63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0067 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0067  PHP domain protein  100 
 
 
245 aa  511  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.316218 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0001  capsular polysaccharide biosythesis protein  40.57 
 
 
225 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3888  capsular polysaccharide biosynthesis protein  38.59 
 
 
241 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4993  phosphotransferase domain-containing protein  44.23 
 
 
245 aa  181  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.997402  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4733  capsular polysaccharide biosynthesis protein  39.57 
 
 
255 aa  181  8.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.693573  decreased coverage  0.0000431784 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10718  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  40.59 
 
 
246 aa  176  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.932868  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6421  PHP domain protein  38.5 
 
 
255 aa  169  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850733  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0240  capsular polysaccharide biosynthesis protein  34.52 
 
 
257 aa  128  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0243  capsular polysaccharide biosynthesis protein  34.01 
 
 
257 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.321901  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1341  protein-tyrosine phosphatase, putative  36.27 
 
 
253 aa  119  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1540  capsular polysaccharide biosynthesis protein  32.34 
 
 
235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1367  PHP-like protein  34.01 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0119686  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1719  phosphotransferase domain-containing protein  33.5 
 
 
261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2079  PHP domain protein  32.32 
 
 
223 aa  115  8.999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.376107 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4109  Protein-tyrosine-phosphatase  34.69 
 
 
266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000306575 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2654  PHP-like protein  28.97 
 
 
236 aa  112  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2997  phosphotransferase domain-containing protein  31.63 
 
 
270 aa  112  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0435  capsular polysaccharide biosythesis protein, putative  34.34 
 
 
247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.115718 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2245  PHP domain protein  28.82 
 
 
267 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2686  protein-tyrosine-phosphatase  29.52 
 
 
255 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2743  protein-tyrosine-phosphatase  29.52 
 
 
255 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1697  Protein-tyrosine-phosphatase  33.17 
 
 
258 aa  106  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0647662  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  28.14 
 
 
256 aa  104  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00492024  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1436  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.21 
 
 
256 aa  100  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0173771  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1496  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31 
 
 
280 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1671  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.43 
 
 
268 aa  98.6  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.781877  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0650  exopolysaccharide biosynthesis protein  30.32 
 
 
239 aa  98.6  9e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.893314  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1179  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  29.21 
 
 
241 aa  97.4  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.340445  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1386  phosphotransferase domain-containing protein  29.21 
 
 
245 aa  97.8  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.925309  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1979  phosphotransferase domain-containing protein  27 
 
 
282 aa  96.7  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1212  protein-tyrosine-phosphatase  32.99 
 
 
241 aa  96.7  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1972  PHP domain protein  26.11 
 
 
253 aa  94.7  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3447  PHP domain protein  32.26 
 
 
240 aa  95.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.711695  normal  0.0108575 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2136  phosphotransferase domain-containing protein  27.45 
 
 
253 aa  94.7  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.042777  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1505  tyrosine-protein kinase  26.13 
 
 
585 aa  94.4  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2234  protein-tyrosine-phosphatase  27.04 
 
 
259 aa  93.6  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1154  capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.75 
 
 
256 aa  92.8  4e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  9.1637e-16 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0542  Protein-tyrosine-phosphatase  31.47 
 
 
258 aa  92.4  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1074  PHP-like  27.09 
 
 
242 aa  92.8  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3384  Protein-tyrosine-phosphatase  29.74 
 
 
254 aa  92  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1656  protein-tyrosine-phosphatase  31.34 
 
 
228 aa  90.5  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2446  PHP domain protein  27.95 
 
 
217 aa  89.4  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0184546  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0142  protein-tyrosine-phosphatase  28.93 
 
 
254 aa  88.6  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0137  protein-tyrosine-phosphatase  28.93 
 
 
254 aa  88.6  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3009  phosphotransferase domain-containing protein  28.06 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.559929  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1034  protein-tyrosine-phosphatase  22.73 
 
 
258 aa  87.8  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5288  Protein-tyrosine-phosphatase  28.21 
 
 
255 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5450  putative tyrosine-protein phosphatase CapC  26.53 
 
 
255 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.242753  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1275  PHP-like phosphoesterase  27.18 
 
 
238 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.227473  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5397  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4195  protein-tyrosine-phosphatase  25.38 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3457  PHP domain protein  28.64 
 
 
260 aa  82  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0443415  normal  0.146498 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0943  capsular polysaccharide synthesis enzyme CapC  28.25 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1174  capsular polysaccharide biosynthesis protein CpsB  26.96 
 
 
243 aa  77.8  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5395  putative tyrosine-protein phosphatase CapC  28.06 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0318745  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5072  protein-tyrosine-phosphatase  28.14 
 
 
276 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4957  phosphotyrosine-protein phosphatase (capsular polysaccharide biosynthesis)  29.8 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000276779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5555  putative tyrosine-protein phosphatase CapC  27.04 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000949855  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1070  exopolysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.145277  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12780  capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.41 
 
 
208 aa  64.3  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02476  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.59 
 
 
222 aa  63.2  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.936539  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0978  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.5 
 
 
272 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1280  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  23.02 
 
 
216 aa  45.8  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>