More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0359 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0359  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 416 aa  841    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0110  Acetyl-CoA C-acyltransferase  59.13 
 
 		 421 aa  460  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4519  acetyl-CoA acetyltransferase  54.44 
 
 		 423 aa  431  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2016  acetyl-CoA acetyltransferase  36.88 
 
 		 438 aa  259  9e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3113  acetyl-CoA acetyltransferase  38.28 
 
 		 443 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2847  acetyl-CoA acetyltransferase  38.16 
 
 		 426 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3019  acetyl-CoA acetyltransferase  38.89 
 
 		 434 aa  250  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0111069  normal  0.304528 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0128  acetyl-CoA acetyltransferase  37.5 
 
 		 431 aa  250  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0512709 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0411  acetyl-CoA acetyltransferase  38.19 
 
 		 433 aa  247  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0668027 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34950  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.6 
 
 		 470 aa  248  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.579675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38960  acetyl-CoA acetyltransferase  37.71 
 
 		 442 aa  246  6e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59796  normal  0.17992 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0306  acetyl-CoA acetyltransferase  36.93 
 
 		 428 aa  245  9e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.689603  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0195  acetyl-CoA acetyltransferase  37.14 
 
 		 426 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4453  acetyl-CoA acetyltransferase  38.42 
 
 		 431 aa  244  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.169822  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0582  acetyl-CoA acetyltransferase  36.75 
 
 		 425 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.263613 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0656  acetyl-CoA acetyltransferase  36.85 
 
 		 425 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0621  acetyl-CoA acetyltransferase  36.75 
 
 		 425 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3321  acetyl-CoA acetyltransferase  35.52 
 
 		 426 aa  239  5.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0745  acetyl-CoA acetyltransferase  36.56 
 
 		 425 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.135487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0436  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.39 
 
 		 435 aa  239  8e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0627  acetyl-CoA acetyltransferase  37.29 
 
 		 425 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230691 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1390  acetyl-CoA acetyltransferase  35.8 
 
 		 608 aa  238  1e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000140507 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0435  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.39 
 
 		 435 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152468  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0414  acetyl-CoA acetyltransferase  35.75 
 
 		 439 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.602422  hitchhiker  0.00366444 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0429  acetyl-CoA acetyltransferase  35.75 
 
 		 439 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.621378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2454  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.76 
 
 		 436 aa  238  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.363311  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1673  acetyl-CoA acetyltransferase  37.32 
 
 		 433 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.306006 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1068  acetyl-CoA acetyltransferase  35.56 
 
 		 537 aa  236  5.0000000000000005e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.20563  normal  0.644647 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4582  acetyl-CoA acetyltransferase  36.56 
 
 		 425 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0262438 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04228  acetyl-CoA acetyltransferase  38.92 
 
 		 395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381913  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1310  acetyl-CoA acetyltransferase  35.32 
 
 		 526 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21250  acetyl-CoA acetyltransferase  36.84 
 
 		 436 aa  235  1.0000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.287757  normal  0.606755 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0148  acetyl-CoA acetyltransferase  35.96 
 
 		 430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000426829 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2144  acetyl-CoA acetyltransferase  36.58 
 
 		 456 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404851  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0231  acetyl-CoA acetyltransferase  37.24 
 
 		 433 aa  232  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.203475  normal  0.315006 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0241  acetyl-CoA acetyltransferase  37.24 
 
 		 433 aa  232  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2378  acetyl-CoA acetyltransferase  35.9 
 
 		 438 aa  232  8.000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0593786 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0251  acetyl-CoA acetyltransferase  37.24 
 
 		 433 aa  232  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.152508 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0260  acetyl-CoA acetyltransferase  37.23 
 
 		 446 aa  232  8.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0142  acetyl-CoA acetyltransferase  36.21 
 
 		 430 aa  232  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23480  acetyl-CoA acetyltransferase  36.34 
 
 		 440 aa  232  1e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.482258  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2777  acetyl-CoA acetyltransferase  36.62 
 
 		 433 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360136  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4163  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.14 
 
 		 435 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310857 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1891  acetyl-CoA acetyltransferase  38.44 
 
 		 453 aa  232  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000305655 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1703  acetyl-CoA acetyltransferase  35.93 
 
 		 442 aa  230  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0645  acetyl-CoA acetyltransferase  35.87 
 
 		 425 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11720  acetyl-CoA acetyltransferase  37.89 
 
