More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0745 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0582  acetyl-CoA acetyltransferase  81.88 
 
 		 425 aa  716    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.263613 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0745  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 425 aa  861    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.135487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0195  acetyl-CoA acetyltransferase  75.24 
 
 		 426 aa  638    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0744  thiolase family protein  83.53 
 
 		 425 aa  714    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0645  acetyl-CoA acetyltransferase  83.29 
 
 		 425 aa  732    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0621  acetyl-CoA acetyltransferase  81.65 
 
 		 425 aa  713    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2016  acetyl-CoA acetyltransferase  74.17 
 
 		 438 aa  643    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0656  acetyl-CoA acetyltransferase  82.82 
 
 		 425 aa  738    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0627  acetyl-CoA acetyltransferase  82.82 
 
 		 425 aa  721    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230691 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1673  acetyl-CoA acetyltransferase  75.18 
 
 		 433 aa  639    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.306006 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4582  acetyl-CoA acetyltransferase  80.71 
 
 		 425 aa  706    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0262438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5507  acetyl-CoA acetyltransferase  88.24 
 
 		 425 aa  768    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63250  acetyl-CoA acetyltransferase  88.47 
 
 		 425 aa  770    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1257  acetyl-CoA acetyltransferase  73.35 
 
 		 428 aa  631  1e-180  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.62872  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2777  acetyl-CoA acetyltransferase  74.24 
 
 		 433 aa  630  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360136  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0429  acetyl-CoA acetyltransferase  71.79 
 
 		 439 aa  630  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.621378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0414  acetyl-CoA acetyltransferase  71.33 
 
 		 439 aa  625  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.602422  hitchhiker  0.00366444 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1703  acetyl-CoA acetyltransferase  72.54 
 
 		 442 aa  615  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2847  acetyl-CoA acetyltransferase  72.17 
 
 		 426 aa  616  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38960  acetyl-CoA acetyltransferase  70.99 
 
 		 442 aa  605  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59796  normal  0.17992 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0142  acetyl-CoA acetyltransferase  69.3 
 
 		 430 aa  596  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0148  acetyl-CoA acetyltransferase  69.53 
 
 		 430 aa  595  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000426829 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0306  acetyl-CoA acetyltransferase  69.1 
 
 		 428 aa  593  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.689603  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3019  acetyl-CoA acetyltransferase  69.69 
 
 		 434 aa  588  1e-167  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0111069  normal  0.304528 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0428  acetyl-CoA acetyltransferase  66.04 
 
 		 427 aa  572  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.42624  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2144  acetyl-CoA acetyltransferase  66.59 
 
 		 456 aa  570  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404851  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1390  acetyl-CoA acetyltransferase  66.35 
 
 		 608 aa  567  1e-160  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000140507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6972  acetyl-CoA acetyltransferase  70.59 
 
 		 421 aa  565  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4453  acetyl-CoA acetyltransferase  67.7 
 
 		 431 aa  561  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.169822  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1068  acetyl-CoA acetyltransferase  64.79 
 
 		 537 aa  557  1e-157  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.20563  normal  0.644647 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3113  acetyl-CoA acetyltransferase  65.03 
 
 		 443 aa  554  1e-157  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0411  acetyl-CoA acetyltransferase  65.96 
 
 		 433 aa  553  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0668027 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1310  acetyl-CoA acetyltransferase  63.62 
 
 		 526 aa  548  1e-155  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1891  acetyl-CoA acetyltransferase  65.89 
 
 		 453 aa  548  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000305655 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34950  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.42 
 
 		 470 aa  544  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.579675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2378  acetyl-CoA acetyltransferase  64.72 
 
 		 438 aa  543  1e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0593786 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11720  acetyl-CoA acetyltransferase  64.3 
 
 		 447 aa  542  1e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000631784  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3321  acetyl-CoA acetyltransferase  61.61 
 
 		 426 aa  540  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21250  acetyl-CoA acetyltransferase  65.48 
 
 		 436 aa  536  1e-151  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.287757  normal  0.606755 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0241  acetyl-CoA acetyltransferase  65.34 
 
 		 433 aa  528  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0231  acetyl-CoA acetyltransferase  65.34 
 
 		 433 aa  528  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.203475  normal  0.315006 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0251  acetyl-CoA acetyltransferase  65.34 
 
