More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0427 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0427  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 		 379 aa  761    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1799  hypothetical protein  65.52 
 
 		 236 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.056135 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1061  IS605 family transposase OrfB  34.28 
 
 		 409 aa  190  4e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00139779  hitchhiker  0.000000305099 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1577  transposase, IS605 OrfB family  32.11 
 
 		 396 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.833624  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1561  transposase, IS605 OrfB family  32.98 
 
 		 400 aa  177  3e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.786289  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1795  transposase, IS605 OrfB  65.38 
 
 		 96 aa  104  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0855799 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2779  transposase, IS605 OrfB family  28.17 
 
 		 412 aa  96.7  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.306797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0134  IS605 family transposase OrfB  28.57 
 
 		 403 aa  95.1  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1428  transposase, IS605 OrfB family  27.81 
 
 		 385 aa  94  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3626  transposase, IS605 OrfB family  27.7 
 
 		 425 aa  92.8  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3330  Transport-associated OB domain protein  28.34 
 
 		 418 aa  92  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0133521  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2488  transposase, IS605 OrfB family  28.23 
 
 		 439 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0681  transposase, IS605 OrfB family  28.87 
 
 		 427 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.146428  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1067  IS605 family transposase OrfB  28.78 
 
 		 416 aa  87.4  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1907  IS605 family transposase OrfB  28.28 
 
 		 433 aa  87.4  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1161  transposase, IS605 OrfB family  27.32 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1333  IS605 family transposase OrfB  29.71 
 
 		 477 aa  83.2  0.000000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0541  transposase, IS605 OrfB family  26.87 
 
 		 372 aa  80.5  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0005  transposase, IS605 OrfB  32.36 
 
 		 426 aa  79.3  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.741123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1189  transposase, IS605 OrfB family  26.4 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1200  transposase, IS605 OrfB family  27.56 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0919979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3539  transposase, IS605 OrfB family  25.53 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.3879  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1116  transposase, IS605 OrfB family  27.56 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal  0.355527 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0563  transposase, IS605 OrfB family  25.53 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.11437 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3043  IS605 family transposase OrfB  24.75 
 
 		 450 aa  75.5  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  28.99 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1833  IS605 family transposase OrfB  24.35 
 
 		 368 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1530  IS605 family transposase OrfB  28.16 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0242937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0928  transposase, IS605 OrfB  24.26 
 
 		 450 aa  74.3  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.621318  normal  0.596351 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1279  transposase, IS605 OrfB  29.64 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0586  transposase IS605 OrfB  30.54 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.732197 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0243  transposase, IS605 OrfB  31.97 
 
 		 418 aa  73.6  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.13657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1064  transposase, IS605 OrfB  30.04 
 
 		 485 aa  73.2  0.000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2682  transposase, IS605 OrfB family  26.32 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0586461  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0171  transposase, IS605 OrfB family  26.32 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0615  transposase, IS605 OrfB family  26.32 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.562099  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1446  transposase, IS605 OrfB family  26.32 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.252161  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0632  transposase, IS605 OrfB family  26.32 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000767619  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2228  transposase, IS605 OrfB family  26.32 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00238783  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2274  transposase, IS605 OrfB family  26.32 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.118023  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2358  transposase, IS605 OrfB family  26.32 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0658803  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1577  transposase, IS605 OrfB family  26.32 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0208104  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1854  transposase, IS605 OrfB family  26.32 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00011315  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0162  transposase, IS605 OrfB family  26.32 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2654  transposase, IS605 OrfB family  26.32 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00128227  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2261  transposase, IS605 OrfB family  25.79 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1921  transposase, IS605 OrfB family  26.32 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0530  transposase, IS605 OrfB family  26.32 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1753  transposase, IS605 OrfB family  26.84 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1604  transposase, IS605 OrfB family  26.84 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2240  transposase, IS605 OrfB family  26.32 
 
 		 360 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000297406  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1768  transposase, IS605 OrfB family  26.84 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2095  transposase, IS605 OrfB family  26.84 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1167  transposase, IS605 OrfB family  26.84 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000668854  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1586  transposase, IS605 OrfB family  26.84 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000279316  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1250  transposase, IS605 OrfB family  23.56 
 
 		 372 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0585  transposase, IS605 OrfB family  26.58 
 
 		 360 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1257  transposase, IS605 OrfB family  26.84 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3581  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  24.73 
 
 		 444 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0456  transposase, IS605 OrfB family  26.84 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0563  transposase, IS605 OrfB family  23.56 
 
 		 372 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1851  transposase, IS605 OrfB family  26.32 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000015791  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1707  transposase IS605 OrfB  30.05 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00115032 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1390  transposase, IS605 OrfB  27.5 
 
 		 460 aa  72  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2902  transposase  22.74 
 
 		 407 aa  70.9  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00617488  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1262  transposase, IS605 OrfB  30.96 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2346  transposase, IS605 OrfB family  26.36 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6879  IS605 family transposase OrfB  27.95 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0284  transposase, IS605 OrfB family  26.05 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000238986  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1447  transposase, IS605 OrfB  26.39 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.303185  normal  0.469752 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0234  transposase, IS605 OrfB family  26.58 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3136  transposase, IS605 OrfB family  26.32 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3945  transposase, IS605 OrfB family  26.59 
 
 		 413 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2867  transposase, IS605 OrfB family  26.84 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3994  transposase, IS605 OrfB family  26.58 
 
 		 396 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.437884  normal  0.653956 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2909  transposase, IS605 OrfB family  26.58 
 
 		 396 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1199  transposase IS605  25.86 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0968514  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0373  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  26.22 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0899  IS605 family transposase OrfB  29.2 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000107806  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0841  IS605 family transposase OrfB  29.36 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.084899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4668  transposase  23.37 
 
 		 359 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177412  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5480  IS605 family transposase OrfB  32.93 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.92096 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0877  IS605 family transposase OrfB  29.2 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000395057  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2125  transposase, IS605 OrfB family  26.34 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00617237  decreased coverage  0.0000396034 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0882  transposase  33.86 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00721916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1840  transposase, IS605 OrfB  29.07 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.113531  hitchhiker  0.00220366 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4125  transposase  23.08 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0035841 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4578  IS891/IS1136/IS1341 transposase  25.88 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1242  Fis family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 294 aa  67  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.635409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7429  transposase  27.48 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0333  transposase, IS605 OrfB  29.36 
 
 		 418 aa  67  0.0000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.107927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1414  transposase, IS605 OrfB  30.1 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1931  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  23.61 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1958  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  23.61 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0714326  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2198  transposase IS605  27.27 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0861  transposase, IS1341 family  29.76 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1156  IS605 family transposase OrfB  28.33 
 
 		 398 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0034474  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2211  transposase IS605  25.26 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0680  transposase, IS605 OrfB  25.98 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0573  IS605 family transposase OrfB  28.33 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>