63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1671 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1671  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  100 
 
 		 268 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.781877  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0650  exopolysaccharide biosynthesis protein  45.89 
 
 		 239 aa  212  5.999999999999999e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.893314  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  39.33 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00492024  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2245  PHP domain protein  40.43 
 
 		 267 aa  172  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1972  PHP domain protein  39.22 
 
 		 253 aa  165  8e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10718  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  28.87 
 
 		 246 aa  112  8.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.932868  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5397  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.24 
 
 		 255 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1496  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.9 
 
 		 280 aa  106  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4993  phosphotransferase domain-containing protein  30 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.997402  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5450  putative tyrosine-protein phosphatase CapC  30.28 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.242753  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0243  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.39 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.321901  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6421  PHP domain protein  28.27 
 
 		 255 aa  105  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1034  protein-tyrosine-phosphatase  28.34 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0240  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.39 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5072  protein-tyrosine-phosphatase  38.62 
 
 		 276 aa  102  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1979  phosphotransferase domain-containing protein  28.91 
 
 		 282 aa  102  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1154  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.26 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  9.1637e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5395  putative tyrosine-protein phosphatase CapC  40.43 
 
 		 255 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0318745  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1367  PHP-like protein  27.95 
 
 		 258 aa  99.4  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0119686  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3384  Protein-tyrosine-phosphatase  28.86 
 
 		 254 aa  99.4  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2997  phosphotransferase domain-containing protein  30.43 
 
 		 270 aa  99  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4957  phosphotyrosine-protein phosphatase (capsular polysaccharide biosynthesis)  39.16 
 
 		 258 aa  99  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000276779  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0001  capsular polysaccharide biosythesis protein  26.01 
 
 		 225 aa  98.6  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0067  PHP domain protein  27.43 
 
 		 245 aa  98.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.316218 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4109  Protein-tyrosine-phosphatase  29.26 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306575 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5555  putative tyrosine-protein phosphatase CapC  38.46 
 
 		 276 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000949855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2654  PHP-like protein  29.26 
 
 		 236 aa  97.4  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2079  PHP domain protein  28.63 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.376107 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2234  protein-tyrosine-phosphatase  26.89 
 
 		 259 aa  95.5  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3009  phosphotransferase domain-containing protein  29.11 
 
 		 267 aa  95.1  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.559929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2743  protein-tyrosine-phosphatase  27.23 
 
 		 255 aa  92.4  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2686  protein-tyrosine-phosphatase  27.23 
 
 		 255 aa  92.4  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1341  protein-tyrosine phosphatase, putative  27.39 
 
 		 253 aa  89.4  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1719  phosphotransferase domain-containing protein  28.51 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1436  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.07 
 
 		 256 aa  86.3  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0173771  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4195  protein-tyrosine-phosphatase  27.66 
 
 		 260 aa  85.9  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1656  protein-tyrosine-phosphatase  27.63 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1074  PHP-like  28.88 
 
 		 242 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0435  capsular polysaccharide biosythesis protein, putative  27 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.115718 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0542  Protein-tyrosine-phosphatase  30.94 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1505  tyrosine-protein kinase  32.17 
 
 		 585 aa  79  0.00000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4733  capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.89 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.693573  decreased coverage  0.0000431784 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1179  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  25.32 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.340445  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3457  PHP domain protein  27.59 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0443415  normal  0.146498 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0137  protein-tyrosine-phosphatase  24.02 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0142  protein-tyrosine-phosphatase  24.02 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1275  PHP-like phosphoesterase  25.33 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.227473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3888  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.11 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1697  Protein-tyrosine-phosphatase  25.1 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0647662  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2446  PHP domain protein  25 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0184546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1540  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.2 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1386  phosphotransferase domain-containing protein  25.43 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.925309  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1212  protein-tyrosine-phosphatase  25.11 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1174  capsular polysaccharide biosynthesis protein CpsB  25 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0978  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.81 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3447  PHP domain protein  33.33 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.711695  normal  0.0108575 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0943  capsular polysaccharide synthesis enzyme CapC  28.99 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2136  phosphotransferase domain-containing protein  27.35 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.042777  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1070  exopolysaccharide biosynthesis protein  27.34 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.145277  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5288  Protein-tyrosine-phosphatase  24.03 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12780  capsular polysaccharide biosynthesis protein  28.81 
 
 		 208 aa  54.7  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02476  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  23.19 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.936539  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1280  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  20.74 
 
 		 216 aa  45.4  0.0009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>