67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2980 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2980  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.5627  normal  0.0382977 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6139  major facilitator superfamily permease  84.21 
 
 		 426 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0287  major facilitator superfamily MFS_1  76.92 
 
 		 455 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  43.04 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  41.77 
 
 		 418 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  44.3 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  46.05 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  43.04 
 
 		 401 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  45.71 
 
 		 406 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  47.89 
 
 		 409 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  43.04 
 
 		 403 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  39.74 
 
 		 414 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6535  major facilitator transporter  45.07 
 
 		 402 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2382  hypothetical protein  40.51 
 
 		 387 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0566  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 415 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2064  major facilitator transporter  38.96 
 
 		 403 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  38.36 
 
 		 388 aa  51.2  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1461  major facilitator transporter  35.53 
 
 		 402 aa  49.7  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.609311  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  42.25 
 
 		 401 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0362  major facilitator transporter  43.48 
 
 		 407 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3701  hypothetical protein  41.56 
 
 		 222 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380934 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  40.85 
 
 		 420 aa  48.1  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2498  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 429 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1653  major facilitator transporter  38.67 
 
 		 388 aa  48.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5351  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.66 
 
 		 404 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3567  major facilitator transporter  42.25 
 
 		 402 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_709  permease of the major facilitator superfamily  40.85 
 
 		 420 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.768296  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3000  major facilitator superfamily transporter  42.25 
 
 		 397 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2770  major facilitator superfamily MFS_1  36.49 
 
 		 388 aa  47.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1824  major facilitator superfamily MFS_1  39.44 
 
 		 385 aa  47.8  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000433141  normal  0.0989924 
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  39.44 
 
 		 417 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3408  major facilitator transporter  40.51 
 
 		 402 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4108  major facilitator transporter  40.51 
 
 		 402 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4759  major facilitator transporter  40.51 
 
 		 402 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245052  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07690  major facilitator family transporter  39.13 
 
 		 404 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.632803  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 396 aa  47  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1766  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 364 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000930556 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0724  major facilitator transporter  44.93 
 
 		 404 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0594  major facilitator transporter  35.06 
 
 		 364 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00448971  hitchhiker  0.00000771738 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  39.24 
 
 		 406 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0616  major facilitator superfamily MFS_1  38.67 
 
 		 394 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0455  hypothetical protein  38.67 
 
 		 394 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  42.03 
 
 		 398 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  43.48 
 
 		 393 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0433  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 389 aa  44.3  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.174319  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1922  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 422 aa  44.7  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.356092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  37.8 
 
 		 392 aa  43.9  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0026  major facilitator transporter  41.33 
 
 		 411 aa  43.9  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1932  hypothetical protein  39.19 
 
 		 386 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.629328  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1675  major facilitator superfamily MFS_1  43.75 
 
 		 400 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4572  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 453 aa  42.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.359582 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3378  major facilitator transporter  39.13 
 
 		 400 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  40.58 
 
 		 404 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  40.58 
 
 		 405 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2080  major facilitator superfamily transporter  43.75 
 
 		 400 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.592815 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1714  major facilitator family transporter  38.89 
 
 		 402 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1563  major facilitator superfamily protein  38.89 
 
 		 402 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0750  major facilitator family transporter  38.89 
 
 		 402 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0810937  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1177  major facilitator transporter  35.06 
 
 		 399 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.670552 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1238  major facilitator superfamily protein  38.89 
 
 		 402 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1554  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 		 399 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0712  major facilitator superfamily protein  38.89 
 
 		 402 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0924904  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2435  major facilitator superfamily protein  38.89 
 
 		 446 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1163  major facilitator family transporter  38.89 
 
 		 446 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1445  hypothetical protein  39.13 
 
 		 400 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0604  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 393 aa  40.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1003  major facilitator transporter  37.1 
 
 		 370 aa  40  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>