More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_90609 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_90609  Uridylate kinase (UK) (Uridine monophosphate kinase) (UMP kinase)  100 
 
 
290 aa  587  1e-167  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.66653  normal  0.342317 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04258  uridylate kinase Ura6 (AFU_orthologue; AFUA_7G03990)  60.39 
 
 
215 aa  251  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.36767 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00400  UMP-CMP kinase, putative  57.35 
 
 
275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0347693  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40028  predicted protein  52.69 
 
 
210 aa  192  5e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_6457  predicted protein  41.62 
 
 
196 aa  151  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0068  adenylate kinase  38.5 
 
 
200 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_002950  PG0791  adenylate kinase  41.25 
 
 
194 aa  127  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0266  hypothetical protein  36.27 
 
 
193 aa  125  1e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.500283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4092  adenylate kinase  34.22 
 
 
190 aa  121  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0490  adenylate kinase  38.92 
 
 
374 aa  117  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5094  adenylate kinase  32.65 
 
 
202 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0521  adenylate kinase  33.68 
 
 
185 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1863  adenylate kinase  35.29 
 
 
389 aa  113  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1110  adenylate kinase  32.98 
 
 
182 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0838  adenylate kinase  35.87 
 
 
195 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0420  adenylate kinase  35.67 
 
 
190 aa  109  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19841  adenylate kinase  31.91 
 
 
182 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.966566  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3003  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  29.44 
 
 
222 aa  106  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.192004  hitchhiker  0.00720085 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12436  predicted protein  32.24 
 
 
179 aa  105  6e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16591  adenylate kinase  33.33 
 
 
186 aa  105  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.761674  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  32.28 
 
 
205 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1140  adenylate kinase  32.21 
 
 
208 aa  104  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000592914  normal  0.025222 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23240  Adenylate kinase  29.33 
 
 
208 aa  104  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112414 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2598  adenylate kinase  33.69 
 
 
191 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.179524  normal  0.692202 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  31.05 
 
 
189 aa  103  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1164  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  27.85 
 
 
226 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000123796  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1774  adenylate kinase  32.8 
 
 
188 aa  102  9e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  0.285476 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  28.71 
 
 
213 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2886  adenylate kinase  31.02 
 
 
183 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.132721  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0286  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  30.37 
 
 
211 aa  101  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000626987  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0267  adenylate kinase  29.05 
 
 
211 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207515  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3381  adenylate kinase  31.87 
 
 
189 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0216  adenylate kinase  30.69 
 
 
187 aa  101  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23590  Adenylate kinase  29.41 
 
 
201 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0710  adenylate kinase  31.38 
 
 
184 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000807977  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0613  adenylate kinase  30.57 
 
 
191 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1635  adenylate kinase  32.09 
 
 
189 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205693  normal  0.0186532 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4005  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  27.73 
 
 
226 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000986709  hitchhiker  0.0000175975 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1912  adenylate kinase  29.38 
 
 
207 aa  99.4  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.298172  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2157  adenylate kinase  29.33 
 
 
208 aa  99.4  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140182  normal  0.776532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1937  adenylate kinase  31.05 
 
 
199 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.119403 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  28.5 
 
 
214 aa  98.6  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05570  adenylate kinase  33.92 
 
 
367 aa  98.2  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1631  adenylate kinase  29.1 
 
 
182 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1075  adenylate kinase  32.97 
 
 
181 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1047  adenylate kinase  32.97 
 
 
181 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275542  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23221  adenylate kinase  31.22 
 
 
182 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0615  adenylate kinase  28.04 
 
 
188 aa  98.2  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000660087  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0246  adenylate kinase  28.7 
 
 
213 aa  97.4  2e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0167  adenylate kinases  28.17 
 
 
228 aa  97.4  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0999685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1063  adenylate kinase  32.97 
 
 
181 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.67008  normal  0.276891 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17301  adenylate kinase  28.04 
 
 
182 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.853299  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3646  adenylate kinase  30.73 
 
 
367 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1148  adenylate kinase  30.85 
 
 
181 aa  97.1  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1311  adenylate kinase  29.26 
 
 
195 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165933  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3163  adenylate kinase  30.96 
 
 
360 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02588  adenylate kinase  31.52 
 
 
182 aa  96.3  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  27.57 
 
 
213 aa  95.9  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  27.78 
 
 
217 aa  95.5  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  28.97 
 
 
215 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0276  adenylate kinase  28.35 
 
 
193 aa  94.7  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0464579  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2312  adenylate kinase  27.7 
 
 
215 aa  95.1  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00140159  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  27.52 
 
 
217 aa  94.7  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3722  adenylate kinase  32.64 
 
 
187 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29530  Adenylate kinase  30.32 
 
 
194 aa  94.7  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.754676  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1974  adenylate kinase  30.48 
 
 
183 aa  94.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3685  adenylate kinase  34.76 
 
 
184 aa  94.7  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00243015  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2252  adenylate kinase  28.5 
 
 
215 aa  94.7  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0240  adenylate kinase  29.57 
 
 
187 aa  94.4  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17461  adenylate kinase  26.46 
 
 
182 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.520654  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0210  adenylate kinase  29.57 
 
 
187 aa  94  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.389912  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  28.97 
 
 
215 aa  94  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  28.97 
 
 
215 aa  94  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3396  adenylate kinase  33.75 
 
 
181 aa  94  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17211  adenylate kinase  25.93 
 
 
182 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0608  adenylate kinase  28.65 
 
 
195 aa  93.2  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207021  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  28.88 
 
 
187 aa  93.6  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2319  adenylate kinase  27.91 
 
 
217 aa  93.2  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.383145  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1846  adenylate kinase  28.65 
 
 
197 aa  93.2  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2316  adenylate kinase  29.95 
 
 
341 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210297  normal  0.170199 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1385  adenylate kinase  27.92 
 
 
206 aa  92.4  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.365572 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  27.1 
 
 
216 aa  92.4  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  29.08 
 
 
309 aa  92.4  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0676  adenylate kinase  25.7 
 
 
213 aa  92  9e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2993  adenylate kinase  28.72 
 
 
191 aa  91.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1886  adenylate kinase  28.37 
 
 
218 aa  91.7  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00135603  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0272  adenylate kinase  27.81 
 
 
186 aa  90.9  2e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  28.17 
 
 
217 aa  90.9  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0270  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  28.99 
 
 
211 aa  91.3  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16960  Adenylate kinase  30.65 
 
 
205 aa  90.5  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.466629  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1566  adenylate kinase  29.23 
 
 
208 aa  90.5  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0263556  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2380  adenylate kinase  28.04 
 
 
215 aa  90.5  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000961521  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2667  adenylate kinase  31.72 
 
 
192 aa  90.5  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12518  predicted protein  26.51 
 
 
240 aa  90.5  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.966257  normal  0.823549 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20660  Adenylate kinase  28.34 
 
 
193 aa  90.1  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.598531  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  26.64 
 
 
217 aa  89.7  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3122  adenylate kinase  30.32 
 
 
192 aa  89.4  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1234  adenylate kinase  28.11 
 
 
215 aa  89.4  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1736  adenylate kinase  26.98 
 
 
216 aa  89.4  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.353291 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  26.17 
 
 
213 aa  89.4  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>