63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1074 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1074  PHP-like  100 
 
 		 242 aa  503  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1386  phosphotransferase domain-containing protein  43.22 
 
 		 245 aa  217  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.925309  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02476  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  45.19 
 
 		 222 aa  206  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.936539  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1179  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  40.52 
 
 		 241 aa  198  6e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.340445  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2997  phosphotransferase domain-containing protein  38.71 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5397  capsular polysaccharide biosynthesis protein  35.83 
 
 		 255 aa  148  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1496  capsular polysaccharide biosynthesis protein  37.07 
 
 		 280 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5450  putative tyrosine-protein phosphatase CapC  35.42 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.242753  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1154  capsular polysaccharide biosynthesis protein  32.22 
 
 		 256 aa  139  4.999999999999999e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  9.1637e-16 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3009  phosphotransferase domain-containing protein  36.21 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.559929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2136  phosphotransferase domain-containing protein  34.85 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.042777  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5072  protein-tyrosine-phosphatase  36.48 
 
 		 276 aa  135  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5395  putative tyrosine-protein phosphatase CapC  35.83 
 
 		 255 aa  135  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0318745  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5555  putative tyrosine-protein phosphatase CapC  35.71 
 
 		 276 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000949855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1979  phosphotransferase domain-containing protein  30.54 
 
 		 282 aa  132  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4957  phosphotyrosine-protein phosphatase (capsular polysaccharide biosynthesis)  35 
 
 		 258 aa  131  9e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000276779  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1540  capsular polysaccharide biosynthesis protein  32.08 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3384  Protein-tyrosine-phosphatase  33.33 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1034  protein-tyrosine-phosphatase  32.3 
 
 		 258 aa  128  6e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4109  Protein-tyrosine-phosphatase  31.91 
 
 		 266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306575 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1719  phosphotransferase domain-containing protein  33.05 
 
 		 261 aa  125  5e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1505  tyrosine-protein kinase  30.13 
 
 		 585 aa  124  9e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0243  capsular polysaccharide biosynthesis protein  32.86 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.321901  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0240  capsular polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2743  protein-tyrosine-phosphatase  31.95 
 
 		 255 aa  118  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2686  protein-tyrosine-phosphatase  31.95 
 
 		 255 aa  118  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1436  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.29 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0173771  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1656  protein-tyrosine-phosphatase  31.8 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1697  Protein-tyrosine-phosphatase  30.34 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0647662  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2245  PHP domain protein  30.5 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1275  PHP-like phosphoesterase  30.51 
 
 		 238 aa  108  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.227473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1972  PHP domain protein  29.92 
 
 		 253 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2446  PHP domain protein  36.41 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0184546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0137  protein-tyrosine-phosphatase  30.19 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0142  protein-tyrosine-phosphatase  30.19 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4195  protein-tyrosine-phosphatase  33.2 
 
 		 260 aa  102  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2654  PHP-like protein  28.57 
 
 		 236 aa  102  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5288  Protein-tyrosine-phosphatase  31.82 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2234  protein-tyrosine-phosphatase  29.77 
 
 		 259 aa  93.6  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1070  exopolysaccharide biosynthesis protein  29.1 
 
 		 243 aa  92.8  4e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.145277  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0067  PHP domain protein  27.09 
 
 		 245 aa  92.8  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.316218 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10718  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  28.14 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.932868  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6421  PHP domain protein  26.5 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1212  protein-tyrosine-phosphatase  26.05 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1174  capsular polysaccharide biosynthesis protein CpsB  27.04 
 
 		 243 aa  86.7  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3888  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.78 
 
 		 241 aa  87  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4993  phosphotransferase domain-containing protein  27.86 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.997402  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2079  PHP domain protein  26.5 
 
 		 223 aa  85.5  7e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.376107 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1671  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.88 
 
 		 268 aa  85.1  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.781877  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0650  exopolysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.893314  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0542  Protein-tyrosine-phosphatase  25.11 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0001  capsular polysaccharide biosythesis protein  27.32 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.42 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00492024  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4733  capsular polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.693573  decreased coverage  0.0000431784 
 
 
-
 
NC_002950  PG0435  capsular polysaccharide biosythesis protein, putative  24.52 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.115718 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1367  PHP-like protein  24.68 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0119686  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3447  PHP domain protein  31.98 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.711695  normal  0.0108575 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1341  protein-tyrosine phosphatase, putative  24.65 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3457  PHP domain protein  27.05 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0443415  normal  0.146498 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12780  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.45 
 
 		 208 aa  68.6  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0978  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.2 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0943  capsular polysaccharide synthesis enzyme CapC  23.92 
 
 		 212 aa  67  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1280  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.57 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>