53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1280 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1280  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  100 
 
 
216 aa  440  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0943  capsular polysaccharide synthesis enzyme CapC  56.81 
 
 
212 aa  259  2e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0001  capsular polysaccharide biosythesis protein  28.27 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6421  PHP domain protein  28.57 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850733  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4993  phosphotransferase domain-containing protein  25.39 
 
 
245 aa  67  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.997402  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1540  capsular polysaccharide biosynthesis protein  22.51 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0435  capsular polysaccharide biosythesis protein, putative  28.32 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.115718 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1212  protein-tyrosine-phosphatase  26.11 
 
 
241 aa  62.8  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1719  phosphotransferase domain-containing protein  24.23 
 
 
261 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1341  protein-tyrosine phosphatase, putative  26.79 
 
 
253 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2234  protein-tyrosine-phosphatase  22.88 
 
 
259 aa  56.6  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0542  Protein-tyrosine-phosphatase  26.49 
 
 
258 aa  56.6  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1034  protein-tyrosine-phosphatase  26.19 
 
 
258 aa  56.6  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2446  PHP domain protein  25.93 
 
 
217 aa  56.2  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0184546  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10718  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  21.65 
 
 
246 aa  56.2  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.932868  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3457  PHP domain protein  22.07 
 
 
260 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0443415  normal  0.146498 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0240  capsular polysaccharide biosynthesis protein  22.17 
 
 
257 aa  55.1  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4733  capsular polysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 
255 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.693573  decreased coverage  0.0000431784 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0243  capsular polysaccharide biosynthesis protein  22.28 
 
 
257 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.321901  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2997  phosphotransferase domain-containing protein  22.94 
 
 
270 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1367  PHP-like protein  27.27 
 
 
258 aa  52.8  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0119686  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2686  protein-tyrosine-phosphatase  24.34 
 
 
255 aa  52  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1154  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.47 
 
 
256 aa  52  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  9.1637e-16 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2743  protein-tyrosine-phosphatase  24.34 
 
 
255 aa  52  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3009  phosphotransferase domain-containing protein  24.31 
 
 
267 aa  52  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.559929  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3447  PHP domain protein  25.71 
 
 
240 aa  51.6  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.711695  normal  0.0108575 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1436  capsular polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 
256 aa  51.2  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0173771  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0142  protein-tyrosine-phosphatase  24.57 
 
 
254 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0137  protein-tyrosine-phosphatase  24.57 
 
 
254 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2079  PHP domain protein  26.7 
 
 
223 aa  51.2  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.376107 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.83 
 
 
256 aa  51.2  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00492024  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3888  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.25 
 
 
241 aa  51.2  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0978  capsular polysaccharide biosynthesis protein  22.07 
 
 
272 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1656  protein-tyrosine-phosphatase  19.58 
 
 
228 aa  49.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5072  protein-tyrosine-phosphatase  20.92 
 
 
276 aa  48.5  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1074  PHP-like  28.57 
 
 
242 aa  48.5  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1697  Protein-tyrosine-phosphatase  21.84 
 
 
258 aa  48.1  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0647662  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0067  PHP domain protein  20.73 
 
 
245 aa  48.1  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.316218 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5450  putative tyrosine-protein phosphatase CapC  21.57 
 
 
255 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.242753  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5288  Protein-tyrosine-phosphatase  24.29 
 
 
255 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4957  phosphotyrosine-protein phosphatase (capsular polysaccharide biosynthesis)  21.57 
 
 
258 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000276779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5395  putative tyrosine-protein phosphatase CapC  22.22 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0318745  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4109  Protein-tyrosine-phosphatase  22.07 
 
 
266 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000306575 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1671  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  20.74 
 
 
268 aa  46.6  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.781877  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2654  PHP-like protein  22.05 
 
 
236 aa  46.6  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1386  phosphotransferase domain-containing protein  22.22 
 
 
245 aa  46.6  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.925309  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5555  putative tyrosine-protein phosphatase CapC  20.26 
 
 
276 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000949855  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1070  exopolysaccharide biosynthesis protein  24.68 
 
 
243 aa  45.8  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.145277  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3384  Protein-tyrosine-phosphatase  21.51 
 
 
254 aa  45.4  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4195  protein-tyrosine-phosphatase  24.65 
 
 
260 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1505  tyrosine-protein kinase  20.12 
 
 
585 aa  42.7  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12780  capsular polysaccharide biosynthesis protein  22.54 
 
 
208 aa  42.4  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1496  capsular polysaccharide biosynthesis protein  20.44 
 
 
280 aa  42.4  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>