63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1154 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1154  capsular polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
256 aa  532  1e-150  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  9.1637e-16 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1034  protein-tyrosine-phosphatase  55.04 
 
 
258 aa  306  3e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1436  capsular polysaccharide biosynthesis protein  54.69 
 
 
256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0173771  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5450  putative tyrosine-protein phosphatase CapC  38.04 
 
 
255 aa  198  7e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.242753  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5397  capsular polysaccharide biosynthesis protein  37.65 
 
 
255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5555  putative tyrosine-protein phosphatase CapC  39.22 
 
 
276 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000949855  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3384  Protein-tyrosine-phosphatase  40.08 
 
 
254 aa  188  8e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5395  putative tyrosine-protein phosphatase CapC  39.61 
 
 
255 aa  187  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0318745  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5072  protein-tyrosine-phosphatase  38.82 
 
 
276 aa  182  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4957  phosphotyrosine-protein phosphatase (capsular polysaccharide biosynthesis)  38.82 
 
 
258 aa  182  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000276779  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4109  Protein-tyrosine-phosphatase  35.43 
 
 
266 aa  172  5e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000306575 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2997  phosphotransferase domain-containing protein  37.16 
 
 
270 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2743  protein-tyrosine-phosphatase  35.74 
 
 
255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2686  protein-tyrosine-phosphatase  35.74 
 
 
255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1719  phosphotransferase domain-containing protein  36.32 
 
 
261 aa  162  6e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1979  phosphotransferase domain-containing protein  33.05 
 
 
282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0243  capsular polysaccharide biosynthesis protein  36.52 
 
 
257 aa  149  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.321901  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1505  tyrosine-protein kinase  35.42 
 
 
585 aa  148  7e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1179  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  35.24 
 
 
241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.340445  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2136  phosphotransferase domain-containing protein  36.69 
 
 
253 aa  145  6e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.042777  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0240  capsular polysaccharide biosynthesis protein  35.22 
 
 
257 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2234  protein-tyrosine-phosphatase  32.28 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1074  PHP-like  32.22 
 
 
242 aa  139  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0137  protein-tyrosine-phosphatase  33.76 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0142  protein-tyrosine-phosphatase  33.76 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3009  phosphotransferase domain-containing protein  35.32 
 
 
267 aa  133  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.559929  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1275  PHP-like phosphoesterase  33.33 
 
 
238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.227473  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1540  capsular polysaccharide biosynthesis protein  36.16 
 
 
235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1386  phosphotransferase domain-containing protein  31.78 
 
 
245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.925309  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1496  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.8 
 
 
280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1697  Protein-tyrosine-phosphatase  29.69 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0647662  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.89 
 
 
256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00492024  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1367  PHP-like protein  32.66 
 
 
258 aa  111  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0119686  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1656  protein-tyrosine-phosphatase  30.57 
 
 
228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2654  PHP-like protein  29.91 
 
 
236 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02476  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  30.57 
 
 
222 aa  103  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.936539  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4993  phosphotransferase domain-containing protein  27.83 
 
 
245 aa  102  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.997402  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1671  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  29.26 
 
 
268 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.781877  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4195  protein-tyrosine-phosphatase  29.12 
 
 
260 aa  99.8  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6421  PHP domain protein  29.59 
 
 
255 aa  99  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850733  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0978  capsular polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 
272 aa  98.6  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2245  PHP domain protein  27.94 
 
 
267 aa  96.7  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1972  PHP domain protein  28.57 
 
 
253 aa  96.7  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1212  protein-tyrosine-phosphatase  28.88 
 
 
241 aa  95.9  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5288  Protein-tyrosine-phosphatase  30.52 
 
 
255 aa  95.9  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0542  Protein-tyrosine-phosphatase  27.41 
 
 
258 aa  95.9  6e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10718  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  28.43 
 
 
246 aa  94.4  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.932868  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0067  PHP domain protein  24.75 
 
 
245 aa  92.8  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.316218 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0650  exopolysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 
239 aa  90.1  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.893314  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1070  exopolysaccharide biosynthesis protein  28.93 
 
 
243 aa  89.7  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.145277  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1174  capsular polysaccharide biosynthesis protein CpsB  29.34 
 
 
243 aa  87.8  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0001  capsular polysaccharide biosythesis protein  26.01 
 
 
225 aa  87  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3457  PHP domain protein  28.08 
 
 
260 aa  85.1  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0443415  normal  0.146498 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2079  PHP domain protein  29.15 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.376107 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4733  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.693573  decreased coverage  0.0000431784 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2446  PHP domain protein  31.11 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0184546  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3447  PHP domain protein  28.57 
 
 
240 aa  75.1  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.711695  normal  0.0108575 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0943  capsular polysaccharide synthesis enzyme CapC  29.67 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3888  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.51 
 
 
241 aa  68.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0435  capsular polysaccharide biosythesis protein, putative  26.57 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.115718 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1341  protein-tyrosine phosphatase, putative  25.35 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12780  capsular polysaccharide biosynthesis protein  28.5 
 
 
208 aa  64.3  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1280  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.79 
 
 
216 aa  51.2  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>