More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_34950 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2378  acetyl-CoA acetyltransferase  74.13 
 
 
438 aa  655    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0593786 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3113  acetyl-CoA acetyltransferase  79.58 
 
 
443 aa  692    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34950  3-ketoacyl-CoA thiolase  100 
 
 
470 aa  929    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.579675  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2144  acetyl-CoA acetyltransferase  70.11 
 
 
456 aa  627  1e-179  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404851  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1891  acetyl-CoA acetyltransferase  72.77 
 
 
453 aa  616  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000305655 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2937  acetyl-CoA acetyltransferase  72.27 
 
 
453 aa  608  1e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.715943  normal  0.439632 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11720  acetyl-CoA acetyltransferase  68.69 
 
 
447 aa  584  1.0000000000000001e-165  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000631784  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0306  acetyl-CoA acetyltransferase  69.16 
 
 
428 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.689603  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23480  acetyl-CoA acetyltransferase  66.59 
 
 
440 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.482258  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2847  acetyl-CoA acetyltransferase  66.04 
 
 
426 aa  569  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0195  acetyl-CoA acetyltransferase  66.36 
 
 
426 aa  567  1e-160  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21250  acetyl-CoA acetyltransferase  66.67 
 
 
436 aa  564  1.0000000000000001e-159  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.287757  normal  0.606755 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3585  acetyl-CoA acetyltransferase  68.22 
 
 
448 aa  560  1e-158  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0745  acetyl-CoA acetyltransferase  65.42 
 
 
425 aa  554  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.135487  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1390  acetyl-CoA acetyltransferase  62.79 
 
 
608 aa  548  1e-155  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000140507 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0656  acetyl-CoA acetyltransferase  64.49 
 
 
425 aa  549  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3019  acetyl-CoA acetyltransferase  65.58 
 
 
434 aa  551  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0111069  normal  0.304528 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38960  acetyl-CoA acetyltransferase  64.02 
 
 
442 aa  550  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59796  normal  0.17992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63250  acetyl-CoA acetyltransferase  64.25 
 
 
425 aa  548  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4582  acetyl-CoA acetyltransferase  63.72 
 
 
425 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0262438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5507  acetyl-CoA acetyltransferase  63.55 
 
 
425 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0582  acetyl-CoA acetyltransferase  63.72 
 
 
425 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.263613 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0645  acetyl-CoA acetyltransferase  64.4 
 
 
425 aa  541  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0142  acetyl-CoA acetyltransferase  63.81 
 
 
430 aa  543  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0148  acetyl-CoA acetyltransferase  63.81 
 
 
430 aa  543  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000426829 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0621  acetyl-CoA acetyltransferase  63.72 
 
 
425 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0627  acetyl-CoA acetyltransferase  63.95 
 
 
425 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230691 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0744  thiolase family protein  64.64 
 
 
425 aa  535  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1068  acetyl-CoA acetyltransferase  62.21 
 
 
537 aa  536  1e-151  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.20563  normal  0.644647 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0428  acetyl-CoA acetyltransferase  62.73 
 
 
427 aa  536  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.42624  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0411  acetyl-CoA acetyltransferase  62.85 
 
 
433 aa  537  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0668027 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0251  acetyl-CoA acetyltransferase  63.34 
 
 
433 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.152508 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4453  acetyl-CoA acetyltransferase  63.95 
 
 
431 aa  534  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.169822  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0241  acetyl-CoA acetyltransferase  63.34 
 
 
433 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0231  acetyl-CoA acetyltransferase  63.34 
 
 
433 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.203475  normal  0.315006 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1673  acetyl-CoA acetyltransferase  62.33 
 
 
433 aa  531  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.306006 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0429  acetyl-CoA acetyltransferase  61.66 
 
 
439 aa  527  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.621378  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1310  acetyl-CoA acetyltransferase  61.03 
 
 
526 aa  527  1e-148  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0260  acetyl-CoA acetyltransferase  64.02 
 
 
446 aa  527  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.190173 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2777  acetyl-CoA acetyltransferase  61.86 
 
 
433 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360136  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0414  acetyl-CoA acetyltransferase  61.43 
 
 
439 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.602422  hitchhiker  0.00366444 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2016  acetyl-CoA acetyltransferase  59.26 
 
 
438 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1703  acetyl-CoA acetyltransferase  59.77 
 
