63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0240 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0240  capsular polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
257 aa  521  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0243  capsular polysaccharide biosynthesis protein  97.67 
 
 
257 aa  495  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.321901  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4109  Protein-tyrosine-phosphatase  36.82 
 
 
266 aa  164  9e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000306575 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3384  Protein-tyrosine-phosphatase  37.25 
 
 
254 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5450  putative tyrosine-protein phosphatase CapC  38.03 
 
 
255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.242753  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5397  capsular polysaccharide biosynthesis protein  37.67 
 
 
255 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2234  protein-tyrosine-phosphatase  34.6 
 
 
259 aa  156  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2743  protein-tyrosine-phosphatase  37.8 
 
 
255 aa  155  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2686  protein-tyrosine-phosphatase  37.8 
 
 
255 aa  155  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5395  putative tyrosine-protein phosphatase CapC  40.85 
 
 
255 aa  155  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0318745  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2997  phosphotransferase domain-containing protein  35.42 
 
 
270 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5072  protein-tyrosine-phosphatase  40.85 
 
 
276 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4957  phosphotyrosine-protein phosphatase (capsular polysaccharide biosynthesis)  39.53 
 
 
258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000276779  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1436  capsular polysaccharide biosynthesis protein  35.32 
 
 
256 aa  151  8e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0173771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5555  putative tyrosine-protein phosphatase CapC  39.44 
 
 
276 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000949855  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1034  protein-tyrosine-phosphatase  32.56 
 
 
258 aa  149  4e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1154  capsular polysaccharide biosynthesis protein  33.07 
 
 
256 aa  149  6e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  9.1637e-16 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0142  protein-tyrosine-phosphatase  35.48 
 
 
254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0137  protein-tyrosine-phosphatase  35.48 
 
 
254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1719  phosphotransferase domain-containing protein  30.04 
 
 
261 aa  145  9e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1367  PHP-like protein  33.33 
 
 
258 aa  143  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0119686  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1697  Protein-tyrosine-phosphatase  29.8 
 
 
258 aa  143  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0647662  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1505  tyrosine-protein kinase  32.23 
 
 
585 aa  140  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1979  phosphotransferase domain-containing protein  28.46 
 
 
282 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1386  phosphotransferase domain-containing protein  33.48 
 
 
245 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.925309  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3009  phosphotransferase domain-containing protein  32.56 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.559929  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6421  PHP domain protein  34.69 
 
 
255 aa  132  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850733  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1275  PHP-like phosphoesterase  33.74 
 
 
238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.227473  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1212  protein-tyrosine-phosphatase  34.31 
 
 
241 aa  128  7.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0067  PHP domain protein  34.52 
 
 
245 aa  128  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.316218 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1540  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.92 
 
 
235 aa  125  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1656  protein-tyrosine-phosphatase  32.54 
 
 
228 aa  124  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1074  PHP-like  33.33 
 
 
242 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0542  Protein-tyrosine-phosphatase  32.21 
 
 
258 aa  122  8e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1179  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  30.77 
 
 
241 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.340445  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4993  phosphotransferase domain-containing protein  33 
 
 
245 aa  121  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.997402  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2654  PHP-like protein  35.96 
 
 
236 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2136  phosphotransferase domain-containing protein  29.72 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.042777  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4195  protein-tyrosine-phosphatase  29.34 
 
 
260 aa  117  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1174  capsular polysaccharide biosynthesis protein CpsB  32.93 
 
 
243 aa  116  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0001  capsular polysaccharide biosythesis protein  30.38 
 
 
225 aa  112  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1496  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.63 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1070  exopolysaccharide biosynthesis protein  30.58 
 
 
243 aa  110  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.145277  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5288  Protein-tyrosine-phosphatase  28.97 
 
 
255 aa  108  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2245  PHP domain protein  30.49 
 
 
267 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 
256 aa  106  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00492024  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1671  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.39 
 
 
268 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.781877  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10718  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  32.34 
 
 
246 aa  103  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.932868  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1972  PHP domain protein  28.07 
 
 
253 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3888  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.5 
 
 
241 aa  102  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2079  PHP domain protein  29.95 
 
 
223 aa  97.4  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.376107 
 
 
-
 
NC_002950  PG0435  capsular polysaccharide biosythesis protein, putative  31.13 
 
 
247 aa  96.7  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.115718 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4733  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.09 
 
 
255 aa  92  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.693573  decreased coverage  0.0000431784 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12780  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.85 
 
 
208 aa  88.6  8e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0943  capsular polysaccharide synthesis enzyme CapC  30.43 
 
 
212 aa  87.8  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0650  exopolysaccharide biosynthesis protein  24.89 
 
 
239 aa  87.4  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.893314  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2446  PHP domain protein  30.5 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0184546  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0978  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.58 
 
 
272 aa  82  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3447  PHP domain protein  27.27 
 
 
240 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.711695  normal  0.0108575 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1341  protein-tyrosine phosphatase, putative  25.31 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02476  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.74 
 
 
222 aa  78.2  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.936539  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3457  PHP domain protein  24.77 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0443415  normal  0.146498 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1280  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.72 
 
 
216 aa  51.2  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>