More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1425 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_1425  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
364 aa  754    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5482  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.83 
 
 
404 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.62329  normal  0.848973 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6900  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.56 
 
 
404 aa  333  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1258  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.92 
 
 
371 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0639  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  48.61 
 
 
372 aa  328  6e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4051  putative oxidoreductase  46.98 
 
 
370 aa  323  4e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3087  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.37 
 
 
370 aa  322  5e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5123  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.26 
 
 
362 aa  319  6e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3698  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.38 
 
 
364 aa  318  1e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014573 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1374  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.4 
 
 
366 aa  317  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47000  putative oxidoreductase  46.01 
 
 
370 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.246244  normal  0.208347 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2094  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.24 
 
 
368 aa  314  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5219  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.75 
 
 
380 aa  314  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1138  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.96 
 
 
368 aa  311  9e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0230317  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1865  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  46.93 
 
 
360 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1046  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.96 
 
 
368 aa  309  4e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758573  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1202  flavoprotein NADH-dependent oxidoreductase  45.28 
 
 
378 aa  308  8e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4760  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.4 
 
 
365 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000142373  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4210  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.63 
 
 
372 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1830  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.66 
 
 
358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.028835  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20830  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  45.71 
 
 
379 aa  304  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0458981  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2565  N-ethylmaleimide reductase  45.68 
 
 
365 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111821  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1871  N-ethylmaleimide reductase  45.68 
 
 
365 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554959  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1762  N-ethylmaleimide reductase  45.68 
 
 
365 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139789  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3143  oxidoreductase  44.23 
 
 
371 aa  302  5.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.683924  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1368  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45 
 
 
367 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4064  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.78 
 
 
376 aa  301  8.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2240  N-ethylmaleimide reductase, FMN-linked  44.63 
 
 
365 aa  301  9e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2445  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.43 
 
 
371 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05639  N-ethylmaleimide reductase  45.3 
 
 
366 aa  300  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2006  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.09 
 
 
364 aa  301  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0759  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.33 
 
 
373 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.882539  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1327  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.35 
 
 
364 aa  300  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1240  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.33 
 
 
373 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01763  GTN Reductase  45.28 
 
 
372 aa  300  3e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553032  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26130  morphinone reductase  43.53 
 
 
369 aa  299  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.243745  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000261  N-ethylmaleimide reductase  44.48 
 
 
366 aa  299  6e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0244  N-ethylmaleimide reductase  43.3 
 
 
367 aa  299  6e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2454  oxidoreductase, FMN-binding  44.44 
 
 
365 aa  298  7e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1721  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.41 
 
 
363 aa  297  2e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0508  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.11 
 
 
365 aa  297  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2986  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.12 
 
 
374 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0351108 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.08 
 
 
366 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0959  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.5 
 
 
349 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2229  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.35 
 
 
374 aa  295  6e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2725  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.66 
 
 
374 aa  295  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.245117  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4062  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.98 
 
 
462 aa  295  7e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00355793  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2202  N-ethylmaleimide reductase  44.72 
 
 
365 aa  295  7e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.209286  hitchhiker  0.0000409278 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1282  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.26 
 
 
349 aa  295  8e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0475  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.97 
 
 
365 aa  295  8e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.261593  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0473  NADH:flavin oxidoreductase  45.83 
 
 
368 aa  295  9e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37800  NADH:flavin xenobiotic reductase  44.82 
 
 
349 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0920  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.22 
 
 
349 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06498  NADH-flavin oxidoreductase  43.02 
 
 
363 aa  294  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2424  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.44 
 
 
371 aa  293  3e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.397481  normal  0.0764227 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2058  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.84 
 
 
363 aa  293  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0341  N-ethylmaleimide reductase  43.45 
 
 
366 aa  292  6e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000113831  hitchhiker  0.00000000671042 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0161  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.88 
 
 
369 aa  292  7e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1778  N-ethylmaleimide reductase  42.9 
 
 
385 aa  292  8e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1210  N-ethylmaleimide reductase  45.13 
 
 
353 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5271  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.69 
 
 
360 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1356  N-ethylmaleimide reductase  45.13 
 
 
353 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4808  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.65 
 
 
353 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.147658 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2474  N-ethylmaleimide reductase  45.13 
 
 
353 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.22498  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0340  N-ethylmaleimide reductase  45.13 
 
 
353 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0619  N-ethylmaleimide reductase  45.13 
 
 
353 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0951  N-ethylmaleimide reductase  45.13 
 
 
353 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1283  N-ethylmaleimide reductase  45.13 
 
 
353 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3350  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.5 
 
 
371 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.70851  normal  0.0716807 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0481  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.96 
 
 
369 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5643  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.48 
 
 
379 aa  290  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0423  FMN oxidoreductase protein  43.58 
 
 
364 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1796  N-ethylmaleimide reductase  44.29 
 
 
365 aa  289  5.0000000000000004e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.287349  normal  0.0323819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2173  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.13 
 
 
363 aa  289  6e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.789599  hitchhiker  0.00631395 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4754  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.92 
 
 
371 aa  289  7e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.750935 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2099  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.44 
 
 
366 aa  288  8e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.732064  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4736  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.13 
 
 
360 aa  288  8e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3110  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  41.05 
 
 
374 aa  288  9e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5299  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.23 
 
 
371 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.246787 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1120  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.14 
 
 
349 aa  288  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.395455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1546  N-ethylmaleimide reductase  44.29 
 
 
365 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2486  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  40.66 
 
 
374 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0454136  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4468  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.38 
 
 
349 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.101693 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1738  N-ethylmaleimide reductase  44.57 
 
 
365 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105113  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1245  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.28 
 
 
373 aa  287  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  0.298722 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1523  N-ethylmaleimide reductase  45.96 
 
 
353 aa  287  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512635  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5805  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.53 
 
 
353 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.452386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0986  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.54 
 
 
349 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000257245 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0473  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.74 
 
 
378 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2710  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.73 
 
 
366 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1907  N-ethylmaleimide reductase  44.01 
 
 
365 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0239  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.11 
 
 
371 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2277  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.51 
 
 
363 aa  286  4e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.178772 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4856  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.65 
 
 
371 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166947  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5413  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.65 
 
 
371 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2152  oxidoreductase, FMN-binding  44.93 
 
 
371 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5449  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.65 
 
 
371 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1977  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.53 
 
 
373 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4053  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.98 
 
 
349 aa  285  7e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477429  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1533  N-ethylmaleimide reductase  44.29 
 
 
365 aa  285  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.111843  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>