 		 447 aa  230  3e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000631784  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1257  acetyl-CoA acetyltransferase  35.22 
 
 		 428 aa  229  5e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.62872  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0407  3-ketoacyl-CoA thiolase  36.97 
 
 		 435 aa  229  7e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2937  acetyl-CoA acetyltransferase  38.14 
 
 		 453 aa  228  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.715943  normal  0.439632 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10246  acetyl-CoA acetyltransferase  37.29 
 
 		 440 aa  227  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63250  acetyl-CoA acetyltransferase  34.36 
 
 		 425 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5507  acetyl-CoA acetyltransferase  34.6 
 
 		 425 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0428  acetyl-CoA acetyltransferase  33.89 
 
 		 427 aa  224  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.42624  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0744  thiolase family protein  35.63 
 
 		 425 aa  222  8e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3585  acetyl-CoA acetyltransferase  38.92 
 
 		 448 aa  222  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2781  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.03 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2761  3-ketoacyl-CoA thiolase  33.8 
 
 		 436 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.780943  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2856  3-ketoacyl-CoA thiolase  33.8 
 
 		 436 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.969791  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1597  3-ketoacyl-CoA thiolase  33.8 
 
 		 436 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182557  hitchhiker  0.0000400964 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2822  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.76 
 
 		 437 aa  218  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2268  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.37 
 
 		 447 aa  216  4e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.300826  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2426  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.23 
 
 		 436 aa  216  5e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0353439 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1443  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.26 
 
 		 437 aa  216  8e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1399  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.01 
 
 		 436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.4  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1508  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.01 
 
 		 436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0149559  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03121  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.41 
 
 		 435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2460  3-ketoacyl-CoA thiolase  33.1 
 
 		 436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.207834  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1529  3-ketoacyl-CoA thiolase  33.73 
 
 		 436 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.962111  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1628  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.15 
 
 		 436 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00862019 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3027  3-ketoacyl-CoA thiolase  33.82 
 
 		 436 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.193952  normal  0.160809 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0383  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.01 
 
 		 436 aa  213  4.9999999999999996e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1734  3-ketoacyl-CoA thiolase  33.89 
 
 		 430 aa  212  7.999999999999999e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.302868  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0564  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.41 
 
 		 484 aa  212  7.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.814496  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2677  3-ketoacyl-CoA thiolase  33.99 
 
 		 436 aa  212  9e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3455  acetyl-CoA acetyltransferase  34.52 
 
 		 433 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0593596  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3379  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.03 
 
 		 436 aa  210  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002856  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.41 
 
 		 435 aa  210  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0827  acetyl-CoA acetyltransferase  34.97 
 
 		 434 aa  210  5e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2599  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.15 
 
 		 436 aa  209  6e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02701  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.5 
 
 		 436 aa  209  6e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1407  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.41 
 
 		 436 aa  209  7e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.14601  hitchhiker  0.000294797 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1472  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.41 
 
 		 436 aa  209  7e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.367131  hitchhiker  0.00889683 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1460  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.41 
 
 		 436 aa  209  7e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.395915  hitchhiker  0.0000132938 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2110  3-ketoacyl-CoA thiolase  36.52 
 
 		 438 aa  208  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4028  acetyl-CoA acetyltransferase  37.23 
 
 		 398 aa  209  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0742444  normal  0.074414 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2168  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.31 
 
 		 436 aa  207  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.381305 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3089  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.08 
 
 		 436 aa  205  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6972  acetyl-CoA acetyltransferase  38.07 
 
 		 421 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3157  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.94 
 
 		 435 aa  202  8e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0689  acetyl-CoA acetyltransferase  33.41 
 
 		 431 aa  202  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0806  acetyl-CoA acetyltransferase  34.03 
 
 		 450 aa  202  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273372  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1555  acetyl-CoA acetyltransferase  33.1 
 
 		 439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1428  acetyl-CoA acetyltransferase  32.87 
 
 		 439 aa  200  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1488  acetyl-CoA acetyltransferase  33.18 
 
 		 431 aa  199  5e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2598  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.28 
 
 		 437 aa  199  7.999999999999999e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1340  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.52 
 
 		 439 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2605  acetyl-CoA acetyltransferases  32.08 
 
 		 437 aa  195  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.299811  normal  0.76477 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28068  beta-ketoacyl-CoA thiolase  30.73 
 
 		 457 aa  194  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2882  3-ketoacyl-CoA thiolase  33.25 
 
 		 436 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.348178  normal  0.134146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>