 
442 aa  512  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638246  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6972  acetyl-CoA acetyltransferase  65.57 
 
 
421 aa  509  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1257  acetyl-CoA acetyltransferase  60.47 
 
 
428 aa  508  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.62872  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10246  acetyl-CoA acetyltransferase  63.02 
 
 
440 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3321  acetyl-CoA acetyltransferase  56.15 
 
 
426 aa  501  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4028  acetyl-CoA acetyltransferase  63.53 
 
 
398 aa  473  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0742444  normal  0.074414 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0128  acetyl-CoA acetyltransferase  53.97 
 
 
431 aa  448  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0512709 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04228  acetyl-CoA acetyltransferase  53.87 
 
 
395 aa  413  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381913  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4519  acetyl-CoA acetyltransferase  39.3 
 
 
423 aa  287  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0436  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.4 
 
 
435 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0435  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.63 
 
 
435 aa  276  7e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152468  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0407  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.86 
 
 
435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1508  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.44 
 
 
436 aa  270  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0149559  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2454  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.23 
 
 
436 aa  270  4e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.363311  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1399  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.44 
 
 
436 aa  270  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.4  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4163  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.57 
 
 
435 aa  269  8e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.310857 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0383  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.44 
 
 
436 aa  269  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2761  3-ketoacyl-CoA thiolase  36.6 
 
 
436 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.780943  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2856  3-ketoacyl-CoA thiolase  36.6 
 
 
436 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.969791  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1597  3-ketoacyl-CoA thiolase  36.6 
 
 
436 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182557  hitchhiker  0.0000400964 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2781  3-ketoacyl-CoA thiolase  36.6 
 
 
436 aa  266  7e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2460  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.9 
 
 
436 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.207834  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1443  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.5 
 
 
437 aa  263  6.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2822  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.5 
 
 
437 aa  262  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3379  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.29 
 
 
436 aa  260  5.0000000000000005e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02701  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.24 
 
 
436 aa  256  5e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3455  acetyl-CoA acetyltransferase  40.29 
 
 
433 aa  256  8e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0593596  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0564  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.5 
 
 
484 aa  249  8e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.814496  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2110  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.15 
 
 
438 aa  248  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0359  acetyl-CoA acetyltransferase  39.3 
 
 
416 aa  247  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2599  3-ketoacyl-CoA thiolase  36.36 
 
 
436 aa  247  4e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1340  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.78 
 
 
439 aa  247  4e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1734  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.69 
 
 
430 aa  246  8e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.302868  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2426  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.17 
 
 
436 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0353439 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1407  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.38 
 
 
436 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.14601  hitchhiker  0.000294797 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1472  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.38 
 
 
436 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.367131  hitchhiker  0.00889683 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1460  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.38 
 
 
436 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.395915  hitchhiker  0.0000132938 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3089  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.38 
 
 
436 aa  243  5e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1628  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.63 
 
 
436 aa  243  6e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00862019 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2882  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.01 
 
 
436 aa  243  6e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.348178  normal  0.134146 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1529  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.38 
 
 
436 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.962111  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3485  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.5 
 
 
436 aa  242  9e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02266  acetyl-CoA acetyltransferase  37.24 
 
 
436 aa  242  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1315  acetyl-CoA C-acyltransferase FadI  37.24 
 
 
436 aa  242  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0827  acetyl-CoA acetyltransferase  36.88 
 
 
434 aa  242  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02227  hypothetical protein  37.24 
 
 
436 aa  242  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.977163  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2722  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.24 
 
 
436 aa  241  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2501  3-ketoacyl-CoA thiolase  36.99 
 
 
436 aa  241  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3027  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.89 
 
 
436 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.193952  normal  0.160809 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2638  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.24 
 
 
436 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1311  3-ketoacyl-CoA thiolase  36.99 
 
 
436 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.995653  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2677  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.89 
 
 
436 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2168  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.97 
 
 
436 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.381305 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0689  acetyl-CoA acetyltransferase  33.64 
 
 
431 aa  239  8e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1428  acetyl-CoA acetyltransferase  34.86 
 
 
439 aa  238  2e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1488  acetyl-CoA acetyltransferase  33.41 
 
 
431 aa  237  4e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1555  acetyl-CoA acetyltransferase  34.86 
 
 
439 aa  236  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2493  3-ketoacyl-CoA thiolase  36.73 
 
 
436 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>