More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0661 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0661  NADH dehydrogenase  100 
 
 		 312 aa  614  1e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.251745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2136  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  62.21 
 
 		 312 aa  342  4e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3081  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.72 
 
 		 310 aa  298  7e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1151  NADH-ubiquinone oxidoreductase  50.16 
 
 		 328 aa  271  7e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.16 
 
 		 328 aa  271  7e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.626398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2820  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  45.99 
 
 		 329 aa  261  8e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0203208  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2776  NADH dehydrogenase  47.96 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.424947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.77 
 
 		 321 aa  252  6e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  normal  0.481083 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.31 
 
 		 326 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0046  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  47.48 
 
 		 321 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0755  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  47.53 
 
 		 389 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0016  3-beta-hydroxy-delta(5)-steroid dehydrogenase  45.17 
 
 		 340 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3590  ubiquinone dependent NADH dehydrogenase  44.1 
 
 		 327 aa  244  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.06 
 
 		 326 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1308  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  45.12 
 
 		 336 aa  242  6e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3538  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  44.69 
 
 		 326 aa  242  7e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.06 
 
 		 381 aa  241  9e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1691  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  50.16 
 
 		 328 aa  240  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0053937  hitchhiker  0.000000612217 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1668  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  50.49 
 
 		 316 aa  238  8e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1007  NADH dehydrogenase  47.53 
 
 		 389 aa  236  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1318  NADH dehydrogenase  47.38 
 
 		 389 aa  235  9e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.22 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1041  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  42.68 
 
 		 328 aa  232  5e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0980  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase  42.9 
 
 		 328 aa  232  5e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3602  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.25 
 
 		 323 aa  231  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.692612  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2240  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  49.69 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167528  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0246  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  42.9 
 
 		 327 aa  229  4e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0152  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  47.09 
 
 		 335 aa  227  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274944 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.15 
 
 		 321 aa  226  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0660  dehydrogenase  44.97 
 
 		 321 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.92 
 
 		 353 aa  222  7e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0173  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  45.43 
 
 		 321 aa  222  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0343  NADH-ubiquinone oxidoreductase  46.88 
 
 		 325 aa  221  9e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00306764  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0332  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  45.03 
 
 		 307 aa  219  5e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.171865  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4953  NADH dehydrogenase  43.54 
 
 		 318 aa  215  8e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1049  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  43.21 
 
 		 412 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.25 
 
 		 322 aa  210  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.922509  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0437  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.76 
 
 		 349 aa  205  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.66 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0224  hypothetical protein  46.39 
 
 		 322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.362913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0107  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.72 
 
 		 308 aa  199  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3737  NADH dehydrogenase  39.42 
 
 		 317 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.288709  normal  0.886457 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0199  hypothetical protein  39.42 
 
 		 317 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2450  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.31 
 
 		 312 aa  189  4e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2899  NADH dehydrogenase  37.82 
 
 		 318 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328837  normal  0.117785 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.67 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.826321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3910  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.33 
 
 		 318 aa  183  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.835741  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1353  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.78 
 
 		 332 aa  183  3e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1129  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  32.81 
 
 		 316 aa  182  9.000000000000001e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.5 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.85 
 
 		 319 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0110  NADH dehydrogenase  40.52 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3052  NADH dehydrogenase  38.85 
 
 		 319 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275567 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0035  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putativ  32.7 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0963  male sterility protein  35.42 
 
 		 338 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.42 
 
 		 338 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.42 
 
 		 314 aa  176  5e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.02 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.02 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 		 319 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.563899 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0063  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase,-like protein  31.55 
 
 		 320 aa  171  1e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4134  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  35.13 
 
 		 320 aa  169  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.18 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2944  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  39.02 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3340  NADH dehydrogenase  37.42 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3663  NADH dehydrogenase  37.42 
 
 		 334 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.25 
 
 		 298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3296  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  39 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.587332  normal  0.308743 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.46 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.69 
 
 		 319 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0087  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase protein  37.35 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0390  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.66 
 
 		 320 aa  159  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0234  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  39.22 
 
 		 319 aa  159  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2361  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.3 
 
 		 345 aa  159  8e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.252137 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.41 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.42 
 
 		 320 aa  157  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0386  NADH-ubiquinone oxidoreductase family protein  34.52 
 
 		 340 aa  155  8e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.05 
 
 		 309 aa  155  9e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2107  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase  38.69 
 
 		 319 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2985  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase  38.69 
 
 		 319 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3363  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase  38.69 
 
 		 319 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0270  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  38.69 
 
 		 319 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3315  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  38.94 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  38.69 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3276  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26150  predicted protein  37 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.22468 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.39 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.665439  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0177  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.28 
 
 		 340 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.440205 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0455  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  38.69 
 
 		 319 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0220  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.91 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.88 
 
 		 296 aa  149  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01070  NADH dehydrogenase (ubiquinone), putative  38.74 
 
 		 411 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.89 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270425 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.91 
 
 		 294 aa  146  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.88 
 
 		 306 aa  145  6e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02430  conserved hypothetical protein  36.17 
 
 		 375 aa  145  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000237678  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.51 
 
 		 306 aa  143  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.73 
 
 		 296 aa  144  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76018  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex 9  32.31 
 
 		 386 aa  133  5e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 		 295 aa  133  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>