More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1033 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1033  sulfatase domain-containing protein  100 
 
 		 662 aa  1361    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.198685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0854  sulfatase  26.68 
 
 		 672 aa  139  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0662  sulfatase  26.36 
 
 		 630 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0661  sulfatase  28 
 
 		 646 aa  120  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2507  sulfatase  25.82 
 
 		 873 aa  87.4  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0936334  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2056  hypothetical protein  26.96 
 
 		 695 aa  87.4  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.814835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1865  sulfatase  27.24 
 
 		 695 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4108  sulfatase  27.34 
 
 		 697 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1736  sulfatase  24.07 
 
 		 597 aa  84.7  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3562  sulfatase  24.87 
 
 		 682 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49659  predicted protein  25.71 
 
 		 629 aa  81.3  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1838  hypothetical protein  26.03 
 
 		 685 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.8565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1416  sulfatase  26.03 
 
 		 685 aa  80.5  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.934087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3872  sulfatase  25.82 
 
 		 685 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292904  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25880  Sulfatase protein  26.71 
 
 		 717 aa  79.7  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3632  sulfatase  25.19 
 
 		 662 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1447  sulfatase  27.99 
 
 		 690 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.189062 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42670  hypothetical protein  25.61 
 
 		 700 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02464  phosphoglycerol transferase  22.5 
 
 		 645 aa  78.2  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0432  phosphoglycerol transferase  24.3 
 
 		 653 aa  77.4  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.504655  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3581  hypothetical protein  25.26 
 
 		 700 aa  77.4  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.377432  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40416  predicted protein  24.46 
 
 		 700 aa  77.4  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0174  sulfatase  24.22 
 
 		 670 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3685  sulfatase  28.26 
 
 		 1009 aa  76.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0329595  hitchhiker  0.00309505 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1723  putative sulfatase  22.46 
 
 		 624 aa  73.9  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010962  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1118  sulfatase  25.72 
 
 		 628 aa  73.6  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4881  sulfatase  23.38 
 
 		 695 aa  73.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.652285 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3456  sulfatase  23.09 
 
 		 657 aa  72.4  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0154  sulfatase  25.36 
 
 		 656 aa  72  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0140  hypothetical protein  24.16 
 
 		 633 aa  71.6  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.597793  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003619  phosphoglycerol transferase I  22.2 
 
 		 649 aa  71.2  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878946  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0637  sulfatase  35.54 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5023  sulfatase  22.38 
 
 		 646 aa  70.9  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0910313  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0240  sulfatase  23.78 
 
 		 678 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2284  sulfatase  25.35 
 
 		 784 aa  68.9  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2475  sulfatase  24.61 
 
 		 652 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84195 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4586  hypothetical protein  23.1 
 
 		 641 aa  67.4  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445083  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1436  sulfatase  25.62 
 
 		 481 aa  67  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4201  sulfatase  23.12 
 
 		 654 aa  67  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000207245  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3884  sulfatase  24.33 
 
 		 654 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1979  sulfatase  23.15 
 
 		 663 aa  66.6  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4030  sulfatase  30.39 
 
 		 765 aa  66.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.868128  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2101  sulfatase  21.65 
 
 		 614 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.102341  normal  0.0551221 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0138  sulfatase  23.28 
 
 		 654 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000529062  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4333  sulfatase  23.28 
 
 		 654 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3808  sulfatase  24.64 
 
 		 654 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0237  sulfatase  26.92 
 
 		 447 aa  65.5  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.813396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4129  sulfatase  23.28 
 
 		 654 aa  65.5  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1399  sulfatase  22.02 
 
 		 670 aa  65.1  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0764  sulfatase  30.14 
 
 		 559 aa  64.7  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726055  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2974  hypothetical protein  26 
 
 		 550 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5561  sulfatase  32.03 
 
 		 797 aa  64.7  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1597  sulfatase  35.24 
 
 		 522 aa  64.7  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00665248 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3723  sulfatase  22.34 
 
 		 633 aa  64.3  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4628  sulfatase  24.77 
 
 		 660 aa  63.9  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1625  sulfatase  21.98 
 
 		 635 aa  63.9  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413884  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3618  sulfatase  23.08 
 
 		 633 aa  63.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3507  sulfatase  23.91 
 
 		 646 aa  63.5  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3211  sulfatase  23.94 
 
 		 612 aa  62.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139741  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3803  sulfatase  23.28 
 
 		 654 aa  62.4  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2203  sulfatase  20.87 
 
 		 736 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3340  sulfatase  26.53 
 
 		 540 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3253  sulfatase  30.33 
 
 		 1065 aa  62  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189767  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3047  lipid A phosphoethanolamine transferase  30.65 
 
 		 506 aa  61.6  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1074  sulfatase  34.78 
 
 		 552 aa  62  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0111181 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0165  sulfatase family protein  29.3 
 
 		 501 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  27.81 
 
 		 526 aa  61.6  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0062  sulfatase  23.57 
 
 		 629 aa  60.8  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000880147  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1708  sulfatase  22.89 
 
 		 449 aa  60.8  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2948  hypothetical protein  22.69 
 
 		 633 aa  60.8  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.146367  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  35.34 
 
 		 535 aa  60.8  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2716  sulfatase domain-containing protein  24.33 
 
 		 665 aa  60.1  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.324091  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2835  sulfatase  22.19 
 
 		 625 aa  60.1  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.181831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  23.18 
 
 		 474 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2695  sulfatase  22.18 
 
 		 486 aa  60.1  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000809096  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1915  sulfatase  24.38 
 
 		 654 aa  60.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256965  normal  0.471265 
 
 
-
 
NC_002950  PG1564  hypothetical protein  22.7 
 
 		 651 aa  59.3  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2021  hypothetical protein  24.46 
 
 		 643 aa  59.3  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.112326 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0064  sulfatase  29.3 
 
 		 502 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1100  sulfatase  23.19 
 
 		 609 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109677  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0526  sulfatase  21.25 
 
 		 633 aa  59.3  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2610  sulfatase  21.31 
 
 		 477 aa  59.3  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000218719  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  26.47 
 
 		 518 aa  59.3  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3858  sulfatase  24.3 
 
 		 647 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.499421  normal  0.910234 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1932  sulfatase  24.73 
 
 		 666 aa  58.5  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1069  sulfatase  20.95 
 
 		 641 aa  58.5  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0377  sulfatase  22.3 
 
 		 671 aa  58.5  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000264889  hitchhiker  0.0000000000000148489 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00380  choline sulfatase  27.22 
 
 		 503 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1775  sulfatase  25.73 
 
 		 587 aa  58.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.819016  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0445  sulfatase  24.11 
 
 		 611 aa  58.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  29.3 
 
 		 505 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  27.22 
 
 		 503 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0029  sulfatase  28.03 
 
 		 501 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0462  sulfatase, putative  27.59 
 
 		 520 aa  57.8  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1405  sulfatase  22.62 
 
 		 712 aa  57.4  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2135  sulfatase  22.75 
 
 		 429 aa  56.6  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4499  sulfatase  21.5 
 
 		 649 aa  57  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000368912 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0309  sulfatase  23.2 
 
 		 630 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1565  sulfatase  24.89 
 
 		 453 aa  57  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717098  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1725  sulfatase, putative  33.02 
 
 		 512 aa  56.6  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>