63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1034 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1034  protein-tyrosine-phosphatase  100 
 
 
258 aa  538  9.999999999999999e-153  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1436  capsular polysaccharide biosynthesis protein  56.97 
 
 
256 aa  314  9.999999999999999e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0173771  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1154  capsular polysaccharide biosynthesis protein  55.04 
 
 
256 aa  306  3e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  9.1637e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5397  capsular polysaccharide biosynthesis protein  41.02 
 
 
255 aa  235  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5450  putative tyrosine-protein phosphatase CapC  41.02 
 
 
255 aa  235  7e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.242753  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3384  Protein-tyrosine-phosphatase  41.25 
 
 
254 aa  225  6e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5072  protein-tyrosine-phosphatase  41.02 
 
 
276 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5555  putative tyrosine-protein phosphatase CapC  41.02 
 
 
276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000949855  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4957  phosphotyrosine-protein phosphatase (capsular polysaccharide biosynthesis)  41.8 
 
 
258 aa  219  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000276779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5395  putative tyrosine-protein phosphatase CapC  41.02 
 
 
255 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0318745  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2997  phosphotransferase domain-containing protein  37.74 
 
 
270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2743  protein-tyrosine-phosphatase  39.32 
 
 
255 aa  187  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2686  protein-tyrosine-phosphatase  39.32 
 
 
255 aa  187  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0142  protein-tyrosine-phosphatase  34.77 
 
 
254 aa  172  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0137  protein-tyrosine-phosphatase  34.77 
 
 
254 aa  172  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4109  Protein-tyrosine-phosphatase  31.37 
 
 
266 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000306575 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1979  phosphotransferase domain-containing protein  34.73 
 
 
282 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1719  phosphotransferase domain-containing protein  33.46 
 
 
261 aa  159  6e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2234  protein-tyrosine-phosphatase  31.5 
 
 
259 aa  158  9e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1179  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  34.18 
 
 
241 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.340445  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1505  tyrosine-protein kinase  34.31 
 
 
585 aa  155  7e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1540  capsular polysaccharide biosynthesis protein  32.22 
 
 
235 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0243  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.67 
 
 
257 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.321901  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0240  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.67 
 
 
257 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3009  phosphotransferase domain-containing protein  32.74 
 
 
267 aa  135  9e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.559929  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2136  phosphotransferase domain-containing protein  32.51 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.042777  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1386  phosphotransferase domain-containing protein  32.24 
 
 
245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.925309  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1074  PHP-like  32.3 
 
 
242 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1275  PHP-like phosphoesterase  31.06 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.227473  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1496  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.96 
 
 
280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4195  protein-tyrosine-phosphatase  33.04 
 
 
260 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1697  Protein-tyrosine-phosphatase  29.67 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0647662  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2654  PHP-like protein  30.42 
 
 
236 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1367  PHP-like protein  28.82 
 
 
258 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0119686  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02476  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  32.02 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.936539  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1656  protein-tyrosine-phosphatase  30.04 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.98 
 
 
256 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00492024  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4993  phosphotransferase domain-containing protein  31.82 
 
 
245 aa  105  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.997402  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5288  Protein-tyrosine-phosphatase  30.25 
 
 
255 aa  105  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1671  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.34 
 
 
268 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.781877  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0001  capsular polysaccharide biosythesis protein  30.41 
 
 
225 aa  99  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0978  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.13 
 
 
272 aa  99  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6421  PHP domain protein  29.95 
 
 
255 aa  97.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850733  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3457  PHP domain protein  27.98 
 
 
260 aa  96.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0443415  normal  0.146498 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1972  PHP domain protein  27.76 
 
 
253 aa  95.9  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2245  PHP domain protein  25.7 
 
 
267 aa  91.3  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1212  protein-tyrosine-phosphatase  25.45 
 
 
241 aa  90.1  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0650  exopolysaccharide biosynthesis protein  27.11 
 
 
239 aa  88.6  9e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.893314  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0067  PHP domain protein  22.73 
 
 
245 aa  87.8  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.316218 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1174  capsular polysaccharide biosynthesis protein CpsB  26.64 
 
 
243 aa  87.8  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0542  Protein-tyrosine-phosphatase  23.3 
 
 
258 aa  87.4  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1070  exopolysaccharide biosynthesis protein  25.75 
 
 
243 aa  85.9  5e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.145277  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1341  protein-tyrosine phosphatase, putative  28.43 
 
 
253 aa  85.1  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0943  capsular polysaccharide synthesis enzyme CapC  32.74 
 
 
212 aa  84  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10718  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  28.28 
 
 
246 aa  80.5  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.932868  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3447  PHP domain protein  28.5 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.711695  normal  0.0108575 
 
 
-
 
NC_002950  PG0435  capsular polysaccharide biosythesis protein, putative  28.5 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.115718 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3888  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.17 
 
 
241 aa  74.7  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4733  capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.32 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.693573  decreased coverage  0.0000431784 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2079  PHP domain protein  26.21 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.376107 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2446  PHP domain protein  27.31 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0184546  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12780  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1280  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.19 
 
 
216 aa  56.6  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>