27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1795 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1795  transposase, IS605 OrfB  100 
 
 
96 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0855799 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0427  IS605 family transposase OrfB  63.86 
 
 
379 aa  106  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1577  transposase, IS605 OrfB family  48.33 
 
 
396 aa  65.5  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.833624  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1061  IS605 family transposase OrfB  46.67 
 
 
409 aa  63.2  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00139779  hitchhiker  0.000000305099 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1561  transposase, IS605 OrfB family  45 
 
 
400 aa  62  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.786289  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0134  IS605 family transposase OrfB  40.28 
 
 
403 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2549  transposase, IS605 OrfB family  42.19 
 
 
370 aa  46.2  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.735833  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1200  transposase, IS605 OrfB family  35.29 
 
 
374 aa  44.7  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0919979  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1116  transposase, IS605 OrfB family  35.29 
 
 
374 aa  44.7  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal  0.355527 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0005  transposase, IS605 OrfB  51.22 
 
 
426 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.741123  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1279  transposase, IS605 OrfB  52.78 
 
 
423 aa  42.7  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0333  transposase, IS605 OrfB  40 
 
 
418 aa  42.7  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.107927  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1513  IS605 family transposase OrfB  38.81 
 
 
405 aa  43.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0963227  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1907  IS605 family transposase OrfB  37.5 
 
 
433 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128172  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1065  transposase, IS605 OrfB  37.93 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6879  IS605 family transposase OrfB  35.82 
 
 
387 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2680  transposase, IS605 OrfB family  29.33 
 
 
413 aa  40.8  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.430379  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1428  transposase, IS605 OrfB family  37.31 
 
 
385 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996106  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1189  transposase, IS605 OrfB family  38.46 
 
 
382 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1707  transposase IS605 OrfB  39.29 
 
 
420 aa  40.4  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00115032 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0882  transposase  38.6 
 
 
359 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00721916  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0190  transposase, IS605 OrfB family  33.33 
 
 
369 aa  40  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2039  transposase, IS605 OrfB family  33.33 
 
 
369 aa  40  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2178  transposase, IS605 OrfB family  33.33 
 
 
369 aa  40  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2846  transposase, IS605 OrfB family  33.33 
 
 
369 aa  40  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3000  transposase, IS605 OrfB family  33.33 
 
 
369 aa  40  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000628392  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0243  transposase, IS605 OrfB  37.29 
 
 
418 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.13657  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>