75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00110 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_00110  uncharacterized membrane protein, possible Na+ channel or pump  100 
 
 
241 aa  461  1e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0811  hypothetical protein  45.89 
 
 
238 aa  219  1.9999999999999999e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2621  protein of unknown function DUF554  40.98 
 
 
245 aa  160  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101879  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2254  protein of unknown function DUF554  38.53 
 
 
235 aa  161  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.376452  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0507  hypothetical protein  35.93 
 
 
231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378382  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3319  hypothetical protein  34.33 
 
 
232 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4952  protein of unknown function DUF554  34.21 
 
 
229 aa  137  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000963174  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0848  hypothetical protein  36.36 
 
 
229 aa  135  5e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1941  hypothetical protein  35.06 
 
 
238 aa  133  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1672  hypothetical protein  35.34 
 
 
238 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23500  uncharacterized membrane protein, possible Na+ channel or pump  31.9 
 
 
227 aa  133  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000125984  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1541  protein of unknown function DUF554  33.04 
 
 
224 aa  132  6e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.766682  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1972  hypothetical protein  35.34 
 
 
238 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1720  hypothetical protein  34.91 
 
 
238 aa  131  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1856  hypothetical protein  34.91 
 
 
238 aa  131  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1894  hypothetical protein  34.48 
 
 
238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1697  hypothetical protein  34.91 
 
 
238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1857  hypothetical protein  34.91 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3485  hypothetical protein  34.2 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2939  protein of unknown function DUF554  33.91 
 
 
234 aa  129  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3423  protein of unknown function DUF554  36.36 
 
 
233 aa  128  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3049  protein of unknown function DUF554  34.76 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.076823 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1714  hypothetical protein  34.91 
 
 
239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2513  hypothetical protein  32.76 
 
 
226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0134252 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1278  hypothetical protein  37.67 
 
 
229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.856375  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1448  hypothetical protein  31.17 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0567223  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2488  hypothetical protein  28.94 
 
 
228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000155229  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2078  protein of unknown function DUF554  32.6 
 
 
233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0274  protein of unknown function DUF554  36.48 
 
 
228 aa  118  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.637934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0259  protein of unknown function DUF554  35.19 
 
 
228 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000129355 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1184  hypothetical protein  30.34 
 
 
228 aa  111  9e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0168554  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1507  protein of unknown function DUF554  32.77 
 
 
232 aa  110  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.749554  normal  0.0994454 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2324  hypothetical protein  34.85 
 
 
251 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3009  hypothetical protein  29.71 
 
 
248 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0371  hypothetical protein  36.22 
 
 
224 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.131027  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0758  hypothetical protein  34.33 
 
 
228 aa  105  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0469  hypothetical protein  29.33 
 
 
231 aa  102  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000429599  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2831  protein of unknown function DUF554  30.69 
 
 
228 aa  102  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1691  protein of unknown function DUF554  32.76 
 
 
243 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2145  protein of unknown function DUF554  28.69 
 
 
225 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0947  protein of unknown function DUF554  26.36 
 
 
232 aa  100  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1628  protein of unknown function DUF554  34.85 
 
 
251 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1140  hypothetical protein  26.96 
 
 
230 aa  99  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1389  hypothetical protein  31 
 
 
232 aa  97.8  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766809  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1546  protein of unknown function DUF554  34.44 
 
 
251 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1187  hypothetical protein  32.81 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.724078  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3357  hypothetical protein  27.59 
 
 
235 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.930348 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3365  hypothetical protein  27.59 
 
 
235 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.647996  normal  0.509414 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3460  hypothetical protein  27.59 
 
 
235 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.321568  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3280  YqgA  27.59 
 
 
235 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3291  YqgA  27.59 
 
 
235 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0414199 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1536  hypothetical protein  32.16 
 
 
222 aa  86.3  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0722  hypothetical protein  27.16 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000147009  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0698  hypothetical protein  27.16 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570585  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0471  protein of unknown function DUF554  27.27 
 
 
226 aa  80.9  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2283  hypothetical protein  28.81 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.452521  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2560  protein of unknown function DUF554  30.12 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000206819  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0575  hypothetical protein  27.52 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.942908  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3832  hypothetical protein  31.67 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000789065  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3084  protein of unknown function DUF554  25.96 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00111761  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3381  hypothetical protein  27.43 
 
 
237 aa  71.6  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4001 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1312  hypothetical protein  29.92 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.300217  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20890  uncharacterized membrane protein, possible Na+ channel or pump  28.84 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38155  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1252  hypothetical protein  24.68 
 
 
238 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000565892  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2899  protein of unknown function DUF554  26.05 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000109146  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1160  protein of unknown function DUF554  25.63 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02796  predicted inner membrane protein  30 
 
 
235 aa  57  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00140908  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02759  hypothetical protein  30 
 
 
235 aa  57  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00129663  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0492  protein of unknown function DUF554  25.41 
 
 
233 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.1131  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3127  hypothetical protein  30 
 
 
235 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3312  hypothetical protein  29.38 
 
 
235 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571271  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0748  hypothetical protein  29.38 
 
 
235 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0529189 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3401  hypothetical protein  29.38 
 
 
235 aa  55.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.403767  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4270  hypothetical protein  29.38 
 
 
235 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.268165  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0729  protein of unknown function DUF554  29.38 
 
 
235 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>