63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3447 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3447  PHP domain protein  100 
 
 
240 aa  474  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.711695  normal  0.0108575 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10718  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  31.63 
 
 
246 aa  112  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.932868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5450  putative tyrosine-protein phosphatase CapC  29.96 
 
 
255 aa  111  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.242753  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0067  PHP domain protein  30.84 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.316218 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1719  phosphotransferase domain-containing protein  36.82 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1496  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.82 
 
 
280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0001  capsular polysaccharide biosythesis protein  29.06 
 
 
225 aa  109  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1367  PHP-like protein  28.45 
 
 
258 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0119686  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3009  phosphotransferase domain-containing protein  30.13 
 
 
267 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.559929  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4993  phosphotransferase domain-containing protein  28.07 
 
 
245 aa  106  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.997402  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5397  capsular polysaccharide biosynthesis protein  28.81 
 
 
255 aa  105  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5072  protein-tyrosine-phosphatase  30.67 
 
 
276 aa  105  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4957  phosphotyrosine-protein phosphatase (capsular polysaccharide biosynthesis)  30.25 
 
 
258 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000276779  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2654  PHP-like protein  24.14 
 
 
236 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2997  phosphotransferase domain-containing protein  30.8 
 
 
270 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5555  putative tyrosine-protein phosphatase CapC  29.41 
 
 
276 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000949855  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4733  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.26 
 
 
255 aa  102  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.693573  decreased coverage  0.0000431784 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1179  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  30.8 
 
 
241 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.340445  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5395  putative tyrosine-protein phosphatase CapC  29.11 
 
 
255 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0318745  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6421  PHP domain protein  31 
 
 
255 aa  97.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850733  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1540  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.64 
 
 
235 aa  97.4  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0243  capsular polysaccharide biosynthesis protein  28.43 
 
 
257 aa  97.1  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.321901  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3384  Protein-tyrosine-phosphatase  30.41 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0240  capsular polysaccharide biosynthesis protein  28.43 
 
 
257 aa  96.3  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1436  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.43 
 
 
256 aa  95.1  8e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0173771  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4195  protein-tyrosine-phosphatase  31.8 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2245  PHP domain protein  30.8 
 
 
267 aa  95.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1034  protein-tyrosine-phosphatase  26.86 
 
 
258 aa  93.2  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1174  capsular polysaccharide biosynthesis protein CpsB  27.39 
 
 
243 aa  92  8e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2686  protein-tyrosine-phosphatase  28.71 
 
 
255 aa  92  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2743  protein-tyrosine-phosphatase  28.71 
 
 
255 aa  92  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1212  protein-tyrosine-phosphatase  25.64 
 
 
241 aa  91.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4109  Protein-tyrosine-phosphatase  32.16 
 
 
266 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000306575 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1972  PHP domain protein  29.34 
 
 
253 aa  89  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1979  phosphotransferase domain-containing protein  28.03 
 
 
282 aa  88.2  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1154  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.5 
 
 
256 aa  88.2  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  9.1637e-16 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0142  protein-tyrosine-phosphatase  25.25 
 
 
254 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0137  protein-tyrosine-phosphatase  25.25 
 
 
254 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3888  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.29 
 
 
241 aa  85.1  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1070  exopolysaccharide biosynthesis protein  26.56 
 
 
243 aa  84.7  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.145277  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5288  Protein-tyrosine-phosphatase  33.61 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3457  PHP domain protein  32.79 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0443415  normal  0.146498 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2079  PHP domain protein  32.84 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.376107 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1074  PHP-like  30.5 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2234  protein-tyrosine-phosphatase  24.15 
 
 
259 aa  83.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1505  tyrosine-protein kinase  25.82 
 
 
585 aa  83.6  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0435  capsular polysaccharide biosythesis protein, putative  29.5 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.115718 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00492024  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1275  PHP-like phosphoesterase  28.81 
 
 
238 aa  79  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.227473  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0650  exopolysaccharide biosynthesis protein  25.33 
 
 
239 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.893314  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2136  phosphotransferase domain-containing protein  28.22 
 
 
253 aa  75.5  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.042777  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0542  Protein-tyrosine-phosphatase  23.73 
 
 
258 aa  75.1  0.0000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1697  Protein-tyrosine-phosphatase  29.21 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0647662  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1671  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.19 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.781877  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1386  phosphotransferase domain-containing protein  25.5 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.925309  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2446  PHP domain protein  28.84 
 
 
217 aa  72  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0184546  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1656  protein-tyrosine-phosphatase  29.29 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1341  protein-tyrosine phosphatase, putative  28.83 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12780  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.76 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0978  capsular polysaccharide biosynthesis protein  32.5 
 
 
272 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0943  capsular polysaccharide synthesis enzyme CapC  22.5 
 
 
212 aa  65.1  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1280  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.84 
 
 
216 aa  55.1  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02476  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  27.61 
 
 
222 aa  54.3  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.936539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>