More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0241 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_0231  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 433 aa  878    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.203475  normal  0.315006 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4453  acetyl-CoA acetyltransferase  75.99 
 
 		 431 aa  650    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.169822  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0428  acetyl-CoA acetyltransferase  74.77 
 
 		 427 aa  654    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.42624  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0260  acetyl-CoA acetyltransferase  88.68 
 
 		 446 aa  751    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10246  acetyl-CoA acetyltransferase  85.42 
 
 		 440 aa  707    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0241  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 433 aa  878    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0411  acetyl-CoA acetyltransferase  89.84 
 
 		 433 aa  800    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0668027 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0251  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 433 aa  878    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.152508 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2847  acetyl-CoA acetyltransferase  69.86 
 
 		 426 aa  585  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0195  acetyl-CoA acetyltransferase  68.85 
 
 		 426 aa  580  1e-164  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0306  acetyl-CoA acetyltransferase  67.68 
 
 		 428 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.689603  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38960  acetyl-CoA acetyltransferase  68.62 
 
 		 442 aa  573  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59796  normal  0.17992 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1390  acetyl-CoA acetyltransferase  65.89 
 
 		 608 aa  566  1e-160  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000140507 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2144  acetyl-CoA acetyltransferase  66.2 
 
 		 456 aa  563  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404851  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0582  acetyl-CoA acetyltransferase  66.43 
 
 		 425 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.263613 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0621  acetyl-CoA acetyltransferase  66.2 
 
 		 425 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1068  acetyl-CoA acetyltransferase  64.2 
 
 		 537 aa  552  1e-156  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.20563  normal  0.644647 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0645  acetyl-CoA acetyltransferase  65.73 
 
 		 425 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4582  acetyl-CoA acetyltransferase  65.27 
 
 		 425 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0262438 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0627  acetyl-CoA acetyltransferase  65.73 
 
 		 425 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230691 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1310  acetyl-CoA acetyltransferase  63.28 
 
 		 526 aa  544  1e-153  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5507  acetyl-CoA acetyltransferase  64.87 
 
 		 425 aa  542  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0148  acetyl-CoA acetyltransferase  63.97 
 
 		 430 aa  544  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000426829 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0745  acetyl-CoA acetyltransferase  65.34 
 
 		 425 aa  543  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.135487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2378  acetyl-CoA acetyltransferase  63.11 
 
 		 438 aa  540  9.999999999999999e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0593786 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0656  acetyl-CoA acetyltransferase  64.4 
 
 		 425 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63250  acetyl-CoA acetyltransferase  64.64 
 
 		 425 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3113  acetyl-CoA acetyltransferase  62.33 
 
 		 443 aa  538  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0744  thiolase family protein  65.02 
 
 		 425 aa  537  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2016  acetyl-CoA acetyltransferase  62.56 
 
 		 438 aa  535  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0142  acetyl-CoA acetyltransferase  63.28 
 
 		 430 aa  535  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34950  3-ketoacyl-CoA thiolase  63.34 
 
 		 470 aa  535  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.579675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1891  acetyl-CoA acetyltransferase  62.79 
 
 		 453 aa  525  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000305655 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1257  acetyl-CoA acetyltransferase  61.75 
 
 		 428 aa  528  1e-148  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.62872  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1673  acetyl-CoA acetyltransferase  62.94 
 
 		 433 aa  525  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.306006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3019  acetyl-CoA acetyltransferase  64.1 
 
 		 434 aa  527  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0111069  normal  0.304528 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0429  acetyl-CoA acetyltransferase  61.81 
 
 		 439 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.621378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0414  acetyl-CoA acetyltransferase  61.57 
 
 		 439 aa  525  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.602422  hitchhiker  0.00366444 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21250  acetyl-CoA acetyltransferase  64.17 
 
 		 436 aa  523  1e-147  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.287757  normal  0.606755 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2777  acetyl-CoA acetyltransferase  62.47 
 
 		 433 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360136  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2937  acetyl-CoA acetyltransferase  63.28 
 
 		 453 aa  520  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.715943  normal  0.439632 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11720  acetyl-CoA acetyltransferase  62.62 
 
 		 447 aa  518  1.0000000000000001e-145  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000631784  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1703  acetyl-CoA acetyltransferase  61.59 
 
 		 442 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6972  acetyl-CoA acetyltransferase  65.49 
 
