75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1252 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1252  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  465  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000565892  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3084  protein of unknown function DUF554  95.8 
 
 		 238 aa  448  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00111761  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2899  protein of unknown function DUF554  81.09 
 
 		 239 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000109146  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1160  protein of unknown function DUF554  80.25 
 
 		 238 aa  388  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3291  YqgA  45.15 
 
 		 235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0414199 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3460  hypothetical protein  45.15 
 
 		 235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.321568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3365  hypothetical protein  45.15 
 
 		 235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.647996  normal  0.509414 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3280  YqgA  45.15 
 
 		 235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3357  hypothetical protein  45.15 
 
 		 235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.930348 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3381  hypothetical protein  43.88 
 
 		 237 aa  192  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4001 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2560  protein of unknown function DUF554  35.59 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000206819  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4270  hypothetical protein  47.28 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.268165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3127  hypothetical protein  46.86 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3312  hypothetical protein  46.86 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571271  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0748  hypothetical protein  46.86 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0529189 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02796  predicted inner membrane protein  46.86 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00140908  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02759  hypothetical protein  46.86 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00129663  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0729  protein of unknown function DUF554  46.86 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3401  hypothetical protein  45.57 
 
 		 235 aa  155  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.403767  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0492  protein of unknown function DUF554  35.17 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.1131  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3019  hypothetical protein  30.21 
 
 		 290 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0722  hypothetical protein  31.76 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000147009  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0698  hypothetical protein  31.76 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570585  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3319  hypothetical protein  30.08 
 
 		 232 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2939  protein of unknown function DUF554  30.08 
 
 		 234 aa  106  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2513  hypothetical protein  29.06 
 
 		 226 aa  105  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0134252 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0507  hypothetical protein  28.82 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378382  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2254  protein of unknown function DUF554  28 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.376452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4952  protein of unknown function DUF554  26.84 
 
 		 229 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000963174  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1278  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.856375  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0371  hypothetical protein  30.48 
 
 		 224 aa  102  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.131027  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1541  protein of unknown function DUF554  27.11 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.766682  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0469  hypothetical protein  31.36 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000429599  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2621  protein of unknown function DUF554  28.63 
 
 		 245 aa  95.5  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101879  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1140  hypothetical protein  27.83 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0848  hypothetical protein  29.63 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23500  uncharacterized membrane protein, possible Na+ channel or pump  26.96 
 
 		 227 aa  93.6  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000125984  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3423  protein of unknown function DUF554  29.26 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1857  hypothetical protein  27.83 
 
 		 238 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2488  hypothetical protein  26.41 
 
 		 228 aa  88.6  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000155229  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1941  hypothetical protein  27.31 
 
 		 238 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1448  hypothetical protein  28.81 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0567223  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3485  hypothetical protein  26.89 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1697  hypothetical protein  26.89 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3049  protein of unknown function DUF554  28.25 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.076823 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1972  hypothetical protein  26.52 
 
 		 238 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0575  hypothetical protein  30.18 
 
 		 221 aa  85.9  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.942908  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1714  hypothetical protein  26.52 
 
 		 239 aa  85.9  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1184  hypothetical protein  25.66 
 
 		 228 aa  85.5  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0168554  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1672  hypothetical protein  26.78 
 
 		 238 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1894  hypothetical protein  26.36 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1856  hypothetical protein  26.36 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1720  hypothetical protein  26.36 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2145  protein of unknown function DUF554  25.56 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1691  protein of unknown function DUF554  30.49 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0259  protein of unknown function DUF554  28.76 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000129355 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0947  protein of unknown function DUF554  24.55 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1389  hypothetical protein  28.44 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766809  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0274  protein of unknown function DUF554  27.9 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.637934  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3009  hypothetical protein  28.69 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1507  protein of unknown function DUF554  28.45 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.749554  normal  0.0994454 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0758  hypothetical protein  25.75 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2831  protein of unknown function DUF554  22.49 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1187  hypothetical protein  29.14 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.724078  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2283  hypothetical protein  23.4 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.452521  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0811  hypothetical protein  23.97 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3832  hypothetical protein  29.38 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000789065  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2078  protein of unknown function DUF554  25.93 
 
 		 233 aa  62  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00110  uncharacterized membrane protein, possible Na+ channel or pump  29.32 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1536  hypothetical protein  23.29 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20890  uncharacterized membrane protein, possible Na+ channel or pump  30.3 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2324  hypothetical protein  26.45 
 
 		 251 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1628  protein of unknown function DUF554  27.66 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0471  protein of unknown function DUF554  19.83 
 
 		 226 aa  49.3  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1546  protein of unknown function DUF554  29.6 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>