More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_85379 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00858  heat shock protein (Eurofung)  51.66 
 
 		 927 aa  902    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.529866  normal  0.100345 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02482  protein disaggregation chaperone  46.1 
 
 		 857 aa  716    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000328184  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1080  ATP-dependent chaperone ClpB  46.1 
 
 		 857 aa  716    Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000145981  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0658  ClpB protein  48.14 
 
 		 865 aa  701    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0625  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  45.3 
 
 		 854 aa  675    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0977659  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1118  clpB protein  42.94 
 
 		 863 aa  660    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2327  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  44.65 
 
 		 859 aa  681    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3106  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  45.6 
 
 		 859 aa  696    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652443  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1335  ATP-dependent protease  45.72 
 
 		 862 aa  706    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.255547  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1287  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  43.61 
 
 		 866 aa  687    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3913  ATP-dependent chaperone protein ClpB  42.79 
 
 		 861 aa  681    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1864  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  45.83 
 
 		 874 aa  729    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3577  clpB protein  43.74 
 
 		 857 aa  674    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0829  clpB protein  44.88 
 
 		 854 aa  674    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1090  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpB  43.61 
 
 		 866 aa  689    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.930784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1072  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  43.61 
 
 		 866 aa  689    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1066  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  43.73 
 
 		 866 aa  680    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.226662  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1377  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  45.49 
 
 		 865 aa  714    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  45.76 
 
 		 858 aa  718    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  45.88 
 
 		 858 aa  719    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02830  heat shock protein, putative  49.21 
 
 		 898 aa  803    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0754568  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0728  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:Clp, N terminal  44.52 
 
 		 854 aa  669    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0823  putative chaperonin clpA/B  45.72 
 
 		 865 aa  694    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00549001 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2727  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  44.94 
 
 		 863 aa  700    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.286656  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0200  ATPase  44.48 
 
 		 867 aa  671    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.371355  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0016  ATPase  42.67 
 
 		 863 aa  679    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1980  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  45.94 
 
 		 862 aa  702    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.192819  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0645  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  42.19 
 
 		 857 aa  661    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0815  ClpB protein  44.7 
 
 		 859 aa  667    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0589  AAA ATPase  45.8 
 
 		 891 aa  723    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.917819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0132  ATPase  44.53 
 
 		 873 aa  702    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0140  ATPase  43.23 
 
 		 876 aa  696    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.182889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2335  ATPase  44.07 
 
 		 872 aa  710    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2389  ClpB heat-shock protein  45.6 
 
 		 865 aa  716    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2381  ATP-dependent Clp protease  44.2 
 
 		 865 aa  694    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4834  chaperone clpB  44.58 
 
 		 854 aa  674    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0201945  normal  0.188995 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1408  chaperone ClpB  45.24 
 
 		 870 aa  695    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0359  heat shock protein ClpB-like  42.06 
 
 		 872 aa  661    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5148  AAA ATPase, ClpB  45.25 
 
 		 865 aa  709    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.830586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0911  ATPase  44.82 
 
 		 862 aa  712    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1007  ATPase  45.83 
 
 		 862 aa  712    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.783787 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2851  AAA ATPase  45.49 
 
 		 864 aa  688    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000473406  hitchhiker  0.00000000124432 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1661  ATPase  43.43 
 
 		 863 aa  659    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0414  AAA ATPase  44.53 
 
 		 854 aa  695    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.817995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1177  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpB  43.61 
 
 		 866 aa  689    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1089  ATPase  43.8 
 
 		 883 aa  704    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000277828 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1541  ATPase with chaperone activity  45.99 
 
 		 869 aa  705    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0753  chaperone clpB  46.24 
 
 		 870 aa  722    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2205  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  45.36 
 
 		 865 aa  714    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.489947  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4356  ATPase AAA-2  43.49 
 
 		 869 aa  660    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.508325 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4247  AAA_5 ATPase  45.77 
 
 		 879 aa  723    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0997657  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2824  AAA ATPase, central region  45.25 
 
 		 859 aa  713    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.553525  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0119  ClpB protein  44.73 
 
