62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2245 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2245  PHP domain protein  100 
 
 		 267 aa  541  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1972  PHP domain protein  64.66 
 
 		 253 aa  321  7e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0650  exopolysaccharide biosynthesis protein  38.3 
 
 		 239 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.893314  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1671  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  40.43 
 
 		 268 aa  172  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.781877  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  40.66 
 
 		 256 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00492024  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6421  PHP domain protein  31.74 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850733  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1179  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  31.4 
 
 		 241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.340445  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1074  PHP-like  30.5 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0067  PHP domain protein  28.82 
 
 		 245 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.316218 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4993  phosphotransferase domain-containing protein  27.88 
 
 		 245 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.997402  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0240  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.49 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0243  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.6 
 
 		 257 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.321901  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2997  phosphotransferase domain-containing protein  28.2 
 
 		 270 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4109  Protein-tyrosine-phosphatase  31.22 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306575 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1496  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.89 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4733  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.77 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.693573  decreased coverage  0.0000431784 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3009  phosphotransferase domain-containing protein  28.52 
 
 		 267 aa  98.6  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.559929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1154  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.94 
 
 		 256 aa  96.7  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  9.1637e-16 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1719  phosphotransferase domain-containing protein  32.13 
 
 		 261 aa  95.1  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1505  tyrosine-protein kinase  29.2 
 
 		 585 aa  94  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1034  protein-tyrosine-phosphatase  25.7 
 
 		 258 aa  91.3  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1367  PHP-like protein  28.83 
 
 		 258 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0119686  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10718  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  26.15 
 
 		 246 aa  91.3  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.932868  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5288  Protein-tyrosine-phosphatase  30.5 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0435  capsular polysaccharide biosythesis protein, putative  29.57 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.115718 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3457  PHP domain protein  32.59 
 
 		 260 aa  90.1  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0443415  normal  0.146498 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3888  capsular polysaccharide biosynthesis protein  28.95 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1386  phosphotransferase domain-containing protein  25.73 
 
 		 245 aa  87  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.925309  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1979  phosphotransferase domain-containing protein  26.98 
 
 		 282 aa  86.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1540  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.83 
 
 		 235 aa  85.5  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5450  putative tyrosine-protein phosphatase CapC  26.19 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.242753  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02476  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  25.42 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.936539  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5072  protein-tyrosine-phosphatase  27.56 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2079  PHP domain protein  28.9 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.376107 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2234  protein-tyrosine-phosphatase  25.56 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3447  PHP domain protein  30.48 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.711695  normal  0.0108575 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2654  PHP-like protein  25.6 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1341  protein-tyrosine phosphatase, putative  28.69 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0001  capsular polysaccharide biosythesis protein  25.93 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5397  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.79 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1436  capsular polysaccharide biosynthesis protein  28.05 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0173771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5555  putative tyrosine-protein phosphatase CapC  26.16 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000949855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3384  Protein-tyrosine-phosphatase  27.35 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1656  protein-tyrosine-phosphatase  28.22 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4957  phosphotyrosine-protein phosphatase (capsular polysaccharide biosynthesis)  26.77 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000276779  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4195  protein-tyrosine-phosphatase  27.8 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5395  putative tyrosine-protein phosphatase CapC  26.59 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0318745  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2136  phosphotransferase domain-containing protein  28.91 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.042777  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2446  PHP domain protein  30.22 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0184546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1275  PHP-like phosphoesterase  24.8 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.227473  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1174  capsular polysaccharide biosynthesis protein CpsB  26.51 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1697  Protein-tyrosine-phosphatase  27.23 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0647662  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0978  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.41 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0142  protein-tyrosine-phosphatase  22.12 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0137  protein-tyrosine-phosphatase  22.12 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2743  protein-tyrosine-phosphatase  23.14 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2686  protein-tyrosine-phosphatase  23.14 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1212  protein-tyrosine-phosphatase  21.91 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0542  Protein-tyrosine-phosphatase  25.9 
 
 		 258 aa  62  0.000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12780  capsular polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 208 aa  53.9  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1070  exopolysaccharide biosynthesis protein  23.29 
 
 		 243 aa  52.4  0.000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.145277  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0943  capsular polysaccharide synthesis enzyme CapC  21.36 
 
 		 212 aa  42  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>