61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_3019 on replicon NC_008741
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008741  Dvul_3019  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  568  1e-161  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3357  hypothetical protein  32.04 
 
 
235 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.930348 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3460  hypothetical protein  32.04 
 
 
235 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.321568  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3280  YqgA  32.04 
 
 
235 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3365  hypothetical protein  32.04 
 
 
235 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.647996  normal  0.509414 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3291  YqgA  32.04 
 
 
235 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0414199 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3084  protein of unknown function DUF554  30.9 
 
 
238 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00111761  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0492  protein of unknown function DUF554  29.51 
 
 
233 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.1131  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1252  hypothetical protein  30.9 
 
 
238 aa  136  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000565892  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3381  hypothetical protein  32.4 
 
 
237 aa  132  9e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4001 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2899  protein of unknown function DUF554  29.86 
 
 
239 aa  130  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000109146  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1160  protein of unknown function DUF554  29.86 
 
 
238 aa  125  9e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2560  protein of unknown function DUF554  28.17 
 
 
236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000206819  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4270  hypothetical protein  32.98 
 
 
235 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.268165  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3127  hypothetical protein  33.33 
 
 
235 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02759  hypothetical protein  32.98 
 
 
235 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00129663  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02796  predicted inner membrane protein  32.98 
 
 
235 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00140908  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3401  hypothetical protein  32.98 
 
 
235 aa  99.8  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.403767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3312  hypothetical protein  32.98 
 
 
235 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571271  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0748  hypothetical protein  32.98 
 
 
235 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0529189 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0729  protein of unknown function DUF554  32.98 
 
 
235 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3319  hypothetical protein  22.92 
 
 
232 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2254  protein of unknown function DUF554  22.83 
 
 
235 aa  65.1  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.376452  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0848  hypothetical protein  32.5 
 
 
229 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0274  protein of unknown function DUF554  32.82 
 
 
228 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.637934  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2939  protein of unknown function DUF554  30.6 
 
 
234 aa  64.3  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3049  protein of unknown function DUF554  30.77 
 
 
228 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.076823 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4952  protein of unknown function DUF554  29.03 
 
 
229 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000963174  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0259  protein of unknown function DUF554  31.3 
 
 
228 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000129355 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1184  hypothetical protein  30.71 
 
 
228 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0168554  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1140  hypothetical protein  28.93 
 
 
230 aa  59.7  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1541  protein of unknown function DUF554  21.74 
 
 
224 aa  57  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.766682  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2488  hypothetical protein  30.83 
 
 
228 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000155229  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2283  hypothetical protein  32.33 
 
 
247 aa  56.6  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.452521  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0507  hypothetical protein  29.6 
 
 
231 aa  56.2  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378382  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2513  hypothetical protein  25.98 
 
 
226 aa  55.8  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0134252 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23500  uncharacterized membrane protein, possible Na+ channel or pump  21.18 
 
 
227 aa  54.7  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000125984  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2145  protein of unknown function DUF554  31.82 
 
 
225 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1278  hypothetical protein  28.46 
 
 
229 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.856375  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0698  hypothetical protein  26.83 
 
 
224 aa  53.9  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0722  hypothetical protein  26.83 
 
 
224 aa  53.9  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000147009  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0371  hypothetical protein  38.64 
 
 
224 aa  53.1  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.131027  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3423  protein of unknown function DUF554  28.89 
 
 
233 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0469  hypothetical protein  32.41 
 
 
231 aa  51.6  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000429599  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2621  protein of unknown function DUF554  22.41 
 
 
245 aa  49.7  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101879  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2831  protein of unknown function DUF554  24.79 
 
 
228 aa  49.3  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1507  protein of unknown function DUF554  24.17 
 
 
232 aa  48.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.749554  normal  0.0994454 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1857  hypothetical protein  29.01 
 
 
238 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3485  hypothetical protein  29.01 
 
 
238 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1187  hypothetical protein  25.99 
 
 
259 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.724078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1672  hypothetical protein  28.24 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1697  hypothetical protein  29.29 
 
 
238 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1941  hypothetical protein  28.24 
 
 
238 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1448  hypothetical protein  24.82 
 
 
239 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0567223  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1714  hypothetical protein  22.48 
 
 
239 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1894  hypothetical protein  27.48 
 
 
238 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1972  hypothetical protein  27.48 
 
 
238 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1720  hypothetical protein  27.48 
 
 
238 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1856  hypothetical protein  27.48 
 
 
238 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0758  hypothetical protein  25.62 
 
 
228 aa  42.7  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1691  protein of unknown function DUF554  28.93 
 
 
243 aa  42.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>