More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12436 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_12436  predicted protein  100 
 
 
179 aa  365  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2667  adenylate kinase  37.2 
 
 
195 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90609  Uridylate kinase (UK) (Uridine monophosphate kinase) (UMP kinase)  32.24 
 
 
290 aa  106  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.66653  normal  0.342317 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0521  adenylate kinase  28.26 
 
 
185 aa  106  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1974  adenylate kinase  34.43 
 
 
183 aa  103  9e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17211  adenylate kinase  36.42 
 
 
182 aa  103  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0357  adenylate kinase  34.97 
 
 
183 aa  103  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.867099 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1635  adenylate kinase  33.89 
 
 
189 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205693  normal  0.0186532 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0420  adenylate kinase  32.97 
 
 
190 aa  103  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1846  adenylate kinase  35.48 
 
 
197 aa  102  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1631  adenylate kinase  35.19 
 
 
182 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17301  adenylate kinase  35.58 
 
 
182 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.853299  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  36.97 
 
 
205 aa  99.8  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1490  adenylate kinase  34.13 
 
 
227 aa  99.8  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480063  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23221  adenylate kinase  35.75 
 
 
182 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17461  adenylate kinase  34.36 
 
 
182 aa  99.8  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.520654  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05122  Adenylate kinase 1 (AK 1)(EC 2.7.4.3)(ATP-AMP transphosphorylase 1)(Adenylate kinase cytosolic and mitochondrial) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B2V8]  31.73 
 
 
259 aa  98.6  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40028  predicted protein  32.93 
 
 
210 aa  98.2  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04258  uridylate kinase Ura6 (AFU_orthologue; AFUA_7G03990)  31.05 
 
 
215 aa  97.4  9e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.36767 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  33.92 
 
 
187 aa  97.4  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02588  adenylate kinase  33.15 
 
 
182 aa  96.3  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1657  adenylate kinase  36.36 
 
 
194 aa  95.9  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1385  adenylate kinase  34.34 
 
 
206 aa  95.5  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.365572 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0559  adenylate kinase  36.13 
 
 
193 aa  95.1  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65737  Adenylate kinase (ATP-AMP transphosphorylase)  30.29 
 
 
249 aa  94.7  6e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0791  adenylate kinase  31.87 
 
 
194 aa  94.4  8e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00400  UMP-CMP kinase, putative  30.16 
 
 
275 aa  93.6  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0347693  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16591  adenylate kinase  35.88 
 
 
186 aa  94  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.761674  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  33.74 
 
 
309 aa  94  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1375  adenylate kinase  35.09 
 
 
193 aa  92.8  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465911  normal  0.134274 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0240  adenylate kinase  32.61 
 
 
187 aa  92.8  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03420  adenylate kinase, putative  29.33 
 
 
269 aa  92  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.621888  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0769  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  29.05 
 
 
215 aa  92  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.8085  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0276  adenylate kinase  32.12 
 
 
193 aa  92  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0464579  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4092  adenylate kinase  28.26 
 
 
190 aa  92  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0210  adenylate kinase  32.61 
 
 
187 aa  92  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.389912  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3554  adenylate kinase  31.73 
 
 
229 aa  92  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_87896  predicted protein  34.34 
 
 
229 aa  91.7  5e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3396  adenylate kinase  30.27 
 
 
181 aa  90.9  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2458  adenylate kinase  35.29 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1736  adenylate kinase  30.05 
 
 
217 aa  89.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0382  adenylate kinase  30.05 
 
 
217 aa  89.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1774  adenylate kinase  35 
 
 
188 aa  89.7  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  0.285476 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2180  adenylate kinase  35.29 
 
 
200 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.251193 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1110  adenylate kinase  32.73 
 
 
182 aa  89  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20093  kinase adenylate kinase  32.34 
 
 
316 aa  89.4  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  38.4 
 
 
219 aa  89  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19841  adenylate kinase  32.73 
 
 
182 aa  89  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.966566  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1566  adenylate kinase  33.13 
 
