aa  161  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  32.42 
 
 		 374 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  35.49 
 
 		 376 aa  160  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  33.93 
 
 		 390 aa  160  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0357  cell division protein  34.89 
 
 		 394 aa  160  4e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.891735  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1371  rod shape-determining protein RodA  31.69 
 
 		 373 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0444396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4674  cell cycle protein  32.85 
 
 		 405 aa  159  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000737984  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1851  cell cycle protein  36.55 
 
 		 403 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  36.39 
 
 		 383 aa  159  6e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  31.62 
 
 		 376 aa  159  8e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1096  cell division protein FtsW  33.76 
 
 		 420 aa  159  8e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  36.86 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  31.23 
 
 		 366 aa  159  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1414  cell cycle protein  33.82 
 
 		 530 aa  159  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00165881  normal  0.0788928 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  30.27 
 
 		 368 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  30.92 
 
 		 367 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  31.15 
 
 		 373 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0943  cell division protein FtsW  32.12 
 
 		 404 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2851  cell division protein FtsW  33.96 
 
 		 424 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2987  cell division protein FtsW  33.61 
 
 		 506 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0447497 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00090  integral membrane protein involved in stabilizing FstZ ring during cell division  32.27 
 
 		 414 aa  157  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0091  cell division protein FtsW  32.27 
 
 		 414 aa  157  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00890066  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3511  cell division protein FtsW  32.27 
 
 		 414 aa  157  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00089  hypothetical protein  32.27 
 
 		 414 aa  157  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0094  cell division protein FtsW  32.27 
 
 		 414 aa  157  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.251291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3568  cell division protein FtsW  32.27 
 
 		 414 aa  157  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655548 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0095  cell division protein FtsW  32.27 
 
 		 414 aa  157  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.747639  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0097  cell division protein FtsW  32.27 
 
 		 414 aa  157  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.301255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  35.26 
 
 		 364 aa  156  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  29.32 
 
 		 373 aa  156  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  32.39 
 
 		 371 aa  156  7e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  34.04 
 
 		 386 aa  156  7e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3499  cell cycle protein  32.88 
 
 		 387 aa  156  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00851666  normal  0.20091 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  31.15 
 
 		 373 aa  156  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3268  cell division protein FtsW  32.88 
 
 		 511 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3257  cell division protein FtsW  32.88 
 
 		 511 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19497  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3319  cell division protein FtsW  32.88 
 
 		 511 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40135  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1270  rod shape-determining protein RodA  36.06 
 
 		 402 aa  155  9e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.681615  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  31.69 
 
 		 374 aa  155  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4083  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  31.51 
 
 		 386 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  28.41 
 
 		 371 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0082  cell division protein FtsW  32.27 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2816  cell cycle protein  30.51 
 
 		 374 aa  153  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2202  cell division protein FtsW  34.85 
 
 		 400 aa  152  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1258  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  30.73 
 
 		 386 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1919  rod shape-determining protein RodA  34.29 
 
 		 360 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.403487  hitchhiker  0.000000909205 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0658  cell cycle protein  31.71 
 
 		 380 aa  152  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2645  cell division protein FtsW  33.33 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  32.91 
 
 		 413 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1336  cell division protein FtsW  32.96 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.820801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  29.35 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4388  cell division protein FtsW  32.96 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.503964  normal  0.17369 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0979  cell cycle protein  29.66 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0872028  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13240  cell division protein FtsW  32.95 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.681757  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  34.18 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>