 		 433 aa  528  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.152508 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0260  acetyl-CoA acetyltransferase  64.79 
 
 		 446 aa  519  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190173 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0128  acetyl-CoA acetyltransferase  62.76 
 
 		 431 aa  515  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0512709 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3585  acetyl-CoA acetyltransferase  62.44 
 
 		 448 aa  513  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10246  acetyl-CoA acetyltransferase  65.42 
 
 		 440 aa  511  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2937  acetyl-CoA acetyltransferase  61.34 
 
 		 453 aa  500  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.715943  normal  0.439632 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23480  acetyl-CoA acetyltransferase  61.41 
 
 		 440 aa  493  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.482258  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04228  acetyl-CoA acetyltransferase  63.13 
 
 		 395 aa  479  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381913  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4028  acetyl-CoA acetyltransferase  62.25 
 
 		 398 aa  469  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0742444  normal  0.074414 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1399  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.97 
 
 		 436 aa  293  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.4  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1508  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.97 
 
 		 436 aa  293  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0149559  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0383  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.97 
 
 		 436 aa  291  1e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0407  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.65 
 
 		 435 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2781  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.63 
 
 		 436 aa  289  6e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1597  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.39 
 
 		 436 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182557  hitchhiker  0.0000400964 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2761  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.39 
 
 		 436 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.780943  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2856  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.39 
 
 		 436 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.969791  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2460  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.16 
 
 		 436 aa  286  5e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.207834  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0436  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.72 
 
 		 435 aa  286  5e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3455  acetyl-CoA acetyltransferase  41.92 
 
 		 433 aa  286  7e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0593596  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0435  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.72 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152468  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2822  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.97 
 
 		 437 aa  281  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0564  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.41 
 
 		 484 aa  281  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.814496  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1443  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.48 
 
 		 437 aa  280  4e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2110  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.39 
 
 		 438 aa  277  3e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4163  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.95 
 
 		 435 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310857 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3379  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.53 
 
 		 436 aa  273  4.0000000000000004e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1340  3-ketoacyl-CoA thiolase  40 
 
 		 439 aa  272  7e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02701  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.06 
 
 		 436 aa  271  1e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03121  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.76 
 
 		 435 aa  270  5e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3027  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.17 
 
 		 436 aa  269  7e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.193952  normal  0.160809 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02266  acetyl-CoA acetyltransferase  39.06 
 
 		 436 aa  269  8.999999999999999e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1315  acetyl-CoA C-acyltransferase FadI  39.06 
 
 		 436 aa  269  8.999999999999999e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02227  hypothetical protein  39.06 
 
 		 436 aa  269  8.999999999999999e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.977163  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2426  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.88 
 
 		 436 aa  268  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0353439 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2882  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.29 
 
 		 436 aa  268  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.348178  normal  0.134146 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2638  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.06 
 
 		 436 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4519  acetyl-CoA acetyltransferase  39.16 
 
 		 423 aa  268  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3485  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.82 
 
 		 436 aa  267  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1311  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.82 
 
 		 436 aa  267  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.995653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2722  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.06 
 
 		 436 aa  268  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1407  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.26 
 
 		 436 aa  268  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.14601  hitchhiker  0.000294797 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1472  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.26 
 
 		 436 aa  268  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.367131  hitchhiker  0.00889683 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1460  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.26 
 
 		 436 aa  268  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.395915  hitchhiker  0.0000132938 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1628  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.69 
 
 		 436 aa  266  4e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00862019 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002856  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.29 
 
 		 435 aa  265  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2599  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.88 
 
 		 436 aa  265  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2501  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.96 
 
 		 436 aa  265  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1663  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.73 
 
 		 436 aa  265  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0806954  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2268  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.14 
 
 		 447 aa  264  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.300826  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1529  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.14 
 
 		 436 aa  265  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.962111  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2493  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.82 
 
 		 436 aa  264  3e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3089  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.14 
 
 		 436 aa  264  3e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2618  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.35 
 
 		 436 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.101246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2578  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.35 
 
 		 436 aa  263  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.806259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2743  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.12 
 
 		 436 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.467701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2529  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.12 
 
 		 436 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2168  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.59 
 
 		 436 aa  262  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.381305 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2677  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.59 
 
 		 436 aa  261  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>