 
208 aa  89  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0263556  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0286  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  26.7 
 
 
211 aa  88.6  4e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000626987  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3685  adenylate kinase  29.89 
 
 
184 aa  88.6  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00243015  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2598  adenylate kinase  31.67 
 
 
191 aa  88.2  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.179524  normal  0.692202 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3163  adenylate kinase  31.74 
 
 
360 aa  88.2  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3646  adenylate kinase  31.74 
 
 
367 aa  88.2  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0306  adenylate kinase  28.71 
 
 
213 aa  87.8  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2886  adenylate kinase  30.81 
 
 
183 aa  87.8  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.132721  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0509  adenylate kinase  32.61 
 
 
229 aa  87.8  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.131893 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0781  adenylate kinase  30.61 
 
 
218 aa  87.8  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  27.67 
 
 
215 aa  87.4  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  28.5 
 
 
214 aa  87  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0613  adenylate kinase  35.53 
 
 
191 aa  87.4  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2513  adenylate kinase  29.51 
 
 
217 aa  87.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1148  adenylate kinase  34.05 
 
 
181 aa  87.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1112  adenylate kinase  27.23 
 
 
209 aa  86.3  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2213  adenylate kinase  31.52 
 
 
186 aa  86.3  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0838  adenylate kinase  34.87 
 
 
195 aa  86.3  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1164  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  31.41 
 
 
226 aa  86.3  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000123796  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3722  adenylate kinase  32.52 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2231  adenylate kinases  32.61 
 
 
229 aa  86.3  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603171  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2197  adenylate kinase  33.77 
 
 
200 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.56266  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1398  adenylate kinase  27.67 
 
 
214 aa  85.9  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0578  adenylate kinase  32.61 
 
 
217 aa  85.9  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1863  adenylate kinase  32.98 
 
 
389 aa  85.9  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0490  adenylate kinase  25 
 
 
374 aa  85.9  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  30.21 
 
 
215 aa  85.1  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  27.4 
 
 
215 aa  85.5  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  28.49 
 
 
214 aa  85.1  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1344  adenylate kinase  29.89 
 
 
213 aa  85.1  5e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1429  adenylate kinase  26.67 
 
 
218 aa  84.7  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  31.55 
 
 
217 aa  84.7  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2316  adenylate kinase  31.14 
 
 
341 aa  84.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210297  normal  0.170199 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1088  adenylate kinase  29.85 
 
 
215 aa  84.7  7e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.670242  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0068  adenylate kinase  29.03 
 
 
200 aa  84.7  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  30.69 
 
 
189 aa  84.3  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0118  adenylate kinase  29.1 
 
 
213 aa  84.3  8e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4005  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  32.09 
 
 
226 aa  84.3  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000986709  hitchhiker  0.0000175975 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00425  adenylate kinase  27.87 
 
 
214 aa  84.3  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3136  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  27.87 
 
 
214 aa  84.3  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.335837  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37399  predicted protein  27.73 
 
 
239 aa  84.3  9e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.889133  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0406  adenylate kinase  27.87 
 
 
214 aa  84.3  9e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.395771  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0518  adenylate kinase  27.87 
 
 
214 aa  84.3  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0222194  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0551  adenylate kinase  27.87 
 
 
214 aa  84.3  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0980412  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0566  adenylate kinase  27.87 
 
 
234 aa  84  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0567733  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0513  adenylate kinase  27.87 
 
 
214 aa  84.3  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00430  hypothetical protein  27.87 
 
 
214 aa  84.3  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1273  adenylate kinase  39.67 
 
 
217 aa  84.3  9e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3142  adenylate kinase  27.87 
 
 
214 aa  84.3  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.207455  normal  0.0239561 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0539  adenylate kinase  27.87 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.263643  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0550  adenylate kinase  27.87 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.186562  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1139  adenylate kinase  27.87 
 
 
214 aa  84  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.498003  unclonable  0.0000000226015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>