63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1367 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1367  PHP-like protein  100 
 
 		 258 aa  529  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0119686  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2234  protein-tyrosine-phosphatase  33.72 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0542  Protein-tyrosine-phosphatase  33.84 
 
 		 258 aa  155  7e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1540  capsular polysaccharide biosynthesis protein  35.66 
 
 		 235 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5450  putative tyrosine-protein phosphatase CapC  32.43 
 
 		 255 aa  145  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.242753  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2743  protein-tyrosine-phosphatase  35.61 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2686  protein-tyrosine-phosphatase  35.61 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3384  Protein-tyrosine-phosphatase  34.5 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1719  phosphotransferase domain-containing protein  31.56 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0243  capsular polysaccharide biosynthesis protein  38.05 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.321901  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0240  capsular polysaccharide biosynthesis protein  37.56 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2997  phosphotransferase domain-containing protein  31.25 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5397  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.27 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1979  phosphotransferase domain-containing protein  28.68 
 
 		 282 aa  139  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1496  capsular polysaccharide biosynthesis protein  33.05 
 
 		 280 aa  138  7.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5555  putative tyrosine-protein phosphatase CapC  32.43 
 
 		 276 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000949855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0137  protein-tyrosine-phosphatase  33.82 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0142  protein-tyrosine-phosphatase  33.82 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5072  protein-tyrosine-phosphatase  32.43 
 
 		 276 aa  136  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4109  Protein-tyrosine-phosphatase  31.82 
 
 		 266 aa  136  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306575 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4957  phosphotyrosine-protein phosphatase (capsular polysaccharide biosynthesis)  32.05 
 
 		 258 aa  135  8e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000276779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5395  putative tyrosine-protein phosphatase CapC  32.05 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0318745  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1697  Protein-tyrosine-phosphatase  29.12 
 
 		 258 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0647662  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4195  protein-tyrosine-phosphatase  27.39 
 
 		 260 aa  131  9e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4993  phosphotransferase domain-containing protein  33.67 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.997402  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1212  protein-tyrosine-phosphatase  33.06 
 
 		 241 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3009  phosphotransferase domain-containing protein  30.86 
 
 		 267 aa  123  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.559929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6421  PHP domain protein  31.98 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2654  PHP-like protein  35.18 
 
 		 236 aa  122  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0001  capsular polysaccharide biosythesis protein  32.83 
 
 		 225 aa  122  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2136  phosphotransferase domain-containing protein  29.39 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.042777  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1179  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  29.41 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.340445  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0067  PHP domain protein  34.01 
 
 		 245 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.316218 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1034  protein-tyrosine-phosphatase  28.82 
 
 		 258 aa  115  8.999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1174  capsular polysaccharide biosynthesis protein CpsB  31.15 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1154  capsular polysaccharide biosynthesis protein  32.66 
 
 		 256 aa  111  9e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  9.1637e-16 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0978  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.46 
 
 		 272 aa  109  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10718  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  31.34 
 
 		 246 aa  108  8.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.932868  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1505  tyrosine-protein kinase  30.88 
 
 		 585 aa  108  9.000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3457  PHP domain protein  26.05 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0443415  normal  0.146498 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1070  exopolysaccharide biosynthesis protein  31.58 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.145277  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1436  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.82 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0173771  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  28.14 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00492024  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1656  protein-tyrosine-phosphatase  30.14 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0435  capsular polysaccharide biosythesis protein, putative  32.66 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.115718 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1275  PHP-like phosphoesterase  27.46 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.227473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1972  PHP domain protein  28.96 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1671  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.95 
 
 		 268 aa  99.4  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.781877  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0943  capsular polysaccharide synthesis enzyme CapC  31.74 
 
 		 212 aa  97.8  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1386  phosphotransferase domain-containing protein  26.87 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.925309  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5288  Protein-tyrosine-phosphatase  32.52 
 
 		 255 aa  95.5  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2079  PHP domain protein  27.04 
 
 		 223 aa  91.7  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.376107 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2245  PHP domain protein  28.83 
 
 		 267 aa  91.3  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4733  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.5 
 
 		 255 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.693573  decreased coverage  0.0000431784 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3447  PHP domain protein  28.63 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.711695  normal  0.0108575 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0650  exopolysaccharide biosynthesis protein  26.22 
 
 		 239 aa  87.8  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.893314  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1341  protein-tyrosine phosphatase, putative  29.7 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3888  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.55 
 
 		 241 aa  81.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2446  PHP domain protein  28.36 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0184546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1074  PHP-like  24.68 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12780  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.76 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02476  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  29.38 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.936539  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1280  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.27 
 
 		 216 aa  52.8  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>