260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_76018 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_76018  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex 9  100 
 
 
386 aa  799    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10440  NADH-ubiquinone oxidoreductase 39 kDa subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12790)  46.35 
 
 
382 aa  307  2.0000000000000002e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00432444  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01070  NADH dehydrogenase (ubiquinone), putative  41.28 
 
 
411 aa  231  2e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26150  predicted protein  34.55 
 
 
366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.22468 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17671  predicted protein  29.58 
 
 
397 aa  147  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.659794  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0016  3-beta-hydroxy-delta(5)-steroid dehydrogenase  31.23 
 
 
340 aa  145  9e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 
326 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3590  ubiquinone dependent NADH dehydrogenase  32.6 
 
 
327 aa  136  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885976  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0107  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.99 
 
 
308 aa  132  9e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1308  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  33.59 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.38 
 
 
326 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2820  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.56 
 
 
329 aa  123  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0203208  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.6 
 
 
321 aa  122  9e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0386  NADH-ubiquinone oxidoreductase family protein  29.07 
 
 
340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1668  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  32.15 
 
 
316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.28 
 
 
321 aa  116  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  normal  0.481083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0046  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  33.23 
 
 
321 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3538  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  30.72 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0035  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putativ  30 
 
 
320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0246  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.99 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.46 
 
 
381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1129  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  28.09 
 
 
316 aa  113  5e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.5 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2136  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.09 
 
 
312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.13 
 
 
330 aa  112  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0755  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  32.21 
 
 
389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3602  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 
323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.692612  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0343  NADH-ubiquinone oxidoreductase  31.45 
 
 
325 aa  109  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00306764  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.3 
 
 
353 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1691  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  32.38 
 
 
328 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0053937  hitchhiker  0.000000612217 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0437  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.31 
 
 
349 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2776  NADH dehydrogenase  28.62 
 
 
328 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.424947  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0063  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase,-like protein  28.75 
 
 
320 aa  105  1e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1151  NADH-ubiquinone oxidoreductase  28.93 
 
 
328 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.93 
 
 
328 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.626398  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1318  NADH dehydrogenase  32.37 
 
 
389 aa  104  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1041  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  26.88 
 
 
328 aa  103  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0980  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase  27.19 
 
 
328 aa  103  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1007  NADH dehydrogenase  31.9 
 
 
389 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0332  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  27.44 
 
 
307 aa  102  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.171865  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.54 
 
 
322 aa  102  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.922509  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0173  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.88 
 
 
321 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3910  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 
318 aa  99.8  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.835741  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4953  NADH dehydrogenase  26.01 
 
 
318 aa  99.8  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0660  dehydrogenase  29.25 
 
 
321 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.84 
 
 
320 aa  96.7  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.07 
 
 
291 aa  95.1  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2240  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  28.26 
 
 
381 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167528  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1353  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  26.15 
 
 
332 aa  94.7  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1049  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  28.4 
 
 
412 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.77 
 
 
318 aa  94.4  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.62 
 
 
294 aa  93.6  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4134  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  27.08 
 
 
320 aa  93.6  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.96 
 
 
318 aa  92.8  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.826321  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3081  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.86 
 
 
310 aa  92.8  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0224  hypothetical protein  30.74 
 
 
322 aa  91.3  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.362913  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 
309 aa  90.5  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2899  NADH dehydrogenase  29.63 
 
 
318 aa  89.7  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328837  normal  0.117785 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0152  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  29.28 
 
 
335 aa  89.4  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274944 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 
287 aa  89.4  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000016396  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 
294 aa  88.6  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2361  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.19 
 
 
345 aa  87.4  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.252137 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3737  NADH dehydrogenase  27.56 
 
 
317 aa  87  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.288709  normal  0.886457 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.87 
 
 
295 aa  86.7  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.44 
 
 
298 aa  86.3  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0110  NADH dehydrogenase  28.62 
 
 
321 aa  85.9  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0199  hypothetical protein  28.24 
 
 
317 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0390  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.71 
 
 
320 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.31 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.665439  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0963  male sterility protein  23.79 
 
 
338 aa  82.8  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.79 
 
 
338 aa  82.8  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2450  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
312 aa  82.8  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270425 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0661  NADH dehydrogenase  31.11 
 
 
312 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.251745  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  26.37 
 
 
297 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0234  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  29.18 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.85 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0177  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.440205 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.57 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.74 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.17 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.75 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0270  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.73 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2107  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase  27.73 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3363  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase  27.73 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2985  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase  27.73 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.68 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.563899 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.73 
 
 
320 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3276  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.82 
 
 
298 aa  77  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.18 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 
320 aa  76.3  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0455  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.73 
 
 
319 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
319 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
319 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3052  NADH dehydrogenase  27.48 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0275567 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3315  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  27.53 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.03 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851831  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3340  NADH dehydrogenase  26.81 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3663  NADH dehydrogenase  26.81 
 
 
334 aa  73.2  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>