 		 421 aa  506  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23480  acetyl-CoA acetyltransferase  60.09 
 
 		 440 aa  493  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.482258  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3585  acetyl-CoA acetyltransferase  59.58 
 
 		 448 aa  486  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3321  acetyl-CoA acetyltransferase  57.04 
 
 		 426 aa  481  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0128  acetyl-CoA acetyltransferase  56.21 
 
 		 431 aa  459  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0512709 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4028  acetyl-CoA acetyltransferase  59.9 
 
 		 398 aa  441  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0742444  normal  0.074414 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04228  acetyl-CoA acetyltransferase  56 
 
 		 395 aa  418  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381913  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4519  acetyl-CoA acetyltransferase  41.98 
 
 		 423 aa  291  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0436  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.11 
 
 		 435 aa  286  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0435  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.11 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152468  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0407  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.88 
 
 		 435 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2781  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.52 
 
 		 436 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2761  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.28 
 
 		 436 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.780943  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1597  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.28 
 
 		 436 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182557  hitchhiker  0.0000400964 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2856  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.28 
 
 		 436 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.969791  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2460  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.59 
 
 		 436 aa  270  4e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.207834  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2426  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.41 
 
 		 436 aa  265  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0353439 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3455  acetyl-CoA acetyltransferase  40.89 
 
 		 433 aa  265  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0593596  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1443  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.64 
 
 		 437 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4163  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.49 
 
 		 435 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310857 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1508  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.93 
 
 		 436 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0149559  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1399  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.93 
 
 		 436 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.4  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0383  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.93 
 
 		 436 aa  259  4e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2454  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.23 
 
 		 436 aa  259  7e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.363311  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2822  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.38 
 
 		 437 aa  259  9e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1628  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.16 
 
 		 436 aa  258  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00862019 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3379  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.16 
 
 		 436 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1529  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.16 
 
 		 436 aa  256  5e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.962111  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02701  3-ketoacyl-CoA thiolase  36.7 
 
 		 436 aa  256  6e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1407  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.16 
 
 		 436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.14601  hitchhiker  0.000294797 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1472  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.16 
 
 		 436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.367131  hitchhiker  0.00889683 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2677  3-ketoacyl-CoA thiolase  36.67 
 
 		 436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1460  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.16 
 
 		 436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.395915  hitchhiker  0.0000132938 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2599  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.41 
 
 		 436 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0564  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.41 
 
 		 484 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.814496  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0110  Acetyl-CoA C-acyltransferase  39.3 
 
 		 421 aa  251  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3027  3-ketoacyl-CoA thiolase  36.67 
 
 		 436 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.193952  normal  0.160809 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3089  3-ketoacyl-CoA thiolase  36.92 
 
 		 436 aa  250  3e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2110  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.42 
 
 		 438 aa  250  3e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2168  3-ketoacyl-CoA thiolase  36.88 
 
 		 436 aa  250  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.381305 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2268  3-ketoacyl-CoA thiolase  36.67 
 
 		 447 aa  249  5e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.300826  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02266  acetyl-CoA acetyltransferase  36.19 
 
 		 436 aa  249  6e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1315  acetyl-CoA C-acyltransferase FadI  36.19 
 
 		 436 aa  249  6e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02227  hypothetical protein  36.19 
 
 		 436 aa  249  6e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.977163  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2638  3-ketoacyl-CoA thiolase  36.19 
 
 		 436 aa  249  7e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1311  3-ketoacyl-CoA thiolase  36.19 
 
 		 436 aa  249  7e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.995653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3485  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.94 
 
 		 436 aa  248  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2722  3-ketoacyl-CoA thiolase  36.19 
 
 		 436 aa  248  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0689  acetyl-CoA acetyltransferase  35.27 
 
 		 431 aa  248  1e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1663  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.71 
 
 		 436 aa  248  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0806954  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2501  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.89 
 
 		 436 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1488  acetyl-CoA acetyltransferase  34.87 
 
 		 431 aa  246  6e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2493  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.94 
 
 		 436 aa  246  8e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03121  3-ketoacyl-CoA thiolase  36.23 
 
 		 435 aa  244  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2578  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.96 
 
 		 436 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.806259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2618  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.96 
 
 		 436 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.101246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2529  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.72 
 
 		 436 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>