 		 854 aa  675    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0367  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  42.38 
 
 		 857 aa  674    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3987  ATPase AAA-2  46.31 
 
 		 871 aa  733    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598394  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1919  ATPase AAA-2  46.36 
 
 		 870 aa  714    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.494579  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2548  ClpB protein  43.08 
 
 		 876 aa  665    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184883 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4277  ATPase AAA-2  45.81 
 
 		 879 aa  715    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345892  normal  0.036292 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2198  ATPase AAA-2  45.22 
 
 		 861 aa  708    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.105301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2201  ATPase AAA-2  45.11 
 
 		 866 aa  711    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.755667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2374  heat-shock protein, chaperone ClpB  44.52 
 
 		 865 aa  697    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0849473  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2861  ATPase AAA-2  43.52 
 
 		 862 aa  669    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.133285  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2199  ATPase AAA-2  42.95 
 
 		 869 aa  668    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0278692  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4095  ATPase AAA-2  46.09 
 
 		 879 aa  711    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0499  ATPase AAA-2  45.96 
 
 		 860 aa  706    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333931  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0681  ATPase AAA-2  45.51 
 
 		 878 aa  714    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.310186  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0841  ATPase AAA-2  45.49 
 
 		 865 aa  692    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1959  ATPase AAA-2  45.35 
 
 		 862 aa  698    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0199054  normal  0.312929 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0194  ATP-dependent chaperone protein ClpB  43.02 
 
 		 862 aa  664    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.68228  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4765  ATPase AAA-2  45.44 
 
 		 878 aa  713    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000533628  normal  0.0145469 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0130  ATPase AAA-2  46.33 
 
 		 872 aa  707    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0581017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0406  ATPase AAA-2  45.39 
 
 		 862 aa  719    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2391  ATPase AAA-2  45.76 
 
 		 859 aa  715    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6232  ATPase AAA-2  45.24 
 
 		 865 aa  707    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0478  ATPase AAA-2  45.22 
 
 		 848 aa  711    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1337  ATPase AAA-2  42.71 
 
 		 858 aa  682    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184939  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2996  ATPase AAA-2  46.48 
 
 		 891 aa  706    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3123  heat shock protein  42.34 
 
 		 871 aa  668    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1681  clpB protein  43.28 
 
 		 866 aa  666    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1416  clpB protein  43.28 
 
 		 866 aa  660    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0199  ATP-dependent Clp protease, subunit B  45.5 
 
 		 856 aa  700    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0543  ATPase AAA-2  44.43 
 
 		 870 aa  714    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0110246  normal  0.574025 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2991  ATPase  43.86 
 
 		 857 aa  674    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00302942  normal  0.61786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3072  ATPase  43.86 
 
 		 857 aa  674    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0239882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2558  ATPase  45.6 
 
 		 864 aa  711    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.111038  hitchhiker  0.00562869 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0669  ATPase  43.45 
 
 		 865 aa  677    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0949399  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0493  ATPase  44.46 
 
 		 864 aa  667    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0650  ATPase  47.01 
 
 		 868 aa  725    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.557806 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1785  ATPase  45.24 
 
 		 865 aa  707    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60190  clpB protein  44.83 
 
 		 854 aa  694    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00250267  hitchhiker  0.00000000231015 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3740  ATPase  43.17 
 
 		 889 aa  663    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1847  ATPase  45.24 
 
 		 865 aa  707    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0263  ATPase  42.27 
 
 		 873 aa  659    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.602009  normal  0.916411 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3169  ATPase  43.86 
 
 		 857 aa  674    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00027679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2119  ATPase  45.91 
 
 		 864 aa  686    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299274  normal  0.0630262 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1737  ATPase  42.62 
 
 		 873 aa  665    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0062  ATPase  45.35 
 
 		 875 aa  739    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4357  ATPase  45.85 
 
 		 866 aa  709    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.427241  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2603  clpB protein  44.21 
 
 		 857 aa  683    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0399134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0489  ATPase  45.22 
 
 		 848 aa  711    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.506887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>